André, Tenta rodar o processo em um caminho onde não tenha acentuação no nome dos arquivos/diretórios. Acredito que o problema é que ele não está reconhecendo o caminho com a palavra "análise" acentuada. Att., Dani Em ter, 9 de ago de 2016 às 19:19, Leonard Mendonça de Assis < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
André,
Pela mensagem, é erro do pandoc, não do R. Ele não está achando onde o markdown gerou a figura. Pode ser problema de configuração de seu PATH ou até um erro do R que passou batido (Acho difícil ser isto, pois, segundo você, o html é gerado).
Eu, particularmente, instalei o pandoc direto, não utilizo o do R
Leonard
*De:* Andre Oliveira [mailto:andreolsouza@yahoo.com.br] *Enviada em:* terça-feira, 9 de agosto de 2016 16:33 *Para:* Leonard Assis <assis.leonard@gmail.com> *Assunto:* Re: [R-br] Markdown
Este é o erro ....
output file: análise.knit.md <http://xn--anlise-qta.knit.md>
! Package pdftex.def Error: File `an� lise_files/figure-latex/unnamed-chunk-17-1 .pdf' not found.
See the pdftex.def package documentation for explanation. Type H <return> for immediate help. ...
l.767 ...iles/figure-latex/unnamed-chunk-17-1.pdf}
pandoc: Error producing PDF from TeX source Erro: pandoc document conversion failed with error 43 Execução interrompida
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Terça-feira, 9 de Agosto de 2016 14:10, Leonard Assis < assis.leonard@gmail.com> escreveu:
Eu tive um.problema deste uma vez. Era problema do pacote, que não era muito compatível com o markdown. Agora não lembro ao certo qual figura era, suponho que seja alguma representação de rede neural.
Leonard
Em 9 de ago de 2016 14:06, "Andre Oliveira via R-br" < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Boa tarde, deu tudo certo. Obrigado pela dicas!
Ao rodar para gerar o HTML está tudo certo, mas para rodar para obter o .pdf não insere as figuras! Alguma dica de como contornar este ponto?
obg
Estrutura ...
--- title: "Material R" author: "André Oliveira Souza" date: "3 de maio de 2016" output: pdf_document number_sections: yes ---
```{r,fig=T} Dados<-scale(dad) hc<-hclust(dist(dad),method=" ward.D") par(las=2) # Gira título do eixo plot(as.dendrogram(hc),horiz = F,main = "Agrupamentos dos Tratamentos") abline(h=6,lty=3, col="red") ```
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Domingo, 7 de Agosto de 2016 20:36, Andre Oliveira via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
obrigado!
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Domingo, 7 de Agosto de 2016 13:36, Marcos Silva via R-br < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Tente supressMessages()
Em 7 de ago de 2016 11:21 AM, "Felipe via R-br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Tentou assim:
```{r,message=FALSE}
require(gdata) ```
Em 07-08-2016 11:04, Andre Oliveira via R-br escreveu:
boa dia, como esconder estes avisos no R Markdown? Já pesquisei e não consegui resolver, quando carrego a gdata, ficam estes estes avisos no texto. Minhas configurações no documento são:
```{r,include=F} # Configuração global require(knitr) opts_chunk$set(echo = F,comment="",message=" ") ```
```{r}
require(gdata, quietly = TRUE) gdata: read.xls support for 'XLS' (Excel 97-2004) files ENABLED. gdata: read.xls support for 'XLSX' (Excel 2007+) files ENABLED. Attaching package: ‘gdata’ The following object is masked from ‘package:stats’: nobs The following object is masked from ‘package:utils’: object.size The following object is masked from ‘package:base’: startsWith
```
Obrigado!
André Oliveira Souza. Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
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Felipe E. Barletta Mendes
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