Re: [R-br] Extração de Dados do SUS
Prezados, Como Tura, uso os dados do DATASUS há muitos anos. Não encontrei nada melhor do que manter uma cópia dos dados em sua máquina e extrair os dados de interesse direto dos DBC. Isso porque as bases não são muito uniformes e as correções nos scripts são relativamente frequentes. Apesar do trabalho maravilhoso que o DATASUS faz nas bases, pois seria um verdadeiro pesadelo usar os dados verdadeiramente crus. Já os dados individualizados não são exatamente o problema, os arquivos DBC fornecem dados individualizados por ficha de registro em cada sistema. Então, se o objetivo for a identificação dos pacientes, isso já não será possível pelos dados públicos. Por fim, minha experiência pessoal (que é maior no caso das AIH) me levou a trabalhar com data.table por razão de performance. Embora não seja uma recomendação definitiva, fica a sugestão. Pedro Paulo Chrispim Inst. Alicerce
On 10 Jul 2024, at 11:00, r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br wrote:
Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br
Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br
Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
Tópicos de Hoje:
1. Re: Extração de Dados do SUS (Cesar Rabak) 2. Re: Extração de Dados do SUS (Bernardo Rangel Tura)
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Message: 1 Date: Tue, 9 Jul 2024 23:49:28 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS Message-ID: <CAKrF98kbYG82aR9nF_qB4crhJMm9x2xJ6BG2cuzjNUTV4-=odA@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Se o formato do SISAB for documentada certamente é factível gerar um código para extrair os dados e colocá-los nas estruturas de dados convenientes para uso no R, provavelmente dataframes ou os mais modernos tibles.
On Tue, Jul 9, 2024 at 9:07?PM Hidelbrando Rodrigues por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá a todos.
Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ.
Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis para baixar.
Diante do exposto, seguem as questões:
* Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do site??
* Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado nesta conversa?
Att.
Hidelbrando
Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma tentativa seria extraí-los pelo R.
Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque as bases são muito mal feitas. Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver esse tipo de encrenca. Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você?
Bernardo Tura NBB - INC/MS On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho <ecacarva@gmail.com> escreveu:
Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados de um CNES específico Rafael ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha < rfsaldanha@gmail.com> escreveu:
Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: cnes.datasus.gov.br On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote:
Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um hospital público específico
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
> Olá Elias, > > Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são > registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de > Informações Ambulatoriais. > > Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote > {microdatasus} > > https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ > > Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. > > > Abraços, > > Raphael Saldanha > > > On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote: > > Bom dia pessoal > Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos > do SUS ? > > > > -- > > > *In Jesu et Maria * > > *Obrigado / Thank you * > *Prof. Dr. Elias Carvalho* > > * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed > is he who has been able to understand the cause of things" * > > _______________________________________________ > R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. > > _______________________________________________ > R-br mailing list > R-br@listas.c3sl.ufpr.br > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça > código mínimo reproduzível. >
--
*In Jesu et Maria *
*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
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*In Jesu et Maria *
*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
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*In Jesu et Maria *
*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
_______________________________________________ R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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*In Jesu et Maria*
*Obrigado / Thank you* *Prof. Dr. Elias Carvalho*
*"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he who has been able to understand the cause of things"* _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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-------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20240709/94c49b96/attachment-0001.htm>
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Message: 2 Date: Wed, 10 Jul 2024 08:39:58 -0300 From: Bernardo Rangel Tura <listasrtura@gmail.com> To: "Hidelbrando Rodrigues por (R-br)" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS Message-ID: <65425f85-4744-43e2-854e-04a8b521e96f@gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"
Bom dia Hidelbrando
Eu nunca trabalhei com dados do SISAB mas acredito qeu seja possivel fazer sim e tipo de rotina, teria que ver o formato dos dados, um pacote que pode ser interessante para você é o SIDRA
Abraços
Bernardo Tura
NBB - INC/MS
On 7/9/24 21:06, Hidelbrando Rodrigues por (R-br) wrote:
Olá a todos.
Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ.
Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis para baixar.
Diante do exposto, seguem as questões:
* Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do site??
* Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado nesta conversa?
Att.
Hidelbrando
Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma tentativa seria extraí-los pelo R.
Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque as bases são muito mal feitas. Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver esse tipo de encrenca. Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você?
Bernardo Tura NBB - INC/MS
On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho <ecacarva@gmail.com> escreveu:
Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados de um CNES específico Rafael ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha <rfsaldanha@gmail.com> escreveu:
Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: cnes.datasus.gov.br <http://cnes.datasus.gov.br>
On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote:
Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um hospital público específico
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Olá Elias,
Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de Informações Ambulatoriais.
Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote {microdatasus}
https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/
Posso te ajudar com mais detalhes se precisar.
Abraços,
Raphael Saldanha
On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Bom dia pessoal Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos do SUS ?
-- /In Jesu et Maria
/ /Obrigado / Thank you / /Prof. Dr. Elias Carvalho/ / / / "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" /
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-- /In Jesu et Maria
/ /Obrigado / Thank you / /Prof. Dr. Elias Carvalho/ / / / "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" /
-- /In Jesu et Maria
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Subject: Legenda do Digest
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Fim da Digest R-br, volume 155, assunto 3 *****************************************
Aproveito a deixa dada pela lembrança do P. P. Crispim, e coloco que atualmente faz-se mister ter o apoio técnico de especialistas sobre LGPD, pois além de os dados já serem razoavelmente anonimizados pela retirada de dados de identificação mais comuns, há ainda risco de certas pesquisas permitirem alguma violação se a gente não tomar cuidado. HTH On Thu, Jul 11, 2024 at 12:22 PM Pedro Paulo Chrispim por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Prezados,
Como Tura, uso os dados do DATASUS há muitos anos. Não encontrei nada melhor do que manter uma cópia dos dados em sua máquina e extrair os dados de interesse direto dos DBC. Isso porque as bases não são muito uniformes e as correções nos scripts são relativamente frequentes. Apesar do trabalho maravilhoso que o DATASUS faz nas bases, pois seria um verdadeiro pesadelo usar os dados verdadeiramente crus.
Já os dados individualizados não são exatamente o problema, os arquivos DBC fornecem dados individualizados por ficha de registro em cada sistema. Então, se o objetivo for a identificação dos pacientes, isso já não será possível pelos dados públicos.
Por fim, minha experiência pessoal (que é maior no caso das AIH) me levou a trabalhar com data.table por razão de performance. Embora não seja uma recomendação definitiva, fica a sugestão.
Pedro Paulo Chrispim Inst. Alicerce
On 10 Jul 2024, at 11:00, r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br wrote:
Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br
Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br
Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
Tópicos de Hoje:
1. Re: Extração de Dados do SUS (Cesar Rabak) 2. Re: Extração de Dados do SUS (Bernardo Rangel Tura)
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Message: 1 Date: Tue, 9 Jul 2024 23:49:28 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS Message-ID: <CAKrF98kbYG82aR9nF_qB4crhJMm9x2xJ6BG2cuzjNUTV4-= odA@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Se o formato do SISAB for documentada certamente é factível gerar um código para extrair os dados e colocá-los nas estruturas de dados convenientes para uso no R, provavelmente dataframes ou os mais modernos tibles.
On Tue, Jul 9, 2024 at 9:07?PM Hidelbrando Rodrigues por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá a todos.
Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ.
Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis para baixar.
Diante do exposto, seguem as questões:
* Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do site??
* Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado nesta conversa?
Att.
Hidelbrando
Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma tentativa seria extraí-los pelo R.
Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque as bases são muito mal feitas. Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver esse tipo de encrenca. Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você?
Bernardo Tura NBB - INC/MS On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho < ecacarva@gmail.com> escreveu:
Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados de um CNES específico Rafael ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha < rfsaldanha@gmail.com> escreveu:
> Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber > o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: > cnes.datasus.gov.br > On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote: > > Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. > Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um > hospital público específico > > Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) < > r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > >> Olá Elias, >> >> Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são >> registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de >> Informações Ambulatoriais. >> >> Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote >> {microdatasus} >> >> https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ >> >> Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. >> >> >> Abraços, >> >> Raphael Saldanha >> >> >> On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >> >> Bom dia pessoal >> Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos >> do SUS ? >> >> >> >> -- >> >> >> *In Jesu et Maria * >> >> *Obrigado / Thank you * >> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >> >> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >> is he who has been able to understand the cause of things" * >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps:// listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > > > -- > > > *In Jesu et Maria * > > *Obrigado / Thank you * > *Prof. Dr. Elias Carvalho* > > * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed > is he who has been able to understand the cause of things" * > >
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*In Jesu et Maria *
*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
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*In Jesu et Maria *
*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
_______________________________________________ R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps:// listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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*In Jesu et Maria*
*Obrigado / Thank you* *Prof. Dr. Elias Carvalho*
*"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he who has been able to understand the cause of things"* _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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-------------- Próxima Parte ---------- Um anexo em HTML foi limpo... URL: < http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20240709/94c49b96/attac...
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Message: 2 Date: Wed, 10 Jul 2024 08:39:58 -0300 From: Bernardo Rangel Tura <listasrtura@gmail.com> To: "Hidelbrando Rodrigues por (R-br)" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS Message-ID: <65425f85-4744-43e2-854e-04a8b521e96f@gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"
Bom dia Hidelbrando
Eu nunca trabalhei com dados do SISAB mas acredito qeu seja possivel fazer sim e tipo de rotina, teria que ver o formato dos dados, um pacote que pode ser interessante para você é o SIDRA
Abraços
Bernardo Tura
NBB - INC/MS
On 7/9/24 21:06, Hidelbrando Rodrigues por (R-br) wrote:
Olá a todos.
Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ.
Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis para baixar.
Diante do exposto, seguem as questões:
* Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do site??
* Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado nesta conversa?
Att.
Hidelbrando
Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma tentativa seria extraí-los pelo R.
Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque as bases são muito mal feitas. Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver esse tipo de encrenca. Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você?
Bernardo Tura NBB - INC/MS
On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho <ecacarva@gmail.com> escreveu:
Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados de um CNES específico Rafael ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha <rfsaldanha@gmail.com> escreveu:
Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: cnes.datasus.gov.br <http://cnes.datasus.gov.br>
On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote:
Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um hospital público específico
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
escreveu:
Olá Elias,
Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de Informações Ambulatoriais.
Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote {microdatasus}
https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/
Posso te ajudar com mais detalhes se precisar.
Abraços,
Raphael Saldanha
On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Bom dia pessoal Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos do SUS ?
-- /In Jesu et Maria
/ /Obrigado / Thank you / /Prof. Dr. Elias Carvalho/ / / / "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" /
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Leia o guia de postagem (
http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br
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Subject: Legenda do Digest
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Fim da Digest R-br, volume 155, assunto 3 *****************************************
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Olá Pedro. Posso seduzir do seu comentário que os dados disponíveis do SISAB estariam, por hipótese, também disponível no DATA.SUS? Obrigado. Att. Hidelbrando Em qui., 11 de jul. de 2024 11:22, Pedro Paulo Chrispim por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Prezados,
Como Tura, uso os dados do DATASUS há muitos anos. Não encontrei nada melhor do que manter uma cópia dos dados em sua máquina e extrair os dados de interesse direto dos DBC. Isso porque as bases não são muito uniformes e as correções nos scripts são relativamente frequentes. Apesar do trabalho maravilhoso que o DATASUS faz nas bases, pois seria um verdadeiro pesadelo usar os dados verdadeiramente crus.
Já os dados individualizados não são exatamente o problema, os arquivos DBC fornecem dados individualizados por ficha de registro em cada sistema. Então, se o objetivo for a identificação dos pacientes, isso já não será possível pelos dados públicos.
Por fim, minha experiência pessoal (que é maior no caso das AIH) me levou a trabalhar com data.table por razão de performance. Embora não seja uma recomendação definitiva, fica a sugestão.
Pedro Paulo Chrispim Inst. Alicerce
On 10 Jul 2024, at 11:00, r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br wrote:
Enviar submissões para a lista de discussão R-br para r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou corpo da mensagem para r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br
Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo endereço r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br
Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
Tópicos de Hoje:
1. Re: Extração de Dados do SUS (Cesar Rabak) 2. Re: Extração de Dados do SUS (Bernardo Rangel Tura)
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Message: 1 Date: Tue, 9 Jul 2024 23:49:28 -0300 From: Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> To: a lista Brasileira oficial de discussão do programa R. <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS Message-ID: <CAKrF98kbYG82aR9nF_qB4crhJMm9x2xJ6BG2cuzjNUTV4-= odA@mail.gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Se o formato do SISAB for documentada certamente é factível gerar um código para extrair os dados e colocá-los nas estruturas de dados convenientes para uso no R, provavelmente dataframes ou os mais modernos tibles.
On Tue, Jul 9, 2024 at 9:07?PM Hidelbrando Rodrigues por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá a todos.
Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ.
Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis para baixar.
Diante do exposto, seguem as questões:
* Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do site??
* Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado nesta conversa?
Att.
Hidelbrando
Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma tentativa seria extraí-los pelo R.
Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque as bases são muito mal feitas. Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver esse tipo de encrenca. Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você?
Bernardo Tura NBB - INC/MS On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho < ecacarva@gmail.com> escreveu:
Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados de um CNES específico Rafael ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha < rfsaldanha@gmail.com> escreveu:
> Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber > o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: > cnes.datasus.gov.br > On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote: > > Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. > Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um > hospital público específico > > Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) < > r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu: > >> Olá Elias, >> >> Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são >> registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de >> Informações Ambulatoriais. >> >> Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote >> {microdatasus} >> >> https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/ >> >> Posso te ajudar com mais detalhes se precisar. >> >> >> Abraços, >> >> Raphael Saldanha >> >> >> On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote: >> >> Bom dia pessoal >> Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos >> do SUS ? >> >> >> >> -- >> >> >> *In Jesu et Maria * >> >> *Obrigado / Thank you * >> *Prof. Dr. Elias Carvalho* >> >> * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed >> is he who has been able to understand the cause of things" * >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing listR-br@listas.c3sl.ufpr.brhttps:// listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> > > > -- > > > *In Jesu et Maria * > > *Obrigado / Thank you * > *Prof. Dr. Elias Carvalho* > > * "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed > is he who has been able to understand the cause of things" * > >
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*In Jesu et Maria *
*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
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*Obrigado / Thank you * *Prof. Dr. Elias Carvalho*
* "Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC) "Blessed is he who has been able to understand the cause of things" *
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*"Felix, qui potuit rerum cognoscere causas" (Virgil 29 BC)"Blessed is he who has been able to understand the cause of things"* _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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Message: 2 Date: Wed, 10 Jul 2024 08:39:58 -0300 From: Bernardo Rangel Tura <listasrtura@gmail.com> To: "Hidelbrando Rodrigues por (R-br)" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> Subject: Re: [R-br] Extração de Dados do SUS Message-ID: <65425f85-4744-43e2-854e-04a8b521e96f@gmail.com> Content-Type: text/plain; charset="utf-8"; Format="flowed"
Bom dia Hidelbrando
Eu nunca trabalhei com dados do SISAB mas acredito qeu seja possivel fazer sim e tipo de rotina, teria que ver o formato dos dados, um pacote que pode ser interessante para você é o SIDRA
Abraços
Bernardo Tura
NBB - INC/MS
On 7/9/24 21:06, Hidelbrando Rodrigues por (R-br) wrote:
Olá a todos.
Permitam-me participar da conversa. Nosso laboratório LAMAPP (Laboratório de Monitoramento e Avaliação de Políticas Públicas), aqui da federal do Amazonas, tem parceria com o Centro de Estudos Estratégicos do FIOCRUZ.
Nós criamos um curso de Ciência de Dados Aplicado à Saúde. Ele será hospedado em uma plataforma que ainda vamos definir. Ele será aberto e gratuito. Utilizamos como base, dados do SISAB, que não são tão amigáveis para baixar.
Diante do exposto, seguem as questões:
* Seria possível criar um código para extrair essa base diretamente do site??
* Existem outros pacotes para baixar dados de saúde, além do mencionado nesta conversa?
Att.
Hidelbrando
Em ter., 9 de jul. de 2024 12:59, Elias Carvalho por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Caro Bernardo, eu agradeço antecipadamente Eu trabalho no TI de uma universidade estadual e temos nosso hospital universitário que atende muita gente, se não me engano além da cidade, atende mais de 100 municípios ao redor. Nosso problema é que o hospital usa o GSUS (prontuário do PR) e este não exporta dados, não tem API (pelo menos para nós). Gostaríamos de ter informações sobre prontuário, atendimento ambulatorial, prescrição de medicamentos, imagens e laudos de forma analítica, pois eu trabalho com BI (Qlik Sense) e gostaria de gerar gráficos e tabelas com esses dados, além de pedir para minha equipe desenvolver softwares de apoio com base nessas informações. Eu creio que todos esses dados são exportados para o SUS e daí uma tentativa seria extraí-los pelo R.
Em ter., 9 de jul. de 2024 às 12:28, Bernardo Rangel Tura por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Elias o pacote do Rafael é maravilhoso vivo sugerindo para as pessoas usarem mas para algumas coisas às vezes não funciona, quase sempre porque as bases são muito mal feitas. Como trabalho com elas a mais e 20 anos estou acostumando a resolver esse tipo de encrenca. Que tal você descrever o que precisa e crio um script para você?
Bernardo Tura NBB - INC/MS
On 6/18/24 15:19, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Outra coisa, consigo extrair dados da BPA-I (*Boletim de Produção Ambulatorial ? Individualizado*) ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 15:04, Elias Carvalho <ecacarva@gmail.com> escreveu:
Procurei aqui mas não achei, pelo fetch_datasus, dá para extrair dados de um CNES específico Rafael ?
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:59, Raphael Saldanha <rfsaldanha@gmail.com> escreveu:
Obrigado! Para filtrar por um hospital específico, você precisa saber o código CNES da unidade de saúde. Você pode procurar o código aqui: cnes.datasus.gov.br <http://cnes.datasus.gov.br>
On 2024-06-18 15:57, Elias Carvalho wrote:
Excelente Rafael ! Muito bom seu pacote. Vou dar uma olhada, no momento eu preciso extrair informações de um hospital público específico
Em ter., 18 de jun. de 2024 às 10:40, Raphael Saldanha por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
escreveu:
Olá Elias,
Os dados de atendimentos ambulatoriais da dimensão pública do SUS são registrados em um sistema de informações em saúde denominado Sistema de Informações Ambulatoriais.
Você consegue acessar esses dados com o R usando o pacote {microdatasus}
https://rfsaldanha.github.io/microdatasus/
Posso te ajudar com mais detalhes se precisar.
Abraços,
Raphael Saldanha
On 2024-06-18 15:34, Elias Carvalho por (R-br) wrote:
Bom dia pessoal Alguém sabe se há algum pacote do R que extraia dados de atendimentos do SUS ?
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