Tentei reproduzir o seu código com o intuito de ajudá-la e obtive a seguinte mensagem:
 
Erro em barplot(media.capturada, beside = TRUE, main = "Média capturada por espécie ",  :
  objeto 'media.capturada' não encontrado
 
Por gentileza, leia o guia de postagem para que possamos ajudá-la.
 
(s,f,p)
Allaman