Uma opção, especialmente útil para slides, é remover automaticamente o espaço em branco ao redor (das bordas externas) da figura em PDF. Você pode setar isso com par(mar = ...). Mas uma ferramenta mais "bruta" e rápida para fazer isso, se você usa Linux, é usar o pdfcrop (precisa ser instalado a parte).

Basta colocar isso no seu chunk setup:

knit_hooks$set(pdfcrop = hook_pdfcrop)

e nos chunks com figura coloque pdfcrop=TRUE (ou coloque globalmente) para reduzir automaticamente a area do PDF ao compilar com o knitr. Por exemplo:

<<RegiaoGrafica01, pdfcrop=TRUE>>=
plot(0:10, 0:10)
@

Até onde eu lembro ainda não havia uma solução para esse problema do espaço dentro do knitr, e essa era uma opção recomendada.

---
Fernando de Pol Mayer
Laboratório de Estatística Ambiental - LEA
Instituto de Matemática, Estatística e Física - IMEF
Universidade Federal do Rio Grande - FURG
URL: http://fernandomayer.github.io
e-mail: fernando.mayer [@] {gmail.com, furg.br}

2015-03-24 16:43 GMT-03:00 Marcus Nunes <marcus.nunes@gmail.com>:

Olá

Fiz esta pergunta há alguns minutos no StackExchange, mas ainda não obtive resposta. (aliás, se alguém quiser ler ela no contexto original e responder por lá ou, quem sabe, vê-la identada corretamente etc, o link é http://stackoverflow.com/questions/29240036/adjust-the-distance-between-code-and-figure-output-in-knitr )

Estou escrevendo uma série de slides sobre as funcionalidades gráficas do R. Um dos meus slides é assim:

---

\begin{frame}[fragile]

\frametitle{A Região Gráfica}

<<RegiaoGrafica01>>=
plot(0:10, 0:10)
@

\end{frame}

---

O problema é que meu slide compilado fica da seguinte forma:

http://i.stack.imgur.com/3Ozdd.jpg

Meu gráfico está muito distante do código. Eu gostaria de saber se existe alguma opção no knitr que diminua esta distância. Já procurei no manual e não consegui encontrar nada do gênero.

Segue meu CMR (i.e., meu arquivo .rnw):

---
\documentclass[10pt, compress, usetitleprogressbar]{beamer}

\usetheme{m}

\usepackage{booktabs}
\usepackage[scale=2]{ccicons}
\usepackage{minted}
\usepackage{amssymb}
\usepackage{amsfonts}
\usepackage{amsmath}
\usepackage{amssymb}
\usepackage{amsthm}
\usepackage[portuges]{babel}
\usepackage{bm}
\usepackage{icomma}
\usepackage[retainorgcmds]{IEEEtrantools}
\usepackage{mathtools}
\usepackage{multirow}
\usepackage{natbib}
\usepackage{shadow}
\usepackage{subfigure}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{shapes.arrows}
\usepackage{verbatim}
\usepackage{xcolor}

\usepgfplotslibrary{dateplot}

\usemintedstyle{trac}

%%% Identification

\title{O Subsistema Gráfico}
\subtitle{EST0091 - Introdução ao R}
\date{26 de março de 2015}
\author{Marcus Nunes}
\institute{Universidade Federal do Rio Grande do Norte}

%%% New colors

\definecolor{mDarkBrown}{HTML}{604c38}
\definecolor{mDarkTeal}{HTML}{23373b}

\definecolor{mLightBrown}{HTML}{EB811B}
\definecolor{mMediumBrown}{HTML}{C87A2F}

\definecolor{mLightRed}{HTML}{EB331B}
\definecolor{mLightGreen}{HTML}{14B03D}
\definecolor{mLightTeal}{HTML}{137D91}

\begin{document}


% new commands

\newcommand{\R}{\mathbb{R}}
\newcommand{\Xb}{\bm{X}}
\newcommand{\Yb}{\bm{Y}}

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%

% knitr options

<<setup, include=FALSE>>=
library(knitr)
opts_chunk$set(fig.path='figure/beamer-',fig.align='center',fig.show='hold',size='footnotesize')
@

<<options, cache=FALSE, echo=FALSE, eval=TRUE, tidy=TRUE, dpi=144>>=
options(width=60)
#par(cex=2)
par(mar=c(0, 0, 0, 0))
opts_knit$set(out.format = "latex")
opts_chunk$set(prompt=TRUE, tidy.opts=list(width.cutoff=40), tidy=FALSE, fig.width=6, fig.height=4.5)
knit_theme$set("print2")
@

%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%


\maketitle

%%%%%%%%%%%%%
%%% SLIDE %%%

\plain{A Região Gráfica}

%%%%%%%%%%%%%


%%%%%%%%%%%%%
%%% SLIDE %%%

\begin{frame}[fragile]

\frametitle{A Região Gráfica}

<<RegiaoGrafica01>>=
plot(0:10, 0:10)
@

\end{frame}

%%%%%%%%%%%%%

\maketitle

\end{document}

---

Obrigado,
--

Marcus Nunes
http://marcusnunes.me/

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