Leia o help da extract, em partcular sobre o arg buffer; veja a resolução de seu raster do exemplo.
A extract está funcionando como esperado para o valor de buffer fornecido.
Att.

On Thursday, February 9, 2017, ASANTOS via R-br <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Prezados membros,

            Gostaria de extrair a média de valores dos pixels de interesse em um raster, dadas as coordenadas centrais de áreas circulares e a determinação do raio, que é dada pelo buffer da função extract() do pacote raster, porém da forma como estou fazendo não esta funcionando, em meu exemplo:

require(raster)
require(sp)
require(plotrix)# Somente para representar a área alvo

## Crio um raster
r <- raster(nc=30, nr=30)
r <- setValues(r, round(runif(ncell(r))* 255))
plot(r)


#Seleciono o centro das áreas circulares
xd     <- c(-24.99270,45.12069,99.40321,73.64419)
yd  <- c(-45.435267,-88.369745,-7.086949,44.174530)
pts <- data.frame(xd,yd)
pts_s<- SpatialPoints(pts)

#Representação da área alvo
for (i in 1:length(xd)) {
draw.circle(pts$xd[i],pts$yd[i],20,border="blue",col="grey")
}


#Visualização das coordenadas do centro

points(pts_s, col="red", pch=16) #Visualização das coordenadas do centro


#Extração da média dos valores de pixels em uma parcela de raio = 20
r_sample <- extract(x = r, y = pts_s, buffer=20, fun=mean, df=TRUE)
r_sample

Não funciona quando realizado dessa maneira. Alguém poderia me dar um help?

Obrigado

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Alexandre dos Santos
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