Estava vendo a discussão, tentei rodar isto e não consegui, não reconhece o comando xpahApply. Tem que chamar alguma bibliotéca para isto?

Tente assim:

dPath <- "http://aspera.jpl.nasa.gov/download/pub/sea_surface_temperature/avhrr/pathfinder/data_v5/monthly/night/04km/1986/bsst/"
f <- xpathApply(htmlParse(getURL(dPath)), "//a", xmlAttrs,
'href')[c(FALSE, TRUE, FALSE)]
mapply(download.file, file.path("http://aspera.jpl.nasa.gov/", f),
basename(unlist(f)))

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