
Vou cuidar melhor dos CMR, Benilton. Tem como não incluir os nomes das colunas no PCA? Como fica a organização? Benilton, reproduzi a análise sem os cabeçalhos, conforme você sugeriu, mas também não houve sucesso. #carreguei meus dados conforme, mas agora indiquei que não existe cabeçalho
read.table(file = "clipboard", header = F, sep = "\t", dec = ",")-> TSF TSF #chequei os nomes das colunas para confirmar names(TSF) [1] "V1" "V2" "V3" "V4" "V5" "V6" "V7" "V8" "V9" "V10" "V11" "V12" "V13" #rodando o PCA model <- prcomp(TSF, scale = TRUE) Erro em svd(x, nu = 0) : infinite or missing values in 'x'
Em 9 de junho de 2013 01:50, Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com>escreveu:
Vc tem certeza que quer incluir "Label" na PCA? E ja' que estamos no assunto, Acet tambem? A variavel Label e' texto e calcular media de texto e' indefinido, portanto a falha... Sobre 'Acet', veja o seu banco de dados e infira o motivo da minha sugestao.
Deixo tbm uma recomendacao para leitura: https://gist.github.com/benilton/1088208
b
Em 9 de junho de 2013 01:41, Vinícius Lionel Mateus <vinynegrelli@gmail.com> escreveu:
Simone, Obrigado testei a classe do objeto e realmente é um data.frame.
Para tornar o exemplo mais reprodutível, compartilho o link dos dados: https://www.dropbox.com/s/qopz8pg29pe3z3p/2013%2005%2009%20PCA_R.xls
Em 7 de junho de 2013 22:37, Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica@gmail.com> escreveu:
Bom, eu não chutei nada, só estou interpretando a saída do R. Mas, algo mais reproduzível ajudaria mais.
Abraços
Em 7 de junho de 2013 22:36, Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com> escreveu:
Se o exemplo fosse de fato reproduzível, ninguém ficaria chutando qual é o problema....
On Jun 7, 2013 10:28 PM, "Sérgio Henrique almeida da silva ju" <sergio.edfisica@gmail.com> wrote:
Simone
Tanto faz você trabalhar com data.frame ou matriz, basta a variável estar como numérica.
Abraços
Em 7 de junho de 2013 22:25, Simone D. Sartorio <sisartorio@yahoo.com.br> escreveu:
Na verdade Sérgio, como vc está fazendo uma ACP, seu "x" deve ser uma matriz e provavelmente seu "x" está como um data.frame
Verifique a classe do seu "x" assim:
class(x)
Se a resposta for diferente de uma matriz, pronto, é só transformar
seu
x em 1 matriz! ok?
abraços Si
***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***
* Simone Daniela Sartorio * Professora Adjunta I da UFSCar, Centro de Ciências Agrárias, Campus Araras/SP. * Doutora e Mestre em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/USP; * Licenciada em Matemática - UNESP/Rio Claro.
***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***
Tenha um bom dia! ;)
________________________________ De: Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica@gmail.com> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br Enviadas: Sexta-feira, 7 de Junho de 2013 21:21 Assunto: Re: [R-br] Remover NA: PCA
O R esta entendendo que sua variavel não é numérica. Tente Tsfa$x = as.numeric(Tsfa$x) Em 07/06/2013 20:52, "Vinícius Lionel Mateus" <
vinynegrelli@gmail.com>
escreveu:
Prezados,
Estou executando o seguinte CRM:
read.table(file = "clipboard", header = TRUE, sep = "\t", dec = ",")-> TSF > TSF > names(TSF) [1] "Date" "Label" "PMF" "BC" "Acet" "Form" "Cl." "NO3." "PO43." "SO42." "Na." "K." [13] "Mg2." "Ca2." "NH4." > TSFa <- TSF[,2:15] > model <- prcomp(TSFa, scale = TRUE) Erro em colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' deve ser numérico > model <- prcomp(TSFa, na.rm = TRUE, scale = TRUE) Erro em colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' deve ser numérico
Tentei diferentes métodos para remover o "NAs", mas não obtive sucesso. Alguém tem alguma dica?
-- Vinícius -- -- Atenciosamente,
VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665 ) Bacharel em Química - Doutorando em Química Analítica Laboratório de Química Atmosférica - Departamento de Química Pontifícia Universidade Católica - Rio de Janeiro (PUC - Rio) Rua Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brasil CEP.: 22451-900 Telefone: (+55) (21) 3527-1327 (+55) (21) 9358-8051 www.puc-rio.br
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Sérgio Henrique Almeida da Silva Junior Doutorando em Epidemiologia em Saúde Pública Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca - ENSP/FIOCRUZ http://lattes.cnpq.br/1611345552843383 Tel: (21) 68463637 http://www.linkedin.com/profile/view?id=250437145&trk=tab_pro
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Sérgio Henrique Almeida da Silva Junior Doutorando em Epidemiologia em Saúde Pública Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca - ENSP/FIOCRUZ http://lattes.cnpq.br/1611345552843383 Tel: (21) 68463637 http://www.linkedin.com/profile/view?id=250437145&trk=tab_pro
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Vinícius -- -- Atenciosamente,
VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Bacharel em Química - Doutorando em Química Analítica Laboratório de Química Atmosférica - Departamento de Química Pontifícia Universidade Católica - Rio de Janeiro (PUC - Rio) Rua Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brasil CEP.: 22451-900 Telefone: (+55) (21) 3527-1327 (+55) (21) 9358-8051 www.puc-rio.br
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-- Vinícius -- -- Atenciosamente, VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665) Bacharel em Química - Doutorando em Química Analítica Laboratório de Química Atmosférica - Departamento de Química Pontifícia Universidade Católica - Rio de Janeiro (PUC - Rio) Rua Marquês de São Vicente, 225, Gávea - Rio de Janeiro, RJ - Brasil CEP.: 22451-900 Telefone: (+55) (21) 3527-1327 (+55) (21) 9358-8051 www.puc-rio.br