Euriann,

Eu subi o script de látice agora compatível com a versão atual do pacote doBy: http://leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/cnpaf2/lat-update.R. Ele contorna o problema LSmeans/popMeans, cria o intervalo de confiança que foi removido pelo autor e contorna o suporte aos objetos vindos da nlme.

À disposição.
Walmes.