Heatmap com dois conjuntos de dados

Caríssimos(as) mestres(as), bom dia! Estou com uma dúvida sobre como deve ser meu ficheiro de entrada para plotar um gráfico como o terceiro deste link: https://stackoverflow.com/questions/67746044/r-heatmap-with-circles Eu criei 2 ficheiros .csv, um contento os valores de expressão gênica nos diferentes tipos celulares (col->genes, lin->tipos de células); e o outro, contendo os valores de freqüência em que a expressão do gene ocorre em cada célula, com a mesma estrutura do primeiro. A representação destes dados no gráfico deve ser: a área do círculo construído a partir dos dados de frequencia e a cor do círculo deve corresponder aos valores de expressão, como em um heatmap. Eu tenho que trabalhar com os ficheiros em separado ou tenho que montar um único ficheiro para ter este resultado? Muitíssimo obrigada pela ajuda!! Michele -- ------------------------------------------------------------------------ *Dra. Michele Claire Breton* Técnica Superior em Bioinformática CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde Faculdade de Ciências da Saúde Universidade da Beira Interior Covilhã - Castelo Branco - Portugal

Veja se o baloonplot do pacote gplots já atende suas necessidades. A descrição dessa função mostra como montar os dados, e verás que as duas abordagens seriam possíveis. HTH -- Cesar Rabak On Fri, May 20, 2022 at 8:04 AM Michele Claire Breton por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Caríssimos(as) mestres(as), bom dia!
Estou com uma dúvida sobre como deve ser meu ficheiro de entrada para plotar um gráfico como o terceiro deste link: https://stackoverflow.com/questions/67746044/r-heatmap-with-circles
Eu criei 2 ficheiros .csv, um contento os valores de expressão gênica nos diferentes tipos celulares (col->genes, lin->tipos de células); e o outro, contendo os valores de freqüência em que a expressão do gene ocorre em cada célula, com a mesma estrutura do primeiro.
A representação destes dados no gráfico deve ser: a área do círculo construído a partir dos dados de frequencia e a cor do círculo deve corresponder aos valores de expressão, como em um heatmap.
Eu tenho que trabalhar com os ficheiros em separado ou tenho que montar um único ficheiro para ter este resultado?
Muitíssimo obrigada pela ajuda!!
Michele
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