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13. [Dúvida] Invocar funções C++ no R (Pedro Rafael)
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15. Re: [Dúvida] Invocar funções C++ no R (Pedro Rafael)
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19. Re: [Dúvida] Invocar funções C++ no R (Benilton Carvalho)
20. Agrupamento de Tocher no R (Emmanuel Arnhold)
21. Re: Plotar dados em Mapa (Leandro Marino)
22. Re: Plotar dados em Mapa (Rodrigo Plei)

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Message: 1
Date: Wed, 24 Aug 2011 23:06:56 -0300
From: Alexandre Castagna <alexandre.castagna@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Problema de memória: MATRIZES GIGANTES
Message-ID:
<CAFiuohLh13nV29aDu=KuPvhqaaUwAtdg_gvk9tsMsoBp7ARQcg@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Se não me engano, há um tempo atrás correu na lista o mesmo problema e me
lembro de terem citado uma solução que fazia o R trabalhar com dados
reescrevendo e lendo do disco, permitindo a análise de bancos maiores, mas
com custo de tempo de processamento.

Em 24 de agosto de 2011 19:56, Pedro Rafael
<pedro.rafael.marinho@gmail.com>escreveu:

> Sim, o Revolution R é bom mas novas mudanças demoram mais para chegar nele,
> como novos pacotes, correções, etc.
>
> Pedro
>
> Em 24 de agosto de 2011 18:06, Alexandre Castagna [via R-br] <
> ml-node+3766656-34166862-223914@n4.nabble.com> escreveu:
>
>> Caros,
>>
>> Também estou enfrentando um problema e memória e encontrei um software
>> chamado Revolution R Enterprise (http://www.revolutionanalytics.com/) que
>> é compatível com o R, mas permite análise de grandes bancos de dados; ele é
>> pago, mas tem licença gratuita para acadêmicos. Ainda não testei (acabei de
>> instalar), mas segue a dica se alguém se interessar.
>>
>> Abraços,
>>
>> Em 23 de agosto de 2011 20:03, Márcio Luís Moreira de Souza <[hidden
>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3766656&i=0>> escreveu:
>>
>> Olá, Henrique!
>>>
>>> Muito obrigado pela atenção.
>>> Darei uma olhada.
>>>
>>> Abração!!
>>>
>>>
>>> Em 23 de agosto de 2011 18:05, Henrique Leme Felizatti <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3766656&i=1>
>>> > escreveu:
>>>
>>> Existe um projeto em R, com respectivo pacote, denominado BigMemory (
>>>> www.*bigmemory*.org/) que serve exatamente para isso. Nem todas as
>>>> funções do R estão disponíveis nesse projeto no entanto as principais
>>>> funções de manipulação de dados está implementada.
>>>>
>>>> Atenciosamente
>>>>
>>>> Henrique
>>>>
>>>>
>>>>
>>>> Em 23 de agosto de 2011 17:01, Márcio Luís Moreira de Souza <[hidden
>>>> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3766656&i=2>>escreveu:
>>>>
>>>> Tentei rodar:
>>>>>
>>>>> expand.grid(1:5,1:5,1:5,1:5,1:5,1:5,1:5,1:5,1:5,1:5,1:5)E deu o resultado
>>>>> Error: cannot allocate vector of size 186.3 Mb
>>>>>
>>>>> O que posso fazer?? Alguma sugestão?
>>>>>
>>>>>
>>>>> p.s.: tal comando geraria um data.frame com números inteiros.
>>>>> Meu PC é HP pavilon (processador I5), 4 Gb de memória...
>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>> Em 23 de agosto de 2011 16:30, Benilton Carvalho <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3766656&i=3>
>>>>> > escreveu:
>>>>>
>>>>>> defina gigantes.
>>>>>>
>>>>>> eu trabalho com 7M+ linhas e centenas de colunas diariamente e sem
>>>>>> problemas.
>>>>>>
>>>>>> vc precisa ser especifico com o seu problema. matrizes de reais?
>>>>>> inteiros? logicos?
>>>>>>
>>>>>> que OS? qto de RAM? que operacoes precisa na matriz?
>>>>>>
>>>>>> b
>>>>>>
>>>>>>
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>>>>>>
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>>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>>>>> código mínimo reproduzível.
>>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>>
>>>>> --
>>>>>
>>>>> Prof. Márcio Souza, M.Sc. (DE/UFJF)
>>>>> www.profmsouza.blogspot.com
>>>>> http://lattes.cnpq.br/4578008002785684
>>>>>
>>>>>
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>>>>>
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>>>>
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Message: 2
Date: Thu, 25 Aug 2011 00:48:44 -0300
From: Junior Beleti <beleti.junior@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] Função eigen
Message-ID:
<CA+1Tbo9c-c=1sKdj17JireTVMi3ccnABvuQWdKZApqicJ6nwGA@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Boa Noite..

Estou analisando um script que realiza um loop e chama a função eigen.
Com o pacote debug constatei que a execução desse script gasta muito tempo
nessa função.
Vi também que ela faz chamada para código fortran.

Gostaria de saber se existe outra função que realiza o mesmo que a eigen.

Att,

--
Carlos Roberto Beleti Junior
Mestrado em Ciência da Computação
Departamento de Informática
Universidade Estadual de Maringá
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Message: 3
Date: Thu, 25 Aug 2011 01:10:37 -0300
From: Tiago de Oliveira Vieira <tiagovieira7@yahoo.com.br>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Otimizar tempo de processamento
Message-ID: <1314245437.2540.5.camel@tiago-Positivo-Mobile>
Content-Type: text/plain; charset="UTF-8"

Benilton,

Segui suas dicas e o programa rodou bem, mas quando aumento o número
máximo de filhos "f" ou o número de gerações "n" e programa não roda,
veja:

> library(doMC)
> registerDoMC()
> programa2 <- function(f,n,m) {
+ ## f: número máximo de filhos
+ ## n: número de gerações
+ ## m: número de iterações
+ S <- foreach(p=seq(0,1,by=0.01), .combine=rbind) %dopar% {
+ pp <- 0
+ for (g in 1:m) {
+ y <- 1
+ for (k in 1:n) y <- rbinom(1, y*f, p)
+ if (y > 0) pp <- pp + 1
+ }
+ c(p, pp/m)
+ }
+ return(S)
+ }
> system.time(prog2 <- programa2(3,100,1000))
Erro em { : task 48 failed - "valor ausente onde TRUE/FALSE necessário"
Além disso: Houve 50 ou mais avisos (use warnings() para ver os
primeiros 50)
Timing stopped at: 61.27 0.03 61.58
> warnings()
Mensagens de aviso:
1: In rbinom(1, y * f, p) : NAs produzidos
2: In rbinom(1, y * f, p) : NAs produzidos
3: In rbinom(1, y * f, p) : NAs produzidos
4: In rbinom(1, y * f, p) : NAs produzidos

Em Qui, 2011-08-18 às 17:45 -0300, Leonard Assis escreveu:
> Entendi sua explanação. heehhe
>
> olhei o código bem por alto depois do almoço num tempó livre, única
> coisa "estranha" que notei foi esse loop que pra mim estava sem muito
> sentido.
>
> Mas muito dessa minha opinião vai do fato de não conhecer ao fundo o
> problema, pois para mim, ele estaria interessado em cada uma das
> iterações (eu, quando faço simulações, procuro guardar cada uma delas,
> nem que seja pra brincar de bootstrap depois, hehehe)
>
> Quanto à copa américa, estava meio na cara que daria Uruguai, é o time
> com mais conjunto, Argentina e Brasil estavam em início de trabalho.
> No betclick eu apostei no uruguai e salvei algum, ehhehe
>
> lmassis <at> yahoo <dot> com <dot> br
> assis.leonard <at> gmail <dot> com
>
>
>
> 2011/8/18 Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
> Leonard,
>
> para cada 'g', ele determina uma realizacao (aleatoria) de Y_n
> condicionado em Y_{n-1}. Se essa realizacao por nao-nula, ele
> incrementa 'pp'. Como a chance de Y_m ser zero e' bem pequena,
> ele
> repete o laco 'm' vezes, contando quantas vezes (em 'm') ele
> observa
> Y_n > 0...
>
> Estou bem certo de que o codigo esta' correto... mas eu tambem
> estava
> certo que o Brasil ganharia a Copa America...
>
> b
>
> 2011/8/18 Leonard Assis <assis.leonard@gmail.com>:
>
> > Benilton, eu nem cheguei a rodar, analisei o que ele faz
> mesmo.
> >
> > Tem que resolver esse problema daquele loop que só faz
> perder tempo senão o
> > próprio estudo de simulação dele está inválido.
> > lmassis <at> yahoo <dot> com <dot> br
> > assis.leonard <at> gmail <dot> com
> >
> >
> > 2011/8/18 Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
> >>
> >> Tiago,
> >>
> >> esse e' um problema legal... se vc derivar as distribuicoes
> a mao,
> >> certamente vc consegue ganhos bem maiores...
> >>
> >> FYI: usando propriedades de estatistica, vc chega na
> mudanca que eu
> >> fiz na geracao das suas variaveis aleatorias.
> >>
> >> Adicionalmente, eu nao tive paciencia de esperar o seu
> codigo original
> >> acabar de rodar... eu o cancelei depois de um pouco mais de
> 1h10m.
> >>
> >> Abaixo uma sugestao para voce:
> >>
> >>
> >> library(foreach)
> >> library(doMC)
> >> registerDoMC()
> >> programa2 <- function(f,n,m) {
> >> ## f: número máximo de filhos
> >> ## n: número de gerações
> >> ## m: número de iterações
> >> S <- foreach(p=seq(0,1,by=0.01), .combine=rbind) %dopar%
> {
> >> pp <- 0
> >> for (g in 1:m) {
> >> y <- 1
> >> for (k in 1:n)
> >> y <- rbinom(1, y*f, p)
> >> if (y > 0) pp <- pp + 1
> >> }
> >> c(p, pp/m)
> >> }
> >> return(S)
> >> }
> >> system.time(prog2 <- programa2(2,200,1000))
> >> plot(prog2, xlab = "p", ylab = "Probabilidade de
> Percolação")
> >>
> >> para matar sua curiosidade, no meu computador, eu obtive:
> >>
> >> > system.time(prog2 <- programa2(2,200,1000))
> >> user system elapsed
> >> 257.072 2.562 20.835
> >> _______________________________________________
> >> R-br mailing list
> >> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia)
> e forneça
> >> código mínimo reproduzível.
> >
> >
> > _______________________________________________
> > R-br mailing list
> > R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> > https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> > Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
> forneça código
> > mínimo reproduzível.
> >
>
>
>
>
> --
> Successful people ask better questions, and as a result, they
> get
> better answers. (Tony Robbins)
>
> _______________________________________________
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> forneça código mínimo reproduzível.
>
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------------------------------

Message: 4
Date: Thu, 25 Aug 2011 10:08:45 +0100
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Otimizar tempo de processamento
Message-ID:
<CAO-arWPqAgQdoTvREqL0YPxpEDycvEPm398=PLdYr=wmsMj33A@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

Tiago,

isso e' resultado de y sendo igual a NA ou integer(0).

Vc vai precisar trocar o %dopar% por %do% para debugar. Uma sugestao
e' comecar por adiciionar umas condicoes para teste dentro do for()

for (k in 1:n) y <- rbinom(1, y*f, p)

usar algo como

for (k in 1:n){
y <- rbinom(1, y*f, p)
if (length(y) == 0){
browser()
}else{
if (!is.finite(y))
browser()
}
}

b

------------------------------

Message: 5
Date: Thu, 25 Aug 2011 04:02:04 -0700 (PDT)
From: Alexandre Santos <alexandresantosbr@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Representação usando expression()
Message-ID:
<1314270124.69929.YahooMailNeo@web38404.mail.mud.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Bom

Bom dia pessoal,
          Gostaria de saber s é possível fazer com que em:

text(33,0.9,expression(italic("y")==italic("exp")(-"0.9588"+"0.0841"*italic("*x")-"0.0010"*italic("*x"))/(1+italic("exp")(-"0.9588"+"0.0841"*italic("*x")-"0.0010"*italic("*x")))),cex=0.8)

           A equação aparecesse no gráfico como: ("exp")(-"0.9588"+"0.0841"*italic("*x")-"0.0010"*italic("*x")) sobre (1+italic("exp")(-"0.9588"+"0.0841"*italic("*x")-"0.0010"*italic("*x") e não separado por / , isso é possível?
Obrigado,

Alexandre dos Santos
Engenheiro Florestal, MSc.
Universidade Federal de Lavras
Departamento de Entomologia
Laboratório de Entomologia Florestal
Caixa Postal 3037
37200-000 - Lavras/MG
Fone: +55 (35) 3829-5122
-------------- Próxima Parte ----------
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------------------------------

Message: 6
Date: Thu, 25 Aug 2011 12:17:06 +0100
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br, Alexandre Santos
<alexandresantosbr@yahoo.com.br>
Subject: Re: [R-br] Representação usando expression()
Message-ID:
<CAO-arWNKiAoPemWRGgichpb+JkNU2FVQg_gX96RmvpVtDPXJ6w@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

Tomei a liberdade de simplificar um pouco sua expressao (e'
equivalente ao modelo que vc descreve):

txt = expression(frac(1, 1+e^{0.9588-0.0841*x+0.0010*x^2}))
plot(1, type='n')
legend(1, 1, txt, bty='n')

b

------------------------------

Message: 7
Date: Thu, 25 Aug 2011 04:29:53 -0700 (PDT)
From: Alexandre Santos <alexandresantosbr@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] Representação usando expression()
Message-ID: <1314271793.2934.YahooMailNeo@web38406.mail.mud.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Obrigado Benilton,

       Resolveu o meu problema e ficaram muito mais elegante os argumentos também,
Abraço,

Alexandre dos Santos
Engenheiro Florestal, MSc.
Universidade Federal de Lavras
Departamento de Entomologia
Laboratório de Entomologia Florestal
Caixa Postal 3037
37200-000 - Lavras/MG
Fone: +55 (35) 3829-5122

Tomei a liberdade de simplificar um pouco sua expressao (e'
equivalente ao modelo que vc descreve):

txt = expression(frac(1, 1+e^{0.9588-0.0841*x+0.0010*x^2}))
plot(1, type='n')
legend(1, 1, txt, bty='n')

b
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------------------------------

Message: 8
Date: Thu, 25 Aug 2011 08:29:54 -0300
From: Leonel Lucena Rodrigues <leonellucena@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Objetos da Classe SpatialPolygonsDataFrame
Message-ID:
<CADovVG3hzHenVknnN2HVuBgEUTS-pwzhsjfQU-4G_6S0rsxZxw@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Caro Prof. Paulo

Eu esta me referinto a matrix de coordenadas que define cada poligono, pois
o motivo da obtenção dessas coordenadas é para usar
na função kernel2d que, junto com a função image e um raio especificado,
estimará a desnidade kernel.
Se o senhor poder me ajudar ficaria grato.

Att, Leonel Lucena

Em 24 de agosto de 2011 16:43, Paulo Justiniano <paulojus@leg.ufpr.br>escreveu:

> Leonel
>
> certamente mas precisa ficar claro o que voce quer dizzer por coordenadas.
> Voce deseja:
> 1) a matrix de coordenadas que define cada poligono
> 2) as coordenadas de um ponto que represent o polygono (pr exemplo o
> centroide dado por labpt
>
> se for 2) fica ainda mais direto bastando
>
> coordinates(dados)
>
> onde dados é um SpatialPolygonDataFrame
> (ou SpatialPolygons)
>
>
> tudo isto está nas funcionalidades do pacote sp
>
>
>
>
> On Tue, 23 Aug 2011, Leonel Lucena Rodrigues wrote:
>
>
>> Muito obrigado Prof. pela sua atenção, mas eu não fui muito explicativo
>> ao me referir às coordenadas.
>>
>> Se o Sr. me permitir enviar o shp de Fortaleza e os comandos para que eu
>> possa me explicar melhor ficaria muito grato.
>>
>> Abraço, Leonel.
>>
>>
>>
>>
>> Em 23 de agosto de 2011 15:38, Paulo Justiniano <paulojus@leg.ufpr.br>
>> escreveu:
>> 1o as coords estarao disponíveis para cada poligono individualmente
>>
>> Por exemplo, suponha "dados" em que cada polygono seja definido por
>> um unico conjun to de coordenadas
>>
>> dados@polygons[[1]]@Polygons[[**1]]@coords
>>
>> Com isto se quiser extrair dos varios polygonos voce pode montar ujm
>> lapply()
>>
>>
>> 2o possiveis vieses podem ser dados por: forma de considerar (ou nao
>> considerar...) bordas e sistemas de coordenadas (por
>> ex usar lat/long que é inadequada paa calculos baseados em distancias
>> euclidianas)
>>
>>
>>
>>
>> On Tue, 23 Aug 2011, Leonel Lucena Rodrigues wrote:
>>
>> Boa Tarde,
>>
>> Estou com duas dúvidas sobre objetos da classe
>> SpatialPolygonsDataFrame.
>> Tenho arquivos em formato shapefile, que é considerado pelo R como um
>> objeto da classes polígono espacial, e este tem
>> alguns slot's
>> como "labpt" e "area". Então venho pedir ajuta em duas questões.
>>
>> 1º Qual a função, e o pacote, que me fornecerá apenas o slot "coords"
>> ?
>>
>> Sei existe uma forma de fazer com que o programa selecione
>> as coordenadas de polígono, atualmente utilizo a
>> função scan(), mas
>> gostaria de
>> utilizar uma outra.
>>
>>
>> 2º Caso venha a conseguir alguma estimativa, Kernel e.g., existirá
>> um viés
>> se os dados não tiverem projeção ?
>>
>> Na cartografia, mais especificamente no ArcMAP, utilizo o sistema
>> de coordenadas adotado atualmente pelo IBGE
>> (SIRGAS 2000), no R
>> esse processo está em desenvolvimento.
>>
>>
>> Abraço a todos.
>>
>>
>>
>>
>> ______________________________**_________________
>> R-br mailing list
>> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>> https://listas.inf.ufpr.br/**cgi-bin/mailman/listinfo/r-br<https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br>
>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-**guia<http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia>)
>> e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>>
>>
>>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
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Message: 9
Date: Thu, 25 Aug 2011 08:53:12 -0300
From: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] [OFF- Dúvida] Linguagem de programação para trabalhar
com estatística.
Message-ID:
<CAKwavr=E4ek4iJW-eObwQOvKWkGZx9DdvJNr+AcXxQGSZW5Ljw@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Pessoal qual seria uma outra boa linguagem de programação para se trabalhar
com estatística? Estudo C já faz algum tempo e vi ser bastante interessante
pelo fato de puder unir C com o R. Estava pensando em migrar para o C++,
será que é mais interessante? Existe outras linguagens de programação que
vocês indicam?

--
Saudações,
Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
Currículo Lattes:
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4250792T6
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Message: 10
Date: Thu, 25 Aug 2011 08:53:28 -0300
From: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] Pedro Rafael convidou você para abrir uma conta de
e-mail do Google
Message-ID:
<CAKwavrmoEjirnh+=uDN1Jx7ubXgYs_EAZxL9jWa4GASf++k9ng@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Estou usando o Gmail e acho que vale a pena conferir. Isto é um convite para
você criar uma conta.

Você recebeu um convite para o Gmail!

Pedro Rafael convidou você para abrir uma conta do Gmail.

O Gmail é o serviço de e-mail gratuito do Google, desenvolvido com base na
ideia de que o e-mail pode ser intuitivo, eficiente e divertido. O Gmail
tem:

*Menos spam*
Mantenha as mensagens indesejadas fora da sua caixa de entrada com a
tecnologia inovadora do Google.

*Muito espaço*
Espaço de armazenamento suficiente para que você nunca precise excluir uma
mensagem.

*Bate-papo integrado*
Converse por vídeo ou texto com Pedro Rafael e outros amigos em tempo real.

*Acesso pelo celular*
Receba seus e-mails onde estiver com o Gmail no celular.

Você pode até mesmo importar seus contatos e mensagens do Yahoo!, do
Hotmail, do AOL ou de qualquer outro webmail ou conta POP.

Quando você criar sua conta, Pedro Rafael receberá uma notificação sobre seu
novo endereço do Gmail para que vocês mantenham contato. Saiba
mais<http://mail.google.com/mail/help/intl/pt_BR/about.html>ou comece
agora<http://mail.google.com/mail/a-3b4fd3d7b1-e4e8f2bf80-mBMo5xYWFYZNoKIRvN68yIo5t3Y>
!
Inscreva-se<http://mail.google.com/mail/a-3b4fd3d7b1-e4e8f2bf80-mBMo5xYWFYZNoKIRvN68yIo5t3Y>

Google Inc. | 1600 Amphitheatre Parkway | Mountain View, California 94043
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Message: 11
Date: Thu, 25 Aug 2011 08:02:45 -0400
From: Gilson Sanchez <gilsonsch@gmail.com>
To: Grupo R-Br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] [OFF TOPIC] - Learn R Webinar
Message-ID:
<CAJATvULeM74-TR9X3CyN1LJg3hi_Ky=1dVrned78Q9FG=HKbww@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Pode ser que alguem esteja precissando umas aulas complementares ou reforço
com o R, hoje terá mais um webinar, é minsitrado em inglês.

Abç's

---------- Forwarded message ----------
From: Paul H Geissler <phgeissler@usgs.gov>
Date: Wed, Aug 24, 2011 at 6:22 PM
Subject: Learn R Webinar Tomorrow
To:

We now have our GoToWebinar license reinstated, but that meant that we have
TWO webinars scheduled for tomorrow. To avoid confusion, I canceled one of
them. However, that may add to the confusion, because you will get both a
reminder of the webinar and another saying that it is canceled.

We will go with the webinar that Tom scheduled, rather than switching back
to the old one. If you have not registered, the link to register is *
https://www1.gotomeeting.com/register/511594025*<https://www1.gotomeeting.com/register/511594025>
After you register, the system will send you a link to join. Tom,
again,
thank you very much for making the webinar available at such short notice.

Sorry about all the confusion.

On Thursday, August 25 we will cover Topic 13 - spatial statistics and
survival analysis, Crawley (2007) Chapters 24 and 25. The script is at
ftp://ftpext.usgs.gov/pub/cr/co/fort.collins/Geissler/LearnR/LearnR11a-13.R

Cheers,
Paul
-------------------------------------------------------------------
Paul H. Geissler, Ph.D.
USGS Status & Trends of Biological Resources Program
Coordinator, National Park Monitoring Project
Assistant Program Coordinator
USGS Fort Collins Science Center
2150 Centre Ave., Building C
Fort Collins, CO 80526-8118
970-226-9482, FAX 970-226-9452
Paul_Geissler@usgs.gov
Do NOT send e-mail to PGeissler@usgs.gov (NOT me)
Home: 720-890-8785 Cell:303-815-9425
Personal email: PaulGeisslerCo@gmail.com

It is easy to lie with statistics.
It is hard to tell the truth without statistics.
Andrejs Dunkels, quoted by Maindonald & Braun

--
Eng. Agr.Gilson Sánchez Chia, MSc.

Laboratório de Fisiologia Vegetal

Embrapa Amazônia Ocidental

Fone: (92) 3303-7841
---
Antes de imprimir, pense na sua responsabilidade com o Meio Ambiente.
Please consider the environment before printing this email.
Renew, Reduce and Recycle. The Planet Knows.
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Message: 12
Date: Thu, 25 Aug 2011 09:17:58 -0300
From: Leandro Marino <leandromarino@leandromarino.com.br>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] Plotar dados em Mapa
Message-ID:
<CAKSaaFnX3faWvdzgt2heC0KH8EPKip=3BnaxYJr4Vqi2T2nR6w@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="windows-1252"

Caros,

Mais uma vez venho pedir um caminho... Tenho um indicador por município que
gostaria que fosse ?plotado? em um mapa do Brasil aonde tivesse uma escala
de cores para cada um dos níveis deste indicador. Sei que existe alguma
forma de fazer, no entanto, nunca trabalhei com mapas no R e não sei nem por
onde começar (Pacote, Função e principalmente MAPA).

Agradeço qualquer ajuda!!!

Um abraço

Leandro

Atenciosamente,
Leandro Marino
http://www.leandromarino.com.br (Fotógrafo)
http://est.leandromarino.com.br/Blog (Estatístico)
Cel.: + 55 21 9845-7707
Cel.: + 55 21 8777-7907
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Message: 13
Date: Thu, 25 Aug 2011 10:02:08 -0300
From: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] [Dúvida] Invocar funções C++ no R
Message-ID:
<CAKwavrm=aWvvtRMrHzSAjPAjr4F7=ZbXi7DEw=+Cc3dU2W-gTg@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Como se procede para importar uma função C++ ou até mesmo C para o R?

--
Saudações,
Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
Currículo Lattes:
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4250792T6
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------------------------------

Message: 14
Date: Thu, 25 Aug 2011 14:19:01 +0100
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Invocar funções C++ no R
Message-ID:
<CAO-arWMq0Z8r=oUR++ahXt5cKWuW=2qvZ=g6qO2Z0H3uS2WM0g@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

Sua funcao C++ precisa estar contida numa chamada extern...

extern "C" {
void suaFuncao () ......
}

Depois de compila-la, vc a chama com .C()

Sua funcao em C nao precisa do wrapper e pode ser compilada
diretamente e chamada via .C().

Para detalhes e tambem exemplos, veja o capitulo 5 do manual Writing R
Extensions.

Nao faz muito tempo, eu postei aqui um link para um material que
tambem inclui exemplos de uso de codigo C em R... e inclui outra opcao
de chamada, .Call().

b

------------------------------

Message: 15
Date: Thu, 25 Aug 2011 10:25:39 -0300
From: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Invocar funções C++ no R
Message-ID:
<CAKwavr=eL9S0EnPku4o5YppZ3mr6Dy2vCZJVXnkvoc1cwuojcQ@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Obrigado Benilton pela ajuda. Vou dar uma olhada no material do CRAN e
tentar encontrar o material que você postou aqui na comunidade.

Saudações,
Pedro Rafael Diniz Marinho

Em 25 de agosto de 2011 10:19, beniltoncarvalho [via R-br] <
ml-node+3768192-710127126-223914@n4.nabble.com> escreveu:

> Sua funcao C++ precisa estar contida numa chamada extern...
>
> extern "C" {
> void suaFuncao () ......
> }
>
> Depois de compila-la, vc a chama com .C()
>
> Sua funcao em C nao precisa do wrapper e pode ser compilada
> diretamente e chamada via .C().
>
> Para detalhes e tambem exemplos, veja o capitulo 5 do manual Writing R
> Extensions.
>
> Nao faz muito tempo, eu postei aqui um link para um material que
> tambem inclui exemplos de uso de codigo C em R... e inclui outra opcao
> de chamada, .Call().
>
> b
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3768192&i=0>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
>
> ------------------------------
> If you reply to this email, your message will be added to the discussion
> below:
>
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Invocar-funcoes-C-no-R-tp3768159p3768192.html
> To unsubscribe from R-br, click here<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw>.
>
>

--
Saudações,
Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
Currículo Lattes:
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4250792T6
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------------------------------

Message: 16
Date: Thu, 25 Aug 2011 14:34:26 +0100
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Invocar funções C++ no R
Message-ID:
<CAO-arWMc=estcahNyV7oM8NnHuK1TULeZSnnLde8A9j0eh5D0A@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

Procure pelo thread chamado: "Pacotes e C, Fortran ou outros".

------------------------------

Message: 17
Date: Thu, 25 Aug 2011 10:45:56 -0300
From: Pedro Rafael <pedro.rafael.marinho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Invocar funções C++ no R
Message-ID:
<CAKwavrnPzPTcZkFYjs-3qoRU4mqLKhUBMBsVxrH2LYXnN4L9NQ@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

To olhando o exemplo abaixo:

void convolve(double *a, int *na, double *b, int *nb, double *ab)
{
R_len_t i, j, nab = *na + *nb - 1;

for(i = 0; i < nab; i++)
ab[i] = 0.0;
for(i = 0; i < *na; i++)
for(j = 0; j < *nb; j++)
ab[i + j] += a[i] * b[j];
}

called from R by

conv <- function(a, b)
.C("convolve",
as.double(a),
as.integer(length(a)),
as.double(b),
as.integer(length(b)),
ab = double(length(a) + length(b) - 1))$ab

Não estou conseguindo rodar. Devo gerar um arquivo .o ou o R tem algum
compilador por trás para ler o código? Estou perdido :(

Pedro

Em 25 de agosto de 2011 10:39, beniltoncarvalho [via R-br] <
ml-node+3768249-113061051-223914@n4.nabble.com> escreveu:

> Procure pelo thread chamado: "Pacotes e C, Fortran ou outros".
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=3768249&i=0>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
>
> ------------------------------
> If you reply to this email, your message will be added to the discussion
> below:
>
> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Invocar-funcoes-C-no-R-tp3768159p3768249.html
> To unsubscribe from R-br, click here<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw>.
>
>

--
Saudações,
Pedro Rafael Diniz Marinho - Estatístico SES-PB
Currículo Lattes:
http://buscatextual.cnpq.br/buscatextual/visualizacv.jsp?id=K4250792T6
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Message: 18
Date: Thu, 25 Aug 2011 10:56:22 -0300
From: Jakson Alves de Aquino <jalvesaq@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Plotar dados em Mapa
Message-ID:
<CAGBu4CP3Zg=ezdPAiRNwxw-+SHP20N_TE409N3i-SEZCsy73sQ@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8

2011/8/25 Leandro Marino <leandromarino@leandromarino.com.br>:
> Mais uma vez venho pedir um caminho... Tenho um indicador por município que
> gostaria que fosse ?plotado? em um mapa do Brasil aonde tivesse uma escala
> de cores para cada um dos níveis deste indicador. Sei que existe alguma
> forma de fazer, no entanto, nunca trabalhei com mapas no R e não sei nem por
> onde começar (Pacote, Função e principalmente MAPA).

Tem um exemplo de como fazer isso no capítulo sobre mapas do R para
Cientistas Sociais:

http://www.lepem.ufc.br/aquino.php

Espero que lhe ajude...

Jakson

------------------------------

Message: 19
Date: Thu, 25 Aug 2011 15:05:58 +0100
From: Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Invocar funções C++ no R
Message-ID:
<CAO-arWOJXrNeYg4U3ZiGsP2F7QU05yg97W5YvEuFrAx2czVYwg@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-1

A primeira parte (tudo dentro do void convolve) e' uma funcao em C.

Vc precisa te-la num arquivo como: convolve.c

Depois, vc precisa ter compiladores C instalados no seu computador.

Dai' compilar o codigo usando: R CMD SHLIB convolve.c

Isso vai gerar um .so, que vc carregara' dentro do R usando dyn.load()

Uma vez carregado no R, vc pode usar o .C().

Note que isso sera' um pouco mais complexo em Windows... E vc vai
precisar instalar um bundle chamado RTools, possivelmente setar
algumas variaveis de ambiente e substituir "R CMD" por Rcmd... mas
isso, alguem q use Windows eh quem tem condicoes de explicar em
detalhes.

b

------------------------------

Message: 20
Date: Thu, 25 Aug 2011 07:17:29 -0700 (PDT)
From: Emmanuel Arnhold <emmanuelarnhold@yahoo.com.br>
To: R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Agrupamento de Tocher no R
Message-ID:
<1314281849.70363.YahooMailNeo@web43143.mail.sp1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Alguém conhece função no R para construir o agrupamento de Tocher? Aproveitando ... alguma função do R obtem a distância euclidiana média? Conheço algumas que fazem apenas a distância euclidiana, como a vegdist() e dist().

Obrigado por qualquer dica.

Emmanuel
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Message: 21
Date: Thu, 25 Aug 2011 11:38:30 -0300
From: Leandro Marino <leandromarino@leandromarino.com.br>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Plotar dados em Mapa
Message-ID:
<CAKSaaF=r61P9LWAf2P4iYyh9Zi5vVOYD-7_OgMnR-j=ciEn7yA@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="windows-1252"

*Jackson,

já foi de grande ajuda! Muito obrigado!

Aproveitando, tenho os shapefiles do BR por Municipio e tenho outro por UF.
Gostaria de saber se existe uma possibilidade de plotar os resultados que
tenho por municipio, mas aparecendo as linhas das divisões do estados
apenas. É possível?!

Seria o equivalente no exemplo de sua apostila a plotar o mapa do brasil com
as cores das dos estados nas regiões mas apenas com a linha de divisão entre
as regiões, ou seja, sem as divisões estaduais.

*Atenciosamente,
Leandro Marino
http://www.leandromarino.com.br (Fotógrafo)
http://est.leandromarino.com.br/Blog (Estatístico)
Cel.: + 55 21 9845-7707
Cel.: + 55 21 8777-7907

Em 25 de agosto de 2011 10:56, Jakson Alves de Aquino
<jalvesaq@gmail.com>escreveu:

> 2011/8/25 Leandro Marino <leandromarino@leandromarino.com.br>:
> > Mais uma vez venho pedir um caminho... Tenho um indicador por município
> que
> > gostaria que fosse ?plotado? em um mapa do Brasil aonde tivesse uma
> escala
> > de cores para cada um dos níveis deste indicador. Sei que existe alguma
> > forma de fazer, no entanto, nunca trabalhei com mapas no R e não sei nem
> por
> > onde começar (Pacote, Função e principalmente MAPA).
>
> Tem um exemplo de como fazer isso no capítulo sobre mapas do R para
> Cientistas Sociais:
>
> http://www.lepem.ufc.br/aquino.php
>
> Espero que lhe ajude...
>
> Jakson
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
-------------- Próxima Parte ----------
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------------------------------

Message: 22
Date: Thu, 25 Aug 2011 11:50:57 -0300
From: Rodrigo Plei <rodrigo.plei@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Plotar dados em Mapa
Message-ID:
<CACs_BFOdc9bKRRTUN2O2+VZsNrB4C0JH-UqxMpd+Lit-0XjBow@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"

Pessoal,

Aproveitando o gancho... Onde eu posso arrumar dados de mapas do litoral
sudeste-sul do Brasil (com as batimetrias de 100, 200, 500 e 1000 m) para
poltar com o R?

Cheers,

R.

--
=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->=8-->

Rodrigo Silvestre Martins, PhD
Bolsista FAPESP Pós-Doutorado

Laboratório de Ecossistemas Pesqueiros (LabPesq)
Universidade de São Paulo, Instituto Oceanográfico
Praça do Oceanográfico, 191. Cidade Universitaria (sala 107-A/B)
Butantã - São Paulo/SP, Brasil
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