Ana, confira se tu ta chamando as variáveis corretas. Note que tu pode executar isso de outras maneiras (mais simples até), como chamar as colunas que tu quer ao invés de remover as que tu nao quer: dados <- read.table(text='Casos|DoseTH9|DoseTH6|DoseTH3|DoseTC3|DoseTC6|DoseTC9 54020104|930|900|900|390|1170|2700 54020178|1860|930|900|420|840|630 54020303|1860|2790|2700|1620|1440|1530 54020492|930|930|900|420|840|720 54020637|1080|480|870|2970|2700|2520 54020698|2790|1590|930|390|720|2340 54020714|930|930|900|390|390|390 54030032|1860|750|780|720|780|720 54030048|3720|3720|3600|840|840|840 54030135|780|420|60|390|390|420 54030164|2700|2790|2790|720|780|360 54030208|930|930|900|420|420|360 54030297|2700|3720|3720|1170|1170|540 54030300|1860|930|900|420|420|720 54030303|930|930|1800|420|750|780 54030338|930|900|930|390|360|390 54030344|1680|1860|1860|780|780|840 54030349|1860|1800|1800|840|780|780 54030358|360|390|270|150|150|60', header=TRUE, sep='|') dados[, -c(1, 2, 3, 6, 7)] # Teu código, chamou as certas aqui dados[, c(4, 5)] # Sugestão pela posição da coluna dados[, c('DoseTH3', 'DoseTC3')] # Sugestão pelo nome da coluna