15 Nov
2012
15 Nov
'12
14:30
O arquivo 00install.out que é criado após darmos um check apresentou as seguintes informações. O arquivo prdm.Rd mudei um pouco porque estava faltando uma chave fechando o tópico de exemplos e esta anexado. Obrigado pela ajuda. * installing *source* package ‘PRDM’ ... ** R ** preparing package for lazy loading ** help Aviso: /home/pedro/Documentos/MESTRADO - UFPE/Análise de Sobrevivência/Artigo_Gauss_Pedro_Cicero/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM/man/PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section Aviso: /home/pedro/Documentos/MESTRADO - UFPE/Análise de Sobrevivência/Artigo_Gauss_Pedro_Cicero/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM/man/PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section *** installing help indices ** building package indices ** testing if installed package can be loaded * DONE (PRDM) [ ], Pedro Rafael Diniz Marinho. Em 15 de novembro de 2012 11:24, Pedro Rafael < pedro.rafael.marinho@gmail.com> escreveu: > Olá Tiago de Souza como vai? Obrigado pela ajuda. No arquivo .Rd que > você me enviou está ocorrendo o erro que segue: > > * checking examples ... ERROR > Running examples in ‘PRDM-Ex.R’ failed > The error most likely occurred in: > > > ### Name: prdm > > ### Title: Meu Pacote > > ### Aliases: prdm > > > > ### ** Examples > > > > fdp<- #defina o quem e esta variavel > + fda<- #defina o quem e esta variavel > + chuetes<- #defina o quem e esta variavel > + dados<- #defina qual o conjunto de dados > + prdm(fdp, fda, chutes, dados, method = "Nelder-Mead") > Error in optim(chutes, fn = vero, x = dados, control = list(maxit = > 50000), : > object 'chutes' not found > Calls: prdm -> optim > Execution halted > > Você acredita que o erro estava no exemplo? > > > [ ], > Pedro Rafael Diniz Marinho. > > > Em 15 de novembro de 2012 10:02, Tiago de Souza [via R-br] < > ml-node+s2285057n4657020h97@n4.nabble.com> escreveu: > > Pedro, fiz algumas alterações no tópico arguments da uma olhada para ver >> se você concorda. Deixei algumas instruções no tópico examples caso o >> problema persista me envie este arquivo com as variáveis fdp, fda, chutes e >> dados definidas no tópico examples e eu posso tentar te ajudar. >> >> Att. >> >> Tiago. >> >> >> >> ------------------------------ >> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:42 -0300 >> >> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=0> >> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=1> >> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >> >> Segue em anexo o pacote. Basta descompactar. Não estou vendo o erro. >> >> >> >> Obrigado. >> >> >> >> >> [ ], >> Pedro Rafael Diniz Marinho. >> >> >> Em 15 de novembro de 2012 08:52, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=2> >> > escreveu: >> >> No INSTALL não deu nenhum erro. O processo de instalação foi normal. Será >> que eu poderia anexar meu exemplos para vocês dá uma olhada? >> >> >> Obrigado. >> >> [ ], >> Pedro Rafael Diniz Marinho. >> >> >> Em 15 de novembro de 2012 08:42, Tiago de Souza [via R-br] <[hidden >> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=3>> escreveu: >> >> Leonard onde eu consigo baixar esse rutil? >> >> Att. >> >> Tiago. >> >> ------------------------------ >> Date: Thu, 15 Nov 2012 09:28:46 -0200 >> >> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=0> >> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=1> >> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >> >> No Windows tem que instalar o rutil recomendado para a versão do R que >> estamos usando. >> >> Tenho uma VM windows 64 bits comigo e todos os problemas que encontrei >> quando fuçei com pacotes foram referentes ao R não localizar todos os >> 'bichinhos' do Rutil os quais precisava. >> >> []s >> Leonard de Assishttp://about.me/ldeassis >> >> Em 15/11/2012 08:06, tiago souza marçal escreveu: >> >> Estou com um problema parecido com o seu, porém, no Windows . No meu >> caso o check do PDF está ok mas quando eu peço para ele ser gerado (R >> CMD Rd2pdf) uma mensagem de erro e retornada informando uma versão >> antiga do MikTex que eu não estou usando. >> >> Mas no seu caso você observou mensagem de erro no processo de >> instalação do pacote (R CMD INSTALL) ? Caso isso tenha ocorrido este >> pode ter sido o problema, em função de algum erro na edição do arquivo.Rd. >> Observe que foi retornado pra você um WARNING no check dos arquivos.Rd >> com algumas mensagens de erro. >> >> Espero ter te ajudado. >> >> Att. >> >> Tiago. >> >> ------------------------------ >> Date: Wed, 14 Nov 2012 23:27:37 -0300 >> From: [hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=2> >> To: [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=3> >> Subject: Re: [R-br] [Dúvida] Criando pacotes para o R. >> >> Pessoal estou estudando como criar pacotes no R e tive o seguinte erro na >> hora de dar o check. Consigo gerar o arquivo tar.gz mas o pdf da >> documentação não é criado. Alguém saberia me informar onde estaria o erro? >> >> OBS: Estou em uma máquina Linux. >> >> * using log directory >> ‘/home/pedro/Documentos/Gama_Log_Logistica/FUNCAO_CODIGO/PRDM.Rcheck’ >> * using R version 2.15.1 (2012-06-22) >> * using platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit) >> * using session charset: UTF-8 >> * checking for file ‘PRDM/DESCRIPTION’ ... OK >> * checking extension type ... Package >> * this is package ‘PRDM’ version ‘1.0’ >> * checking package namespace information ... OK >> * checking package dependencies ... OK >> * checking if this is a source package ... OK >> * checking if there is a namespace ... OK >> * checking for executable files ... OK >> * checking whether package ‘PRDM’ can be installed ... OK >> * checking installed package size ... OK >> * checking package directory ... OK >> * checking for portable file names ... OK >> * checking for sufficient/correct file permissions ... OK >> * checking DESCRIPTION meta-information ... OK >> * checking top-level files ... OK >> * checking index information ... OK >> * checking package subdirectories ... OK >> * checking R files for non-ASCII characters ... OK >> * checking R files for syntax errors ... OK >> * checking whether the package can be loaded ... OK >> * checking whether the package can be loaded with stated dependencies ... >> OK >> * checking whether the package can be unloaded cleanly ... OK >> * checking whether the namespace can be loaded with stated dependencies >> ... OK >> * checking whether the namespace can be unloaded cleanly ... OK >> * checking for unstated dependencies in R code ... OK >> * checking S3 generic/method consistency ... OK >> * checking replacement functions ... OK >> * checking foreign function calls ... OK >> * checking R code for possible problems ... OK >> * checking Rd files ... WARNING >> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:30: All text must be in a section >> prepare_Rd: PRDM-package.Rd:31: All text must be in a section >> prepare_Rd: prdm.Rd:36-42: Dropping empty section \value >> * checking Rd metadata ... OK >> * checking Rd cross-references ... OK >> * checking for missing documentation entries ... OK >> * checking for code/documentation mismatches ... OK >> * checking Rd \usage sections ... OK >> * checking Rd contents ... OK >> * checking for unstated dependencies in examples ... OK >> * checking examples ... OK >> * checking PDF version of manual ... ERROR >> Rd conversion errors: >> Warning: unknown option '-' >> Warning in file(con, "r") : >> cannot open file '/home/pedro/Documentos/MESTRADO': No such file or >> directory >> Error in file(con, "r") : cannot open the connection >> >> >> [ ], >> Pedro Rafael Diniz Marinho. >> >> >> Em 14 de novembro de 2012 20:43, Pedro Rafael <[hidden email]<http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=4> >> > escreveu: >> >> Grande Paulo Justiniano, como vai? Muito obrigado pelas suas informações. >> Uso o Linux faz uns 6 anos mas nunca contribui ou publiquei meus códigos. >> Estava vendo que a linguagem Julia vem com a licença MIT que eu não acho >> muito interessante porque quem quiser pode vender o código. Minha dúvida >> sobre a licença GPL ou GPL2 é se uma pessoa poderá desmanchar algum código >> que fiz ou mudar completamente o foco do pacote, retirar nome dos autores, >> etc. Existe um pacote hoje muito usado no R que foi feito por uma pessoa e >> depois de um tempo parou de ser mantido. Chegou um outro cara de fora e >> reimplementou o pacote e tirou o nome dos autores antigos e depois muita >> luta o nome dessas pessoas permaneceu como "autores antigos". Isso ocorre >> com certa frequência? Existe alguma periodicidade de manutenção do pacote >> que deve ser respeitada? >> >> [ ], >> Pedro Rafael Diniz Marinho. >> >> >> Em 14 de novembro de 2012 20:28, Paulo Justiniano [via R-br] <[hidden >> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=5>> escreveu: >> >> >> >> On Wed, 14 Nov 2012, Pedro Rafael wrote: >> >> > Pessoal, digamos que faço um pacote para o R. Como funciona o professo >> de submissão? >> >> 1. Leia atentamente o manual "Writing R extensions" que descreve isto >> em >> detalhes. >> >> 2 certifique-se que voce testou o seu pacote : >> >> R CMD check SEU_PACOTE >> >> e corrija todos os eventuais problemas >> >> > Digamos que eu submeta um pacote "meu_pacote" e depois queira >> > fazer modificações no mesmo. Para acrescentar essas modificações eu >> tenho que submeter novamente o pacote com o mesmo nome para que as >> atualizações >> > fiquem disponíveis? >> >> Sim. Para isto voce alter a numero da versao no arquivo DESCRIPTION >> >> > >> > Outra dúvida que tenho é sobre a segurança que tenho que meu pacote não >> seja modificado. Qualquer pessoa pode pegar esse pacote e alterar ele >> > completamente sem nenhuma permissão minha ou qualquer modificação tem >> que ser acompanhada por intermédio da pessoa que submeteu o pacote pela >> primeira >> > vez? >> > >> >> Bem vindo ao Universo do Software livre >> >> Note que se voce quiser voce pode baixar os fontes do R e mudar o que >> quiser >> >> Falando mais seriamente no DESCRIPTION voce define a licenca. >> Leia sobre licxancas GPL e análogas >> >> Minha sugestao: internalize completamente o conceito de software livre e >> livre-se destas preocupacoes >> >> > >> > São dúvidas bestas mas que nunca entendi direito. >> >> Nao sao somente suas. >> Não é por acaso que há uma diversidade de tipos de licensas, não sem >> controvérsias! >> >> > >> > Obrigado à todos. >> > [ ], >> > Pedro Rafael Diniz Marinho. >> > >> > >> > >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657009&i=0> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> >> ------------------------------ >> If you reply to this email, your message will be added to the >> discussion below: >> >> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657009.html >> To unsubscribe from R-br, click here. >> NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml> >> >> >> >> >> _______________________________________________ R-br mailing list [hidden >> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=6> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de >> postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo >> reproduz�vel. >> >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list[hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=7>https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça código mínimo reproduzível. >> >> >> >> _______________________________________________ R-br mailing list [hidden >> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=8> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de >> postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo >> reproduz�vel. >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657017&i=9> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> >> ------------------------------ >> If you reply to this email, your message will be added to the >> discussion below: >> >> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657017.html >> To unsubscribe from R-br, click here. >> NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble:email.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble:email.naml-instant_emails%21nabble:email.naml-send_instant_email%21nabble:email.naml> >> >> >> >> >> _______________________________________________ R-br mailing list [hidden >> email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=4> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br Leia o guia de >> postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forne�a c�digo m�nimo >> reproduz�vel. >> >> _______________________________________________ >> R-br mailing list >> [hidden email] <http://user/SendEmail.jtp?type=node&node=4657020&i=5> >> https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br >> Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia) e forneça >> código mínimo reproduzível. >> >> *prdm.Rd* (1K) Download Attachment<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/attachment/4657020/0/prdm.Rd> >> >> >> ------------------------------ >> If you reply to this email, your message will be added to the >> discussion below: >> >> http://r-br.2285057.n4.nabble.com/R-br-Duvida-Criando-pacotes-para-o-R-tp4657007p4657020.html >> To unsubscribe from R-br, click here<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=unsubscribe_by_code&node=3357982&code=cGVkcm8ucmFmYWVsLm1hcmluaG9AZ21haWwuY29tfDMzNTc5ODJ8NTAyMjI0MDYw> >> . >> NAML<http://r-br.2285057.n4.nabble.com/template/NamlServlet.jtp?macro=macro_viewer&id=instant_html%21nabble%3Aemail.naml&base=nabble.naml.namespaces.BasicNamespace-nabble.view.web.template.NabbleNamespace-nabble.view.web.template.NodeNamespace&breadcrumbs=notify_subscribers%21nabble%3Aemail.naml-instant_emails%21nabble%3Aemail.naml-send_instant_email%21nabble%3Aemail.naml> >> > >