Caríssimos(as) colegas(as), muito bom dia!
Espero que todos se encontrem bem.
Estou com uma dificuldade. Quero fazer um bubble plot usando as funções ggplot2 e dplyr, onde pretendo plotar no eixo x o gene_ID (são 84 linhas), no y a % de ocorrência da expressão na célula e no color, o valor da expressão. O meu primeiro problema é que no y são 9 tipos celulares diferentes e cada um tem, na tabela de entrada de dados, uma coluna com os dados de expressão e outra com os dados de % de ocorrência (amostra abaixo). Como eu escrevo a função geom_point para plotar o gráfico?
Amostra da tabela de entrada
gene |
BE-exp |
BE% |
CE_exp |
CE% |
E_exp |
E% |
F_exp |
F% |
HE_exp |
HE% |
L-exp |
L% |
LE-exp |
LE% |
N-exp |
N% |
SM-exp |
SM% |
ACTB |
4.006 |
99.8 |
3.690 |
99.6 |
2.691 |
95.2 |
2.377 |
80.1 |
2.901 |
97.7 |
3.182 |
94.1 |
2.864 |
94.0 |
3.243 |
96.0 |
3.214 |
93.5 |
ACTG1 |
3.850 |
5.9 |
3.592 |
7.1 |
2.469 |
1.5 |
2.252 |
1.1 |
3.129 |
6.4 |
2.451 |
0.6 |
2.979 |
1.1 |
3.104 |
0 |
2.500 |
2.4 |
AJUBA |
1.185 |
5.9 |
0.972 |
7.1 |
1.042 |
1.5 |
0.912 |
1.1 |
1.043 |
6.4 |
0.865 |
0.6 |
1.024 |
1.1 |
0 |
0 |
1.149 |
2.4 |
Muitíssimo obrigada pela ajuda!
Michele
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Dra. Michele Claire Breton
Técnica Superior em Bioinformática
CICS - Centro de Investigação em Ciências da Saúde
Faculdade de Ciências da Saúde
Universidade da Beira Interior
Covilhã - Castelo Branco - Portugal