Ajuda com Análise de Similaridade - ANOSIM
Bom dia a todos, parabéns pela iniciativa da lista. Muito bom mesmo. Solicito auxílio quanto a realização de uma análise de Similaridade do tipo ANOSIM, pois preciso realizar e gostaria de usar o R, entretanto, não tenho certeza da entrada dos dados na planilha excel (csv) e os procedimentos quanto a comandos para gerar a análise e respectivo gráfico no software. Minha análise são de três ambientes distintos e três hábitats em cada ambiente. Alguém pode me ajudar, por favor.... Se houver necessidade envio os dados Grata pela atenção, Flávia -- MSc. Flávia Kelly S. Souza Universidade Federal do Amazonas - UFAM Faculdade de Ciências Agrárias - Depto. de Ciências Pesqueiras Manaus - Amazonas flavia.souza@piatam.org.br flakel.souza@gmail.com flaviasouza@ufam.edu.br skype: fla_kel
salvo engano de minha parte, O pacote vegan do R implementa analise de similaridade ANOSIM de forma mais geral este pacote tem muita relacao com a sua area de interesse On Wed, 21 Mar 2012, Flávia Souza wrote:
Bom dia a todos, parabéns pela iniciativa da lista. Muito bom mesmo. Solicito auxílio quanto a realização de uma análise de Similaridade do tipo ANOSIM, pois preciso realizar e gostaria de usar o R, entretanto, não tenho certeza da entrada dos dados na planilha excel (csv) e os procedimentos quanto a comandos para gerar a análise e respectivo gráfico no software. Minha análise são de três ambientes distintos e três hábitats em cada ambiente.
Alguém pode me ajudar, por favor....
Se houver necessidade envio os dados
Grata pela atenção,
Flávia
-- MSc. Flávia Kelly S. Souza Universidade Federal do Amazonas - UFAM Faculdade de Ciências Agrárias - Depto. de Ciências Pesqueiras Manaus - Amazonas flavia.souza@piatam.org.br flakel.souza@gmail.com flaviasouza@ufam.edu.br skype: fla_kel
instalando o vegan e carregando help(anosim) vai te mostrar anosim {vegan} R Documentation Analysis of Similarities Description Analysis of similarities (ANOSIM) provides a way to test statistically whether there is a significant difference between two or more groups of sampling units. Usage anosim(dat, grouping, permutations = 999, distance = "bray", strata) Arguments dat Data matrix or data frame in which rows are samples and columns are response variable(s), or a dissimilarity object or a symmetric square matrix of dissimilarities. grouping Factor for grouping observations. permutations Number of permutation to assess the significance of the ANOSIM statistic. distance Choice of distance metric that measures the dissimilarity between two observations . See vegdist for options. This will be used if dat was not a dissimilarity structure or a symmetric square matrix. strata An integer vector or factor specifying the strata for permutation. If supplied, observations are permuted only within the specified strata. ........ On Wed, 21 Mar 2012, Paulo Justiniano wrote:
salvo engano de minha parte, O pacote vegan do R implementa analise de similaridade ANOSIM
de forma mais geral este pacote tem muita relacao com a sua area de interesse
On Wed, 21 Mar 2012, Flávia Souza wrote:
Bom dia a todos, parabéns pela iniciativa da lista. Muito bom mesmo. Solicito auxílio quanto a realização de uma análise de Similaridade do tipo ANOSIM, pois preciso realizar e gostaria de usar o R, entretanto, não tenho certeza da entrada dos dados na planilha excel (csv) e os procedimentos quanto a comandos para gerar a análise e respectivo gráfico no software. Minha análise são de três ambientes distintos e três hábitats em cada ambiente.
Alguém pode me ajudar, por favor....
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Grata pela atenção,
Flávia
-- MSc. Flávia Kelly S. Souza Universidade Federal do Amazonas - UFAM Faculdade de Ciências Agrárias - Depto. de Ciências Pesqueiras Manaus - Amazonas flavia.souza@piatam.org.br flakel.souza@gmail.com flaviasouza@ufam.edu.br skype: fla_kel
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