Fernando, Parabéns, seu código é totalmente reproduzível (com excessão da função Anova() que tá ali sem carregar o pacote car, mas eu conhecia). CMR é meio raro na nessa lista. Para resolver seu problema você fazer assim. abate <- structure(list(Animal = c(1L, 2L, 3L, 4L, 5L, 7L, 8L, 9L, 12L, 14L, 15L, 17L, 18L, 19L, 21L, 22L, 23L, 25L, 26L, 28L, 30L, 32L, 34L, 35L, 37L, 38L, 39L, 40L, 41L, 42L, 43L, 44L, 46L, 47L, 48L, 49L, 50L, 53L, NA, NA), Gest = structure(c(4L, 2L, 3L, 2L, 2L, 4L, 3L, 4L, 2L, 2L, 3L, 4L, 1L, 4L, 2L, 1L, 4L, 1L, 2L, 4L, 3L, 3L, 1L, 4L, 3L, 1L, 2L, 3L, 1L, 1L, 3L, 1L, 2L, 3L, 1L, 2L, 1L, 1L, NA, NA), .Label = c("0", "100", "130", "140"), class = "factor"), Manej = structure(c(1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, 2L, 1L, 1L, 2L, 2L, 1L, 1L, NA, NA ), .Label = c("1", "2"), class = "factor"), rep = c(2L, 3L, 1L, 2L, 4L, 3L, 1L, 2L, 2L, 5L, 4L, 3L, 1L, 4L, 1L, 2L, 4L, 4L, 3L, 1L, 3L, 5L, 6L, 1L, 2L, 5L, 1L, 2L, 4L, 3L, 3L, 3L, 4L, 4L, 5L, 5L, 1L, 2L, NA, NA), PV = c(49000L, 40800L, 51800L, 41900L, 35000L, 40500L, 35400L, 42300L, 36600L, 36600L, 38400L, 46400L, 26900L, 50200L, 35500L, 35500L, 48400L, 40500L, 32500L, 42800L, 36500L, 50000L, 31200L, 33500L, 46500L, 40900L, 36500L, 31200L, 31500L, 35500L, 38700L, 30000L, 37900L, 42700L, 35500L, 42000L, 34500L, 36700L, NA, NA)), .Names = c("Animal", "Gest", "Manej", "rep", "PV"), class = "data.frame", row.names = c(NA, -40L)) abate$Gest <- factor(abate$Gest) abate$Manej <- factor(abate$Manej) abate <- na.omit(abate) xtabs(~Gest+Manej, abate) C <- lm(PV~Gest*Manej, abate) anova(C) car::Anova(C,type="III") # interação não significativa à 5%! D <- lm(PV~Gest+Manej, abate) X <- doBy::popMatrix(D, effect="Gest") choose(nlevels(abate$Gest), 2) cb <- combn(nrow(X), 2) Xc <- X[cb[1,],]-X[cb[2,],] Xc rownames(Xc) <- apply(combn(levels(abate$Gest), 2), 2, paste, collapse="-") require(multcomp) summary(glht(D, linfct=Xc)) # em caso de interação significativa fazer # isso aqui para cada nível que deseja fixar levels(abate$Manej) X <- doBy::popMatrix(C, effect="Gest", at=list(Manej="1")) X # o resto segue normal... # para automatizar os desdobramentos você pode usar a lapply() ou # similares. A opção de constrate nada mais é que uma restrição paramétrica no vetor de efeitos que te leva para uma particular solução ou conjunto de estimativas. Como você falou, o treatment anula (impõe/assume) que o efeito do primeiro nível de cada fator é zero, o soma zero impõe que a soma deles é zero. Em todas elas, o que você precisa estimar ao final são p-1 parâmetros/efeitos pois a restrição cuidou de um. Todos contra todos na saída do summary() não tem como especificar porque isso requer mais que p-1 hipóteses você só pode ir com p-1. Mas isso não é problema porque uma vez estimado os efeitos, qualquer função e quantidade de funções estimáveis a partir deles pode ser obtida. À disposição. Walmes. ========================================================================== Walmes Marques Zeviani LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W) Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná fone: (+55) 41 3361 3573 VoIP: (3361 3600) 1053 1173 e-mail: walmes@ufpr.br skype: walmeszeviani twitter: @walmeszeviani homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes linux user number: 531218 ==========================================================================