Pois é Bruno eu já havia pesquisado aqui e achei este pacote também, mas comparando com outros não batem  matriz que procuro! 

x1 <- c(131.37, 132.37, 134.47, 135.50, 136.17)
x2 <- c(133.60, 132.70, 133.80, 132.30, 130.33)
x3 <- c(99.17, 99.07, 96.03, 94.53, 93.50)
x4 <- c(50.53, 50.23, 50.57, 51.97, 51.37)
x <- cbind(x1, x2, x3, x4)
require(StatMatch)
D2=mahalanobis.dist(x)
D2
d2=as.matrix(D2) 
d2
d=as.dist(d2) 
d
         1        2        3        4
2 2.828427                           
3 2.828427 2.828427                  
4 2.828427 2.828427 2.828427         
5 2.828427 2.828427 2.828427 2.828427

require(biotools)  
x1 <- c(131.37, 132.37, 134.47, 135.50, 136.17)
x2 <- c(133.60, 132.70, 133.80, 132.30, 130.33)
x3 <- c(99.17, 99.07, 96.03, 94.53, 93.50)
x4 <- c(50.53, 50.23, 50.57, 51.97, 51.37)
x <- cbind(x1, x2, x3, x4)
Cov <- matrix(c(21.112,0.038,0.078,2.01, 0.038,23.486,5.2,2.844,0.078,5.2,24.18,1.134, 2.01,2.844,1.134,10.154), 4, 4)  # Não entendi como foi calculada tal matriz Cov tentei var(x) e não bateu com Cov! 
D2=D2.dist(x, Cov)
D2
           1          2          3          4
2 0.09103867                                 
3 0.90451337 0.73086040                      
4 1.88407643 1.59779871 0.44281866           
5 2.69996452 2.17905736 0.91121818 0.21984612





André Oliveira Souza.

Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES






Em Quarta-feira, 24 de Junho de 2015 21:07, bruno vidigal <caetano.vidigal@gmail.com> escreveu:




Andre, tenta assim

install.packages("StatMatch")
library(StatMatch)

mahalanobis.dist(iris[1:6,1:4])

Em 24 de junho de 2015 18:54, David Feitosa <contato@davidfeitosa.com> escreveu:
Desconheço essa "mahalanobis",
mas eu precisei criar um dendograma uma vez para plotar um gráfico e
criei baseado num list e na documentação.


Em 24 de junho de 2015 16:28, Cleber Borges <klebyn@yahoo.com.br> escreveu:
mahalanobis




Atenciosamente,

David F.

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Bruno C. Vidigal

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