Thiago,

Tem um procedimento para isso nas Ridículas do LEG

http://www.leg.ufpr.br/doku.php/ridiculas#experimento_com_dois_fatores_de_efeito_aditivo_e_perda_de_muitas_parcelas

Não se pode usar as médias amostrais como estimadoras das médias populacionais porque devido à não ortogonalidade elas são viesadas. Por isso o uso da agricolae::HSD.test() não é recomendado.

À disposição.
Walmes.

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Walmes Marques Zeviani
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