Vou cuidar melhor dos CMR, Benilton.

Tem como não incluir os nomes das colunas no PCA? Como fica a organização?

Benilton, reproduzi a análise sem os cabeçalhos, conforme você sugeriu, mas também não houve sucesso.

#carreguei meus dados conforme, mas agora indiquei que não existe cabeçalho

> read.table(file = "clipboard", header = F, sep = "\t", dec = ",")-> TSF

>TSF

#chequei os nomes das colunas para confirmar

> names(TSF)
 [1] "V1"  "V2"  "V3"  "V4"  "V5"  "V6"  "V7"  "V8"  "V9"  "V10" "V11" "V12" "V13"

#rodando o PCA

> model <- prcomp(TSF, scale = TRUE)
Erro em svd(x, nu = 0) : infinite or missing values in 'x'

Em 9 de junho de 2013 01:50, Benilton Carvalho <beniltoncarvalho@gmail.com> escreveu:

Vc tem certeza que quer incluir "Label" na PCA? E ja' que estamos no
assunto, Acet tambem? A variavel Label e' texto e calcular media de
texto e' indefinido, portanto a falha... Sobre 'Acet', veja o seu
banco de dados e infira o motivo da minha sugestao.

Deixo tbm uma recomendacao para leitura:
https://gist.github.com/benilton/1088208

b

Em 9 de junho de 2013 01:41, Vinícius Lionel Mateus

<vinynegrelli@gmail.com> escreveu:
> Simone,
> Obrigado testei a classe do objeto e realmente é um data.frame.
>
> Para tornar o exemplo mais reprodutível, compartilho o link dos dados:
> https://www.dropbox.com/s/qopz8pg29pe3z3p/2013%2005%2009%20PCA_R.xls
>
>
>
>
> Em 7 de junho de 2013 22:37, Sérgio Henrique almeida da silva ju
> <sergio.edfisica@gmail.com> escreveu:
>
>> Bom, eu não chutei nada, só estou interpretando a saída do R. Mas, algo
>> mais reproduzível ajudaria mais.
>>
>> Abraços
>>
>>
>> Em 7 de junho de 2013 22:36, Benilton Carvalho
>> <beniltoncarvalho@gmail.com> escreveu:
>>
>>> Se o exemplo fosse de fato reproduzível, ninguém ficaria chutando qual é
>>> o problema....
>>>
>>> On Jun 7, 2013 10:28 PM, "Sérgio Henrique almeida da silva ju"
>>> <sergio.edfisica@gmail.com> wrote:
>>>>
>>>> Simone
>>>>
>>>> Tanto faz você trabalhar com data.frame ou matriz, basta a variável
>>>> estar como numérica.
>>>>
>>>> Abraços
>>>>
>>>>
>>>> Em 7 de junho de 2013 22:25, Simone D. Sartorio
>>>> <sisartorio@yahoo.com.br> escreveu:
>>>>>
>>>>> Na verdade Sérgio, como vc está fazendo uma ACP, seu "x" deve ser uma
>>>>> matriz e provavelmente seu "x" está como um data.frame
>>>>>
>>>>> Verifique a classe do seu "x" assim:
>>>>>
>>>>> class(x)
>>>>>
>>>>> Se a resposta for diferente de uma matriz, pronto, é só transformar seu
>>>>> x em 1 matriz!
>>>>> ok?
>>>>>
>>>>> abraços
>>>>> Si
>>>>>
>>>>>
>>>>> ***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***
>>>>> *  Simone Daniela Sartorio
>>>>> *   Professora Adjunta I da UFSCar, Centro de Ciências Agrárias, Campus
>>>>> Araras/SP.
>>>>> * Doutora e Mestre em Estatística e Experimentação Agronômica -
>>>>> ESALQ/USP;
>>>>> *   Licenciada em Matemática - UNESP/Rio Claro.
>>>>>
>>>>> ***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***---***
>>>>>
>>>>> Tenha um bom dia! ;)
>>>>>
>>>>> ________________________________
>>>>> De: Sérgio Henrique almeida da silva ju <sergio.edfisica@gmail.com>
>>>>> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
>>>>> Enviadas: Sexta-feira, 7 de Junho de 2013 21:21
>>>>> Assunto: Re: [R-br] Remover NA: PCA
>>>>>
>>>>> O R esta entendendo que sua variavel não é numérica.
>>>>> Tente
>>>>> Tsfa$x = as.numeric(Tsfa$x)
>>>>> Em 07/06/2013 20:52, "Vinícius Lionel Mateus" <vinynegrelli@gmail.com>
>>>>> escreveu:
>>>>>
>>>>> Prezados,
>>>>>
>>>>> Estou executando o seguinte CRM:
>>>>>
>>>>> read.table(file = "clipboard", header = TRUE, sep = "\t", dec = ",")->
>>>>> TSF
>>>>> > TSF
>>>>> > names(TSF)
>>>>>  [1] "Date"  "Label" "PMF"   "BC"    "Acet"  "Form"  "Cl."   "NO3."
>>>>> "PO43." "SO42." "Na."   "K."
>>>>> [13] "Mg2."  "Ca2."  "NH4."
>>>>> > TSFa <- TSF[,2:15]
>>>>> > model <- prcomp(TSFa, scale = TRUE)
>>>>> Erro em colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' deve ser numérico
>>>>> > model <- prcomp(TSFa, na.rm = TRUE, scale = TRUE)
>>>>> Erro em colMeans(x, na.rm = TRUE) : 'x' deve ser numérico
>>>>>
>>>>> Tentei diferentes métodos para remover o "NAs", mas não obtive sucesso.
>>>>> Alguém tem alguma dica?
>>>>>
>>>>> --
>>>>> Vinícius
>>>>> --
>>>>> --
>>>>> Atenciosamente,
>>>>>
>>>>> VINÍCIUS LIONEL MATEUS, M.Sc (http://lattes.cnpq.br/6501001637020665)
>>>>> Bacharel em Química - Doutorando em Química Analítica
>>>>> Laboratório de Química Atmosférica - Departamento de Química
>>>>> Pontifícia Universidade Católica - Rio de Janeiro (PUC - Rio)
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>>>>> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça
>>>>> código mínimo reproduzível.
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>>>> Sérgio Henrique Almeida da Silva Junior
>>>> Doutorando em Epidemiologia em Saúde Pública
>>>> Escola Nacional de Saúde Pública Sérgio Arouca - ENSP/FIOCRUZ
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