Não sei se eu entendi bem mas a sua duvida é saber qual dos modelos abaixo usar?

Yijk = m + Gi + B/Ajk + Aj + GAij + Eijk

Yijk = m + Gi + Bk + Aj + GAij + Eijk

Att.

Tiago.


Date: Sat, 20 Oct 2012 15:36:31 -0300
From: eder@leg.ufpr.br
To: R-br@listas.c3sl.ufpr.br
Subject: Re: [R-br] Blocos com algumas repetições do material


Boa tarde Pessoal,

Tenho experimentos em blocos(Locais) e dentro deles gostaria de por algumas de repetições de alguns tratamentos para estimar a variância dentro do bloco, que desconfio ser grande. Por exemplo, tenho 5 Cultivares gostaria de repetir 3 delas dentro do bloco, tendo ao todo 8 parcelas, o ideal seria ter uma repetição de tudo, porem na pratica isso não é possível. 
Minhas duvidas são:
1) Estou definindo de maneira correta essas repetições dentro do modelo?
2) Como o método  de calculo dos dois modelos abaixo é igual para os efeitos fixos, por que o intercepto esta com valores diferentes?
3) Neste dois casos(m0 e m1, abaixo) o BLUP seria a média mais o efeito da cultivar? 
Obrigado pela ajuda

require(lme4)
### Simulando dados
dados <- expand.grid(Variedade=factor(c(letters[1:3],letters[1:5])),Local=factor(1:5))
dados$Rep <- factor(rep(c(2,2,2,1,1,1,1,1),t=5))
dados$Resp <- sort(rnorm(nrow(dados)))
dados

### Modelos
# Sem efeito dentro do local
m0 <- lmer(Resp~1+(1|Local)+(1|Variedade),dados)
summary(m0)
ranef(m0)
# Com efeito dentro do local
m1 <- lmer(Resp~1+(0+Rep|Local)+(1|Variedade),dados)
summary(m1)
ranef(m1)

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