Oie David e todos do grupo Esses são os dados que eu tenho, com as espécies e a abundância de cada uma de acordo com o registro.
dat.alim[c(1:10),c(1:5)]
Reg PEI CAM BRA CRUS GAS 26 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 27 1 6 0 0 0 28 1 0 5 0 0 29 3 0 0 0 0 30 0 0 1 0 0 31 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 32 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 33 2 3 1 0 0 34 0 0 0 0 0 # linha zerada, sem dados 35 0 0 0 1 0 Também estou mandando os comandos que eu tenho para fazer o agrupamento, onde tenho que retirar as linhas que contenham os zeros. # Dissimilaridade e medidas de distancia para dados (semi) quantitativos dat.alim2<- dat.alim [c(2:5,8,10:14,16,17,19:31,33,34,36,37,40:42,44:49),] # nesse comando eu tive que eliminar as linhas com zeros para poder continuar fazendo a dissimilaridade. É nesse ponto que eu preciso de ajuda. Sem eliminar essas linhas com os zeros não funciona,mas eu preciso manter esses dados! dis.bra <- vegdist(log1p(dat.alim2))# Bray-Curtis sobre dados transformados por log head(dis.bra) Obrigada. Aguardo. Att., Nathalia de Sousa Motta Oceanógrafa/Oceanographer Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca ________________________________ De: David Feitosa <contato@davidfeitosa.com> Para: r-br@listas.c3sl.ufpr.br; Nathalia Sousa <nathalia_sousam@yahoo.com.br> Enviadas: Sexta-feira, 3 de Janeiro de 2014 16:22 Assunto: Re: [R-br] Dúvida Análise de agrupamento Nathalia, Vc teria como dar um head/tail pra gente ter noção de uma amostra desses dados? Creio que facilitaria para alguém responder e te ajudar. Atenciosamente, David Feitosa (\_(\ (=°;°) (("")("") Em 3 de janeiro de 2014 14:25, Nathalia Sousa <nathalia_sousam@yahoo.com.br> escreveu: Boa tarde,
Sou iniciante no R e queria uma ajuda com meus dados do mestrado. Estou tentando fazer uma análise de agrupamento (cluster) com dados de abundância de 5 espécies, porém tenho algumas datas que não tenho nenhum exemplar coletado. Na hora que vou tentar fazer o cluster, tenho que eliminar essas linhas vazias, mas eu preciso delas pois essas ausências das espécies são dados importantes, que quero analisar. Com os comandos que tenho, preciso tirar essas linhas, mas não posso e preciso fazer o cluster com todos esses dados. Alguém pode me ajudar com esses comandos???
Desde já, agradeço. Aguardo. Att.,
Nathalia de Sousa Motta Oceanógrafa/Oceanographer Mestranda em Pesca - Instituto de Pesca _______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.