Juraci, dê uma olhada nas funções ?aov, ?lme e ?lmer.

Além disso a sua pergunta não esclarece o que você precisa. O bom seria você enviar um exemplo dos seus dados. O experimento que você está realizando tem medidas repetidas ou não?

Por exemple, para analisar a variância em um quadrado latino simples, você pode usar assim:

out <- aov(time~participante+modo)

summary(out)

2013/3/30 Juraci Mendes Moreira <juracimendesmoreira@yahoo.com.br>

como fazer analise de variancia em quadrado latino. qual o comando de anana

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