Humberto, voce pode fazer isso utilizando a pacote ncdf (versao 1.6.6) e a funcao melt do pacote reshape, conforme CMR abaixo. require(ncdf) #‘ncdf’ version 1.6.6 require(reshape) nc <- open.ncdf("DML05_12.nc") nc # [1] "file DML05_12.nc has 4 dimensions:" # [1] "LONN55_12 Size: 68" # [1] "LAT46_103 Size: 58" # [1] "TIME Size: 96" # [1] "bnds Size: 2" # [1] "------------------------" # [1] "file DML05_12.nc has 2 variables:" # [1] "double TIME_bnds[bnds,TIME] Longname:TIME_bnds Missval:1e+30" # [1] "float MLD[LONN55_12,LAT46_103,TIME] Longname:argo mixed layer depth (m) Missval:-999" lat <- get.var.ncdf(nc, "LAT46_103") lon <- get.var.ncdf(nc, "LONN55_12") time <- get.var.ncdf(nc, "TIME") ## array da variavel MLD dml <- get.var.ncdf(nc, "MLD") str(dml) # num [1:68, 1:58, 1:96] 25.4 25.9 26.4 26.9 27.3 ... ## atribuindo dimnames conforme lon, lat e tempo dimnames(dml)[[1]] <- as.character(lon) dimnames(dml)[[2]] <- as.character(lat) dimnames(dml)[[3]] <- as.character(time) str(dml) #num [1:68, 1:58, 1:96] 25.4 25.9 26.4 26.9 27.3 ... #- attr(*, "dimnames")=List of 3 #..$ : chr [1:68] "-55.5" "-54.5" "-53.5" "-52.5" ... #..$ : chr [1:58] "-44.5" "-43.5" "-42.5" "-41.5" ... #..$ : chr [1:96] "731962" "731993" "732021" "732052" ... ## melt para reestruturacao dos dados mdml <- melt(dml) head(mdml) # X1 X2 X3 value #1 -55.5 -44.5 731962 25.41 #2 -54.5 -44.5 731962 25.91 #3 -53.5 -44.5 731962 26.42 #4 -52.5 -44.5 731962 26.89 #5 -51.5 -44.5 731962 27.30 #6 -50.5 -44.5 731962 27.63 tail(mdml) # X1 X2 X3 value #378619 6.5 12.5 734853 NA #378620 7.5 12.5 734853 NA #378621 8.5 12.5 734853 NA #378622 9.5 12.5 734853 NA #378623 10.5 12.5 734853 NA #378624 11.5 12.5 734853 NA require(lattice) levelplot(value~X1+X2|factor(X3),data=mdml) 2012/9/30 Humberto Hazin <hghazin@hotmail.com>
Bom dia pessoal,
Estou tentando extrair variáveis ambientais de arquivos formato netcdf. Até um certo momento consigo separtar em arquivos as Latitudes, Longitudes, time (mes/ano) e a dml (exemplo que mando aqui).
Link para baixar os dados do exemplo https://www.dropbox.com/s/66dp4rgei791r52/DML05_12.nc
nc <- open.nc("DML05_12.nc", write=TRUE) print.nc(nc) lat<-var.get.nc(nc, "LAT46_103") lon<-var.get.nc(nc, "LONN55_12") time<-var.get.nc(nc, "TIME") dml<-var.get.nc(nc, "MLD")
Meu problema é que nao estou conseguindo organizar eles em colunas com seus respectivos valores para cada latitude, longitude, time e dml.
o output final deveria ficar assim:
lat lon time dml 1 -44.5 -55.5 2 -43.5 -55.5 3 -42.5 -55.5 4 -41.5 -55.5 5 -40.5 -55.5 6 -39.5 -55.5
Agradeço a ajuda desde já
Humberto
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Prof. Dr. Humberto Gomes Hazin Universidade Federal Rural de Pernambuco - UFRPE Unidade Acadêmica de Serra Talhada - UAST Coordenador do Curso de Engenharia de Pesca Fazenda Saco, S/N - Caixa Postal 063 CEP 56900-000 Serra Talhada - PE Tel.(87) 3831-2206/3831-1927 Cel.(81) 9158 0564
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