Olá. Estou tentando calcular uma matriz de parentesco utilizando pacote "gap" porém quando o programa vai calcular ocorre um erro o R trava. Gostaria de saber se existe outro pacote para calcular sendo que existem mais de 100 animais, coisa que o 'gap" não fez ( a matriz so é calculada quando o numero de indivíduos e menor que 999 animais). desde ja grato -- GLEYSON VIEIRA DOS SANTOS ZOOTECNISTA - UFPI DOUTORANDO EM CIÊNCIA ANIMAL-UFPI TEL: (89) 9985-5488
Caro Gleyson, Seja benvindo à lista R-br! Você terá mais chances de receber uma reposta útil se ao postar nesta lista você colocar uma linha de assunto relevante ao problema/questão que deseja esclarecer. Ajuda bastante se você fornecer mais informações, como por exemplo que comando efetivamente foram dados e se possível fazê-lo com um CMR (código mínimo reproduzível). Seu depoimento sobre o tamanho da matriz também me parece confuso: "...para calcular sendo que existem mais de 100 animais...matriz so é calculada quando o numero de indivíduos e menor que 999 animais." Você já tentou usar as ferramentas de busca do próprio R? []s -- Cesar Rabak 2015-08-16 22:57 GMT-03:00 Gleyson Vieira dos Santos < gleysonvieira@zootecnista.com.br>:
Olá. Estou tentando calcular uma matriz de parentesco utilizando pacote "gap" porém quando o programa vai calcular ocorre um erro o R trava. Gostaria de saber se existe outro pacote para calcular sendo que existem mais de 100 animais, coisa que o 'gap" não fez ( a matriz so é calculada quando o numero de indivíduos e menor que 999 animais).
desde ja grato
-- GLEYSON VIEIRA DOS SANTOS ZOOTECNISTA - UFPI DOUTORANDO EM CIÊNCIA ANIMAL-UFPI TEL: (89) 9985-5488 _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
Da uma olhada neste pacote talvez ajude nadiv R package https://cran.r-project.org/web/packages/nadiv/index.html Por curiosidade qual pacote vc vai usar para ajustar o seu modelo? Em 17 de agosto de 2015 03:57, Gleyson Vieira dos Santos < gleysonvieira@zootecnista.com.br> escreveu:
Olá. Estou tentando calcular uma matriz de parentesco utilizando pacote "gap" porém quando o programa vai calcular ocorre um erro o R trava. Gostaria de saber se existe outro pacote para calcular sendo que existem mais de 100 animais, coisa que o 'gap" não fez ( a matriz so é calculada quando o numero de indivíduos e menor que 999 animais).
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-- Wagner Hugo Bonat ---------------------------------------------------------------------------------------------- Department of Mathematics and Computer Science (IMADA) University of Southern Denmark (SDU) and Laboratório de Estatística e Geoinformação (LEG) Universidade Federal do Paraná (UFPR)
Existem vários pacotes que permitem obter a matriz de parentesco a partir do pedgree. Eu googlei ingenuamente com "pedgree matrix in R" e tive muitos resultados. Eu apreciaría se você me apontasse qual dos pacotes lhe parece melhor e porque. À disposição. Walmes.
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Walmes Zeviani