Senhores, boa tarde! Não sei se ajuda, mas relacionei os pontos que eu particularmente considero no gerenciamento da memória do R. É baseado em minha experiência pessoal limitada e restrita ao R no Windows. Incremento de memória livre no R: 1) em máquinas com arquitetura 64-bits, utilizar software 64-bits: - 32-bit R no 32-bit Windows: 2Gb (3Gb*). - 32-bit R no 64-bit Windows: 4Gb. - 64-bit R no 64-bit Windows: 8Tb. 2) verificar se memory.limit() corresponde à memória física instalada (64-bits) - o upgrade de memória posterior a instalação do R pode não ser detectado - reinstalar 3) instalar mais memória física (considerando limites do item 1) - reinstalar 4) verificar a possiblidade de selecionar somente parte dos dados (subsets): - antes de importar: comandos de linha (grep, cut, sed) ou gerenciadores de banco de dados (SQLite, MySQL) - na importação, restringindo linhas e colunas - após importar, criando objetos menores com subset(), RSQLite. 5) rever processamento e programação: - evitar criar, duplicar objetos desnecessariamente - apagar objetos que não estiver usando - rm() - evitar instruções for() - vetorizar cálculos - preferir funções da família _apply 6) solicitar periodicamente a limpeza da memória ao S.O. (garbage collection) - gc(), gc(reset=TRUE) 7) eventualmente - reiniciar o R - No RStudio: Session -> Restart R (Crtl+Shift+F10) 8) utilizar pacotes que carregam dados diretamente do disco, liberando RAM : ff, bigmemory, SOAR 9) utilizar pacotes voltados para manipulação de bigdata tal como data.table ================================================ Éder Comunello PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W] Em 28 de janeiro de 2016 12:34, Leonardo Ferreira Fontenelle < leonardof@leonardof.med.br> escreveu:
Qual é o seu sistema operacional, e com quantos bits (32, 64) trabalham seu computador, seu sistema operacional e sua versão do R?
Essa página não ajuda? https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/Memory-limits.html
Abraços,
Leonardo Ferreira Fontenelle <http://lattes.cnpq.br/9234772336296638>
Em Qua 27 jan. 2016, às 13:14, Wagner Tassinari escreveu:
Olá pessoal,
Como faço para liberar mais memoria para o R rodar ?
Estou utilizando os comandos:
memory.size() [1] 3306.77 memory.size(TRUE) [1] 3995 memory.limit() [1] 32676
Obrigado -- Wagner S. Tassinari Departamento de Matemática Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro. BR-465, Km 7 - Seropedica, RJ - Brasil CEP: 23890-000 Skype: wagner.tassinari wtassinari@gmail.com tassinari@ufrrj.br ------------------------------------------------------- "Statistical thinking will one day be as necessary for efficient citizenship as the ability to read and write." (H.G.Wellis) *_______________________________________________* R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
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