Alexandro Vi sua msg sobre valores do predict, me interessa também, vou tentar. Olhando seu CRM em: pixelsize <- (1.0-0.0/30)*(1.0-0.0/30)#Tamanho do pixel é dado por seq não teria de colocar um parentesis antes de dividir? (1.0-0.0)/30 Hélio Em 7 de abril de 2013 03:55, Thiago Veloso [via R-br] < ml-node+s2285057n4658914h2@n4.nabble.com> escreveu:
Alexandre,
Você já tem o polígono gridPol de onde você quer criar a média da krigagem. Não conheço bem as classes do pacote geoR, mas as coordenadas do kc$predict parecem estar no objeto pred.grid. A abordagem que eu usaria seria criar um objeto raster da krigagem e em seguida contar os valores usando a função extract (raster) usando como argumentos o raster da krigagem e o gridPol.
Além da ajuda para a função extract no manual do raster, talvez o último exemplo dessa página possa te ajudar: http://stackoverflow.com/questions/14682606/extract-value-from-raster-stack-...
Mas não estou certo se era isso que você estava buscando. Acho que o Paulo vai te ajudar melhor.
Saudações, -- Thiago V. dos Santos PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/inde... Phone: (612) 323 9898 ------------------------------ *From:* ASANTOS <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=0>
*To:* [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=1>; Thiago V. dos Santos <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=2>>
*Sent:* Saturday, April 6, 2013 10:26 PM
*Subject:* Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem gerada por krigagem
Thiago,
Já pensei isto, mas para SpatialPoints(vp), preciso fazer um list() das coordenadas dos pixels (vp$x e vp$y) e isto não tenho e nem sei como recuperar o valor de um pixel à partir de uma coordenada conhecida.
Abraço,
Alexandre
Em 06/04/2013 21:32, Thiago V. dos Santos escreveu:
Nao conheco bem todas as funcoes do sp, mas para pela mensagem de erro eu transformaria a tabela vp em SpatialPoints, que eh o argumento esperado pela funcao over.
Saudações, -- Thiago V. dos Santos PhD student Land and Atmospheric Science University of Minnesota
http://www.laas.umn.edu/CurrentStudents/MeettheStudents/ThiagodosSantos/inde... Phone: (612) 323 9898 ------------------------------ *From:* ASANTOS [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=3> *To:* [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=4> *Sent:* Saturday, April 6, 2013 8:12 PM *Subject:* Re: [R-br] Obter valor médio dos pixels de uma imagem gerada por krigagem
Boa noite pessoal,
Acho evoluí um pouco na questão, mas agora a dificuldade esta em contar os pixels contidos no interior das malhas, quando tento um over(), ocorre o seguinte erro:
Erro em function (classes, fdef, mtable) : unable to find an inherited method for function "over", for signature "table", "SpatialPolygons"
segue CRM: # require(geoR) plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2), xlab="Coord X", ylab="Coord Y") loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0, 1.1), ncol=2) text(loci, as.character(1:4), col="red") polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)
# Fitting models with nugget fixed to zero ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)
# defining the grid pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1, l=51)) # kriging calculations kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige = krige.control(obj.m = ml)) # displaying predicted values image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)), xlab="Coord X", ylab="Coord Y") #
#Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2 p0<-c(0.1,0.1) # c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2) d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2) d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0) points(d1[,1],d1[,2],col="red") ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0) hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0) abline(v=ver, col="red") abline(h=hor, col="red") # require(sp) grid=GridTopology(c(0.1,0.1), c(0.2,0.2), c(5,5))### Cria as área grid=SpatialGrid(grid=grid) class(grid) ## SpatialPixels gridPol <- as(grid, "SpatialPolygons") ## Transfoma as areas em polígonos espaciais options(digits=5) pixelsize <- (1.0-0.0/30)*(1.0-0.0/30)#Tamanho do pixel é dado por seq Xmaior - Xmenor/l * Ymaior-Ymenor/l vp <- table(area <- kc$predict)## Valor dos pixels count.pix<-table(over(vp, gridPol)) #contar quantos pontos tem em cada area
Obrigado,
Alexandre
Em 06/04/2013 17:11, ASANTOS escreveu:
Boa noite membros da lista,
Gostaria de receber ideias para calcular o valor médio dos pixel em uma imagem gerada por krigagem em sub-regiões de interesse na imagem, por exemplo usando um exemplo do Prof. Paulo, onde ajusta-se um semivariograma e faz a krigagem ordinária dos dados:
# require(geoR) plot(s100$coords, xlim=c(0,1.2), ylim=c(0,1.2), xlab="Coord X", ylab="Coord Y") loci <- matrix(c(0.2, 0.6, 0.2, 1.1, 0.2, 0.3, 1.0, 1.1), ncol=2) text(loci, as.character(1:4), col="red") polygon(x=c(0,1,1,0), y=c(0,0,1,1), lty=2)
# Fitting models with nugget fixed to zero ml <- likfit(s100, ini = c(1,0.5), fix.nugget = T)
# defining the grid pred.grid <- expand.grid(seq(0,1, l=51), seq(0,1, l=51)) # kriging calculations kc <- krige.conv(s100, loc = pred.grid, krige = krige.control(obj.m = ml)) # displaying predicted values image(kc, loc = pred.grid, col=gray(seq(1,0.1,l=30)), xlab="Coord X", ylab="Coord Y") #
#Agora vou dividir esta área em 25 partes e lançar os centroides destas subáreas:
#Centro das 25 parcela 0.2 x 0.2 p0<-c(0.1,0.1) # c0 <- seq(p0[1],p0[1]+0.9,by=0.2) d0 <- seq(p0[2],p0[2]+0.9,by=0.2) d1 <- expand.grid(x=c0, y=d0) points(d1[,1],d1[,2],col="red") ver<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0) hor<-c(0.0,0.2,0.4,0.6,0.8,1.0) abline(v=ver, col="red") abline(h=hor, col="red") #
E aqui vem minha pergunta, como calcular o valor médio dos pixels contidos em cada subárea de 0.2 x 0.2?
Obrigado,
-- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal Coordenador do curso Técnico em Florestas Vice Coordenador do curso de Engenharia Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=5> [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4658914&i=6> ======================================================================
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-- Hélio Gallo Rocha IFSULDEMINAS - Câmpus Muzambinho