Carlos, boa noite!Você chegou a ler as imagens com raster ou rgdal? Em que ponto exatamente está com problemas? Na leitura ou no fatiamento?Dá pra fatiar o objeto criado por raster ao invés daquele criado por rgdal...
O link que segue tem algumas considerações sobre o uso de rgdal() e raster para leitura de imagens do ETOPO1. Comenta sobre causas de erro e dá algumas opções.http://r-sig-geo.2731867.n2.nabble.com/Import-Part-of-a-GeoTiff-using-readGDAL-rgdal-td5325799.html
Espero que ajude,
================================================
Éder Comunello
Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ)
Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W]
Researcher at Embrapa Western Region AgricultureDourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]================================================
UTC-03:00
Em 20 de novembro de 2012 16:51, <r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br> escreveu:
Enviar submissões para a lista de discussão R-br para
r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Para se cadastrar ou descadastrar via WWW, visite o endereço
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
ou, via email, envie uma mensagem com a palavra 'help' no assunto ou
corpo da mensagem para
r-br-request@listas.c3sl.ufpr.br
Você poderá entrar em contato com a pessoa que gerencia a lista pelo
endereço
r-br-owner@listas.c3sl.ufpr.br
Quando responder, por favor edite sua linha Assunto assim ela será
mais específica que "Re: Contents of R-br digest..."
Tópicos de Hoje:
1. Re: excluir mar no ETOPO (Thiago Veloso)
2. Re: excluir mar no ETOPO (D'Apolito)
3. Graficos de decomposição (kaue veras)
4. Re: Gráfico de distribuiçoes estimadas (Matheus Monteiro)
5. Re: (sem assunto) (Edson Lira)
6. Re: Usando o R em grandes bases de dados (Leonard de Assis)
7. matrizes de correlação (alanarocha@sapo.pt)
8. ExpDes - Comparações múltiplas (Andre Oliveira)
9. Re: ExpDes - Comparações múltiplas (Walmes Zeviani)
10. Re: Dúvida sobre IC simultâneos para modelagem de variáveis
binarias no R (multcomp) (Walmes Zeviani)
11. Re: Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu
10.04 (Andre Oliveira)
12. Re: Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu
10.04 (Andre Oliveira)
13. Dúvida em summary em regressão logística (Alexandre Santos)
14. Dúvida em summary em regressão logística (Alexandre Santos)
----------------------------------------------------------------------
Message: 1
Date: Tue, 20 Nov 2012 07:22:57 -0800 (PST)
From: Thiago Veloso <thi_veloso@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] excluir mar no ETOPO
Message-ID:
<1353424977.92989.YahooMailNeo@web121903.mail.ne1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Carlos,
Eu tentaria algo assim:
library (raster) #carrega pacote exigido
r <- raster('ETOPO1_Ice_g_geotiff.tif') #carrega arquivo de trabalho
r [ r<0 ] <- NA #atribui NA a todos os valores negativos no raster.
E caso você queira atribuir NA a um escopo de valores, pode ser mais fácil criar uma função:
vals <- c(0,24,32,56) # estes são os valores que você quer eliminar da tabela de dados do raster
fun <- function (x) {
x <- ifelse (x %in% vals, 1, NA) # aqui você substitui os valores acima por "1" e atribui NA para todo o resto. Você pode substituir o "1" por vals
}
E então aplicá-la sobre o raster:
r.new <- calc (r, fun)
Uma vantagem de usar funções é pode realizar uma tarefa para diversos arquivos sem precisar repetir comandos para cada um deles.
Espero que ajude,
Thiago.
________________________________
From: D'Apolito <carlosdapolito@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Sent: Monday, November 19, 2012 8:15 PM
Subject: [R-br] excluir mar no ETOPO
Prezados,
Estou graficando mapas com os dados do ETOPO01 de elevação e gostaria de excluir o mar, para que os dados iniciem em zero ao invés de números negativos (profundidades dos oceanos).
Qualquer ajuda é bem vinda, desde já agradeço
Att
Carlos
#código:
library(raster)
library(rgdal)
etopo<-"ETOPO1_Ice_g_geotiff.tif"
r.etopo<-raster(etopo)
ext <- extent(-95,-35,-31,31)
zoom(r.etopo, ext=ext,col=rev(gray.colors(12)))
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/675bda4e/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 2
Date: Tue, 20 Nov 2012 15:22:24 +0000
From: "D'Apolito" <carlosdapolito@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] excluir mar no ETOPO
Message-ID:
<CAObczOaGmp3ug9u_ktRu7ZfSgoQ3XUFD9V8yg=440j-wZhVkuQ@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Ola Eder,
O arquivo de origem dos dados (ETOPO1) `e muito grande, de maneira que
tenho obtido erro constantemente, Tentei aumentar a capacidade da memoria
com memory.limit() mas tambem nao funcionou.
att
Carlos
Em 20 de novembro de 2012 11:30, Eder Comunello <ecomunel@gmail.com>escreveu:
> Carlos e colegas, bom dia!
>
> Vou aproveitar um script anterior, fazendo algumas alterações. Como da
> outra vez, creio que dá pra adaptar facilmente pro seu caso.
>
> Vou trabalhar extraindo o vetor de interesse, substituindo este vetor no
> objeto origem ao final...
>
> ##### <begin> #####
> require(sp); require(rgdal)
>
> ### Download do exemplo (399 Kb)
> download.file('https://dl.dropbox.com/u/117618178/dourados/DDOS.tif',
> file.path(getwd(),'DDOS.tif'), mode='wb')
>
> alt = readGDAL("DDOS.tif"); gridded(alt) ### 'importa' o geotiff
> image(alt, col=terrain.colors(21)) ## visualização
> slotNames(alt) ### nome dos slots (S4)
> proj4string(alt) ### projeçãoo definida no geotiff
> head(alt@data) ### observe os valores dos dados
> head(alt@data$band1) ### observe os valores dos dados
>
> ### Opção para fatiar (0 ou 1)
>
> alt2 <- alt ### para manipular uma cópia do objeto
> z <- alt2@data$band1 ### para manipular apenas o vetor de interesse
> n <- length(z); n
>
> for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=0} else{z[i]=1}}; head(z) ### 0 ou 1
> alt2@data$band1 <- z ### substitui o vetor manipulado no objeto
> image(alt2) ## visualização
>
> ### Opção para mascarar valores abaixo de critério (com 0 ou NA)
>
> alt3 <- alt ### para manipular outra cópia do objeto
> z <- alt3@data$band1 ### para manipular apenas o vetor de interesse
> n <- length(z); n
>
> for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=0}}; head(z) ### 0 ou 1
> #for(i in 1:n){if (z[i]<400){z[i]=NA}}; head(z) ### 0 ou 1
> alt3@data$band1 <- z ### substitui o vetor manipulado no objeto
> image(alt3) ## visualização
> ##### <end> #####
>
>
> ================================================
> Éder Comunello
>
> Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ)
> Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W]
>
> Researcher at Embrapa Western Region Agriculture
> Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]
> ================================================
> UTC-03:00
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
--
_____________________________________
*Carlos D'Apolito - PhD candidate - ID:1239480*
Earth Sciences
School of Geography & Environmental Sciences
Aston Webb Building
University of Birmingham
Birmingham
B15 2TT
UK
phone: 44 - 07 919 673 173
CXD280@bham.ac.uk
CV: http://lattes.cnpq.br/4557754746424026
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/615af15d/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 3
Date: Tue, 20 Nov 2012 14:14:30 -0200
From: kaue veras <kaueveras@gmail.com>
To: R-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] Graficos de decomposição
Message-ID:
<CAENvtmjrMnC52i4-JYn2NdhrwWMNw=Qu0HJLeTOqz2s5q2i6uQ@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Boa tarde prezados,
Estou realizando um trabalho em que utilizo a decomposição, análises de
previsão usando o modelo ARIMA e Holt-Winters e goataria de mudar os
títulos do gráfico e titulos dos eixos. Com os comandos main, xlab e ylab
não esta dando certo, poderiam me dar uma luz ou me ajudar como faço para
gerar essas modificações?
Desde já agradeço.
Atenciosamente,
Kauê P. Veras da Cunha
Estatística - UERJ
MSN: kaueveras@hotmail.com
E-mail: kaueveras@gmail.com
Cel: (21) 8254-9601
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/1154d3e8/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 4
Date: Tue, 20 Nov 2012 14:34:00 -0200
From: Matheus Monteiro <matheusmont@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Gráfico de distribuiçoes estimadas
Message-ID:
<CAAG8985KZaYb24ckqaGFxeon85H3g18ny9gEtBc79DXK7p8mcg@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
mais alguem pode me ajudar?
Em 10 de novembro de 2012 13:21, Edson Lira <edinhoestat@yahoo.com.br>escreveu:
> Mateus, no pacote MASS acho que tem alguns gráficos empírica x teórica.
>
> [. ]'s.
> Edson Lira
> Estatístico
> Ma-Am
>
> Em 10/11/2012, às 02:20, Matheus Monteiro <matheusmont@gmail.com>
> escreveu:
>
> Boa noite, obtive as densidades aproximadas da 't' e da 'normal', gostaria
> de compara-las através de graficos dessas densidades estimadas.
> Alguma sugestão, como faria isso?
>
> *t *
>
> > fitdistr(x[,1],"t")
>
> m s df
>
> -0.001874414 0.009122738 3.522064232
>
> ( 0.001726835) ( 0.001862692) ( 2.234067399)*
>
> **normal*
>
> fitdistr(x[,1],"normal")
>
> mean sd
>
> 0.0001040816 0.0128201843
>
> (0.0018314549) (0.0012950342)
>
>
> x são dados simulados.
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
> código mínimo reproduzível.
>
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/1c03edac/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 5
Date: Tue, 20 Nov 2012 09:06:00 -0800 (PST)
From: Edson Lira <edinhoestat@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] (sem assunto)
Message-ID:
<1353431160.32913.YahooMailNeo@web161205.mail.bf1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Mas Eder a idéia do NA é não considerar estas respostas na contagem e/ou no percentual.
Mas valeu e muito obrigado.
Peço desculpas a todos, esqueci de colocar o assunto na mensagem
Edson Lira
Estatístico
Manaus-Amazonas
________________________________
De: Eder Comunello <ecomunel@gmail.com>
Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Enviadas: Terça-feira, 20 de Novembro de 2012 7:39
Assunto: Re: [R-br] (sem assunto)
Edson e colegas, bom dia!
Ao invés de deixar o campo 'motivo' em branco (NA), experimente atribuir um valor, p. ex. 'sem resposta', e rode novamente. Assim estes casos serão considerados e aparecerão na saída. Vale pros outros campos.
================================================
Éder Comunello
Ph.D. Student in Agricultural Systems Engineering (USP/ESALQ)
Piracicaba, SP, Brazil [22 42.7'S, 47 37.8'W]
Researcher at Embrapa Western Region Agriculture
Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]
================================================
UTC-03:00
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/a9ea6c58/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 6
Date: Tue, 20 Nov 2012 15:30:17 -0200
From: Leonard de Assis <assis.leonard@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Usando o R em grandes bases de dados
Message-ID: <50ABBE29.4030805@gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"; Format="flowed"
Bigmemory eu acredito que lide somente com matrizes, não com data
frames, resumo: todos os campos devem ter o mesmo tipo.
[]s
Leonard de Assis
http://about.me/ldeassis
Em 20/11/2012 03:06, Vinicius Brito Rocha escreveu:
>
> fiquei brincando com o bigmemory e carreguei uma tabela mas os campos
> character vieram como NA.
>
> Quando usava a opção type="char" piorava e alterava os valores dos
> campos numéricos. O melhor ( ou menos pior resultado) foi carregar a
> tabela com a opção type="double"
>
> Alguem sabe o que pode ser?
>
>
> Abs.
>
> Vinicius Brito Rocha
>
> Em 19 de novembro de 2012 15:40, Richard Santos
> <jamesrichardsantos@gmail.com <mailto:jamesrichardsantos@gmail.com>>
> escreveu:
>
> Valeu!! Toda e qq ajuda nesse sentido é bem vinda!
> Abç.
> Richard
>
> Em 19/11/12, Daniel C Bezerra<danielcbezerra@gmail.com
> <mailto:danielcbezerra@gmail.com>> escreveu:
> > Eu encontrei estas apresentações e achei legal dividir com vcs:
> >
> > http://goo.gl/l6fuC
> >
> > Tem link para os slides, código do R e tudo mais por lá.
> >
> > Abs,
> >
> > Daniel
> >
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br <mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e
> forneça código mínimo reproduzível.
>
>
>
>
> --
> /Vinicius Brito Rocha./
> /Estatístico e Atuário (IM / UFRJ)//
> Mestre em Pesquisa Operacional (COPPE / UFRJ)/
>
> www.aplicademic.blogspot.com <http://www.aplicademic.blogspot.com>
> http://twitter.com/viniciusbritor
>
> "Não se preocupe muito com as suas dificuldades em Matemática, posso
> assegurar-lhe que as minhas são ainda maiores." - Albert Einstein.
>
>
>
>
> _______________________________________________
> R-br mailing list
> R-br@listas.c3sl.ufpr.br
> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/b8d49acf/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 7
Date: Tue, 20 Nov 2012 17:51:25 +0000
From: alanarocha@sapo.pt
To: R-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: [R-br] matrizes de correlação
Message-ID:
<20121120175125.Horde.X_LLT3CXF3VQq8MdQ0ASvYA@mail.sapo.pt>
Content-Type: text/plain; charset=UTF-8; format=flowed; DelSp=Yes
Olá, a actualização do R resultou para o meu problema.
agora preciso de ajuda pois tou a tentar fazer uma matriz de
correlação e outra de covariancias de 4 variaveis de um dataframe e
dame estes erros:
##matriz de correlação
cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE)
cor.p
dados=na.omit(dados[,2:4])
cat("valores NA retirados\n")
x11()
pairs(dados)
x11()
boxplot(dados)
dados=dados[,2:4]
x11()
boxplot(dados)
correl=cor(dados[2:4])
result=correl
return(list(sumario=summary(dados),resultado=result))
cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12))
cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value
cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12))
ct <- cor.test(X1s10, X1s12)
ct$p
ct$v
#matriz de covariancias
cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE)
> cor.p<-cor.ps(dados[,2:4], Pearson=TRUE,NAs=TRUE)
Error: could not find function "cor.ps"
> cor.p
Error: object 'cor.p' not found
> dados=na.omit(dados[,2:4])
>
> cat("valores NA retirados\n")
valores NA retirados
>
>
>
>
> correl=cor(dados[2:4])
Error in `[.data.frame`(dados, 2:4) : undefined columns selected
> result=correl
Error: object 'correl' not found
> return(list(sumario=summary(dados),resultado=result))
Error: object 'result' not found
> cor(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12))
Error in cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12) : object 'X1s09' not found
> cor.test(dados[,2:4], method='pearson')$p.value
Error in `[.data.frame`(dados, , 2:4) : undefined columns selected
> cor_with_p_test(cbind(X1s09, X1s10, X1s11, X1s12))
Error: could not find function "cor_with_p_test"
> ct <- cor.test(X1s10, X1s12)
Error in cor.test(X1s10, X1s12) : object 'X1s10' not found
> ct$p
Error: object 'ct' not found
> ct$v
Error: object 'ct' not found
>
> #matriz de covariancias
> cov(dados[,2:4], na.rm=TRUE)
Error in cov(dados[, 2:4], na.rm = TRUE) :
unused argument(s) (na.rm = TRUE)
>
cumprimentos e obrigada Ana Rocha
------------------------------
Message: 8
Date: Tue, 20 Nov 2012 09:57:15 -0800 (PST)
From: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] ExpDes - Comparações múltiplas
Message-ID:
<1353434235.56527.YahooMailNeo@web125902.mail.ne1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Boa tarde,
estou aqui tentando reproduzir algumas análises do ExpDes. A analise abaixo não me deu as comparações múltiplas como faço para tais comparações?
require(ExpDes)
Carregando pacotes exigidos: ExpDes
data(ex1)
attach(ex1)
dic(trat, ig, quali = FALSE, sigF = 0.05)
André Oliveira Souza
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/696d59ab/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 9
Date: Tue, 20 Nov 2012 16:24:10 -0200
From: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br, Andre Oliveira
<andreolsouza@yahoo.com.br>
Subject: Re: [R-br] ExpDes - Comparações múltiplas
Message-ID:
<CAFU=EkZQNQHMTUM2nUKMnJhKTcCoDJ7ngqJ+_69-XZ6mf3FJDQ@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Você usou quali=FALSE, ou seja, está declarando que os níveis são não
qualitativos. Use quali=TRUE e leia o manual.
À disposição.
Walmes.
==========================================================================
Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
fone: (+55) 41 3361 3573
VoIP: (3361 3600) 1053 1173
e-mail: walmes@ufpr.br
skype: walmeszeviani
twitter: @walmeszeviani
homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
linux user number: 531218
==========================================================================
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/6b5bc51b/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 10
Date: Tue, 20 Nov 2012 16:28:49 -0200
From: Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>
To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Dúvida sobre IC simultâneos para modelagem de
variáveis binarias no R (multcomp)
Message-ID:
<CAFU=EkYKvcE65FEpjv=qb0xnJ=mME7ec_8c7DD28wQNPF=1_yg@mail.gmail.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Seu exemplo não é reproduzível. O guia de postagem não recomenda envio de
dados como anexo das mensagens. Hospede os dados na núvem e acrescente
comandos para leitura do arquivo. Assim rapidamente podemos reproduzir sua
análise e ajudar você.
À disposição.
Walmes.
==========================================================================
Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
fone: (+55) 41 3361 3573
VoIP: (3361 3600) 1053 1173
e-mail: walmes@ufpr.br
skype: walmeszeviani
twitter: @walmeszeviani
homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
linux user number: 531218
==========================================================================
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/7d4a7d34/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 11
Date: Tue, 20 Nov 2012 10:30:37 -0800 (PST)
From: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
To: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>,
"r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux
Ubuntu 10.04
Message-ID:
<1353436237.16303.YahooMailNeo@web125901.mail.ne1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux.
André Oliveira Souza
________________________________
De: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
Para: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05
Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04
O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado
André Oliveira Souza
________________________________
De: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
Para: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55
Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04
Olá Andre,
Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os seus problemas.
Quanto ao Windows,
não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized design) e não dic, ou seja
?crd
Veja se funciona.
Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente.
abs
Eric.
Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
Eric,
>
>eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha tentativa no windows!
>require(ExpDes)
>Carregando pacotes exigidos: ExpDes
>> ?dic
>No documentation for ?dic? in specified packages and libraries:
>you could try ???dic?
>
>
> Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito mais prático.
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>André Oliveira Souza
>
>
>
>
>
>
>________________________________
> De: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
>Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br; Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25
>Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu 10.04
>
>
>Olá André,
>
>Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil.
>
>A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1
>
>Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete.
>Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer o André.
>
>Atenciosamente,
>
>Eric.
>
>
>Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
>
>Opa vacilo meu erro no nome do pacote
>>
>>
>> install.packages("ExpDes", dep=T)
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>André Oliveira Souza
>>
>>
>>________________________________
>> De: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
>>Para: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36
>>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu 10.04
>>
>>
>>
>>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia dizer o que pode ser?
>>
>>
>>
>>
>>install.packages("EspDes", dep=T)
>>Installing package(s) into ?/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14?
>>(as ?lib? is unspecified)
>>--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
>>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
>>Mensagens de aviso perdidas:
>>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) :
>> package ?EspDes? is not available (for R version 2.14.1)
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>André Oliveira Souza
>>obrigado
>>
>>
>>_______________________________________________
>>R-br mailing list
>>R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>>
>>_______________________________________________
>>R-br mailing list
>>R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>
>
>--
>Dr Eric B Ferreira
>Exact Sciences Department
>Federal University of Alfenas
>Brazil
>
>
>
--
Dr Eric B Ferreira
Exact Sciences Department
Federal University of Alfenas
Brazil
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/20c67bb9/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 12
Date: Tue, 20 Nov 2012 10:37:54 -0800 (PST)
From: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>, Eric
Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
Subject: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux
Ubuntu 10.04
Message-ID:
<1353436674.31607.YahooMailNeo@web125904.mail.ne1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="utf-8"
Em português no linux!
André Oliveira Souza
________________________________
De: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
Para: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>; "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Enviadas: Terça-feira, 20 de Novembro de 2012 16:30
Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04
Versão ExpDes_1.1.1.tar.gz agora sim consegui instalar no linux.
André Oliveira Souza
________________________________
De: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
Para: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 11:05
Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04
O Walmes me disse, aqui mesmo na lista, ha algum tempo que realmente o pacote para linux em português ele não consegui colocar para funcionar. E no caso do windows eu não sabia que estava em inglês! Obrigado
André Oliveira Souza
________________________________
De: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
Para: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
Enviadas: Quinta-feira, 5 de Janeiro de 2012 10:55
Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (ExpDes) no Linux Ubuntu 10.04
Olá Andre,
Que bom que não desistiu. Vamos por partes que solucionaremos todos os seus problemas.
Quanto ao Windows,
não se esqueça que a versão do CRAN está em ingles. Portanto, após carregar, voce deve pedir o help da função cdr (completely randomized design) e não dic, ou seja
?crd
Veja se funciona.
Quanto ao linux, talvez voce deva escrever para o Walmes, que faz parte dessa lista. Ele usa o ExpDes no Linux e diz que funciona perfeitamente.
abs
Eric.
Em 5 de janeiro de 2012 10:42, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
Eric,
>
>eu acompanhei o pacote no seu site e nunca consegui coloca-lo para funcionar no Linux a versão em português. Agora com ele no CRAN voltei a tentar colocar o pacote para funcionar no Linux, mas sem sucesso. E para minha surpresa no windows não está funcionado também. Olha a minha tentativa no windows!
>require(ExpDes)
>Carregando pacotes exigidos: ExpDes
>> ?dic
>No documentation for ?dic? in specified packages and libraries:
>you could try ???dic?
>
>
> Estou ansioso para colocar este pacote para funcionar por aqui. Já li o TCC e o manual sobre o mesmo e vi a importância do mesmo. Visto que antes tinha que usar muitos pacotes para a mesma análise e com o ExpDes é muito mais prático.
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>
>André Oliveira Souza
>
>
>
>
>
>
>________________________________
> De: Eric Ferreira <ericbferreira@gmail.com>
>Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br; Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 18:25
>Assunto: Re: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu 10.04
>
>
>Olá André,
>
>Se quiser trocar uma ideia em particular, posso tentar te ajudar. Sou o criador do ExpDes, mas não usu Linux. Não sei se serei útil.
>
>A princípio, posso te dizer que existe o pacote no CRAN e na minha página pessoal: https://sites.google.com/site/ericbferreira/unifal/downloads-1
>
>Tente pegar o pacote de lá para ver se o erro se repete.
>Peço gentilmente aos usuárioas de (R no) Linux que me ajudem a exclarecer o André.
>
>Atenciosamente,
>
>Eric.
>
>
>Em 4 de janeiro de 2012 16:39, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
>
>Opa vacilo meu erro no nome do pacote
>>
>>
>> install.packages("ExpDes", dep=T)
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>André Oliveira Souza
>>
>>
>>________________________________
>> De: Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br>
>>Para: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
>>Enviadas: Quarta-feira, 4 de Janeiro de 2012 16:36
>>Assunto: [R-br] Problema para reinstalar pacote (EspDes) no Linux Ubuntu 10.04
>>
>>
>>
>>Pessoal estou com problemas para reinstalar o EspDes !! Alguém saberia dizer o que pode ser?
>>
>>
>>
>>
>>install.packages("EspDes", dep=T)
>>Installing package(s) into ?/home/andre/R/i486-pc-linux-gnu-library/2.14?
>>(as ?lib? is unspecified)
>>--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
>>Carregando a interface Tcl/Tk ... pronto
>>Mensagens de aviso perdidas:
>>In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) :
>> package ?EspDes? is not available (for R version 2.14.1)
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>
>>André Oliveira Souza
>>obrigado
>>
>>
>>_______________________________________________
>>R-br mailing list
>>R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>>
>>_______________________________________________
>>R-br mailing list
>>R-br@listas.c3sl.ufpr.br
>>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
>>Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
>>
>
>
>--
>Dr Eric B Ferreira
>Exact Sciences Department
>Federal University of Alfenas
>Brazil
>
>
>
--
Dr Eric B Ferreira
Exact Sciences Department
Federal University of Alfenas
Brazil
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/6a5b8ac7/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 13
Date: Tue, 20 Nov 2012 10:49:58 -0800 (PST)
From: Alexandre Santos <alexandresantosbr@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Dúvida em summary em regressão logística
Message-ID:
<1353437398.81186.YahooMailNeo@web121206.mail.ne1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Boa tarde Pessoal,
Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte dúvida:
###################################################################################################
#Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a densidade de herbívoros oferecidos
#
pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2
,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26
,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros predados
dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos
##
##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)
p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial")
summary(p.model1)
#
Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta transformado em exp(x)/1+exp(x)
ou trata-se do valor sem transformação?
Obrigado,
--
======================================================================
Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso - Campus Cáceres
Avenida dos Ramires, s/n
Bairro: Distrito Industrial
Cáceres - MT CEP: 78.200-000
Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br ======================================================================
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/0b764a8d/attachment-0001.html>
------------------------------
Message: 14
Date: Tue, 20 Nov 2012 10:51:20 -0800 (PST)
From: Alexandre Santos <alexandresantosbr@yahoo.com.br>
To: "r-br@listas.c3sl.ufpr.br" <r-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Subject: [R-br] Dúvida em summary em regressão logística
Message-ID:
<1353437480.93196.YahooMailNeo@web121202.mail.ne1.yahoo.com>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"
Boa tarde Pessoal,
Estou ajustando uma regressão logística e me deparei com a seguinte dúvida:
###################################################################################################
#Regressão logística entre a proporção de herbívoros predados e a densidade de herbívoros oferecidos
#
pred<-c(1,2,2,3,1,4,2,3,2,3,5,6,5,5,3,7,7,6,2
,3,15,12,14,12,11,11,11,13,13,13,18,14,27,26
,17,18,20,22,10,15,29,30,36,40,23,50,30,40,29,52)##Número de herbívoros predados
dens<-sort(rep(2^(2:6),10))#### Densidade de herbivoros oferecidos
##
##Regressão pred/dens = exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)/1+ exp(P0+P1*N+P2*N^2+P3*N3)
p.model1<-glm(pred/par~dens+I(dens^2)+I(dens^3),family="binomial")
summary(p.model1)
#
Minha dúvida é se o coeficiente linear que aparece no summary esta transformado em exp(x)/1+exp(x)
ou trata-se do valor sem transformação?
Obrigado,
--
======================================================================
Alexandre dos Santos
Proteção Florestal
IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso - Campus Cáceres
Avenida dos Ramires, s/n
Bairro: Distrito Industrial
Cáceres - MT CEP: 78.200-000
Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br ======================================================================
-------------- Próxima Parte ----------
Um anexo em HTML foi limpo...
URL: <http://listas.inf.ufpr.br/pipermail/r-br/attachments/20121120/e2cfa427/attachment.html>
------------------------------
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Fim da Digest R-br, volume 21, assunto 47
*****************************************
_______________________________________________
R-br mailing list
R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.