Leonardo, É possível *quase* concordar como você! Mas para a concordância total, temos que colocar na mesa o seguinte: A hipótese nula é verdadeira ou falsa? No caso de uma tabela de contingência 2x2 (a do OP) a nula é que não há "associação" entre as duas variáveis categóricas, ou seja as proporções das colunas (ou linhas) espelham as proporções das margens. Como a tabela é uma amostragem do mundo ("a população sob estudo") espera-se variações nos valores das células que difiram das proporções "reais" e por isso faz-se o teste estatístico. No caso de o efeito ser forte e a hipótese nula ser falsa a afirmação acima não seria totalmente verdadeira... Quanto à proposição " Acho mais produtivo *estimar* a dis/concordância, sem perder de vista a precisão da estimativa." o problema, é que "*the devil is in the detail*" como atestam as 'n' tentativas dos nossos antepassados (desde Yule na déc. dos dez do século passado, até o Gwet [de quem comprei o *librito* há um tempo atrás]), de definir a [medida da] " dis/concordância"! Só para ficar nas medidas citadas nesta "trédi": o Kappa de Cohen sofre do paradoxo citado pelo Pedro, o valor-p *per se* não é medida dessa natureza, o OR ou RR não está claro se se aplica ao caso do OP ou não (ele precisa nos dizer como os dados foram colhidos e qual a interpretação para a tabela), as medidas de associação, precisam ser interpretadas com cuidado, por isso passei os links... Ademais, uma questão de ordem aqui (que de novo *somente* o OP poderia elucidar): o modelo para se usar o índice de concordância (dos quais o Kappa é um dos exemplos) só se aplicaria se uma das variáveis categóricas estivesse classificando o resultado da outra, o que me parece impossível para os micro-organismos (a menos que a tabela indique se eles preferem a companhia do outro, por exemplo), eu entendi a tabela como uma outra instância do famoso exemplo de Snee para associação entre cor de cabelo e cor dos olhos (os dados desse exemplo existem no R no *dataset* " HairEyeColor"). HTH -- Cesar Rabak 2015-11-06 17:36 GMT-02:00 Leonardo Ferreira Fontenelle < leonardof@leonardof.med.br>:
Dada uma amostra suficientemente pequena não haverá diferença estatisticamente significativa, e dada uma amostra suficientemente grande haverá diferença estatisticamente significativa, não importa o quanto os métodos concordem ou discordem. Acho mais produtivo *estimar* a dis/concordância, sem perder de vista a precisão da estimativa.
Leonardo Ferreira Fontenelle <http://lattes.cnpq.br/9234772336296638>
Em Sex 6 nov. 2015, às 16:01, Cesar Rabak escreveu:
Embora tardiamente, gostaria de fazer um comentário sobre seu problema.
Se a questão é a comparação da eficiência das técnicas, por que não simplesmente compará-las e ver se há significância estatística na diferença?
2015-10-28 11:17 GMT-02:00 André Lucas de Oliveira Moreira < andremoreirazoo@gmail.com>:
Obrigado Pedro, vou pesquisar mais sobre o Gewtt AC1.
Abraços, André
Em 27 de outubro de 2015 14:13, Pedro Emmanuel Alvarenga Americano do Brasil <emmanuel.brasil@gmail.com> escreveu:
Andre,
O Kappa para dois "raters" é muito simples.É a concordância das observações alem do acaso. Pessoalmente não gosto do Kappa por conta do paradoxo do Kappa.
O cara que fez esse sitio fez o melhor livro que ja lia respeito de concordâncias. Ele sugere uma estatistica que não por acaso tem o nome dele. Gewtt AC1.
Mas se voce quiser conduzir um kappa o seguinta função é a melhor que já usei, inclusive consegue analisar dados de multirater multireader.
epicalc::kap
outras funções tambem legais. epiR::epi.kappa epibasix::epiKappa
NO pacote irr também ha varias funções de kappa e outras estatisticas de concordância. Esse pacote é dedicado somente a estatísticas de concordância e confiabilidade.
Abraço,
Pedro Brasil
Em 26 de outubro de 2015 13:02, André Lucas de Oliveira Moreira < andremoreirazoo@gmail.com> escreveu:
Olá pessoal, tudo bem? Aqui no trabalho, pela primeira vez me deparei com uma situação em que é necessário comparar a eficiência de técnicas que detectam que uma mesma espécie de parasita. A principio não sabia qual seria o melhor teste para verificar isso, mas me falaram pela primeira vez do kappa. Então tenho buscado sobre o assunto. Porém, nos livros que eu tive acesso fala disso muito rapidamente e não me deram segurança suficiente para executar no R e interpretar os resultados.
Pensando que tenho resultados categóricos (presença e ausência dos parasitos para ambas técnicas), qual seria a melhor forma de analisar isso, melhor pacote e função? Também preciso do valor de p. Seria muito útil se alguém indicasse um tutorial e também algum material teórico que me dê mais segurança no uso desta técnica.
Agradecido, André
--
*MSc. André Lucas de O. Moreira* http://lattes.cnpq.br/7258065668864153 <http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas> http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas 79 8837-3562 79 9132-9093
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
--
*MSc. André Lucas de O. Moreira* http://lattes.cnpq.br/7258065668864153 <http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas> http://www.wikiaves.com.br/perfil_andrelukinhas 79 8837-3562 79 9132-9093
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
*_______________________________________________* R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.
_______________________________________________ R-br mailing list R-br@listas.c3sl.ufpr.br https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível.