Hélio, boa tarde!
Poderia disponibilizar o CMR e os dados que geram o erro?
Também seria bom o sessionInfo() com geoR carregada, pra ver a versão. Esse warning é pra avisar que o comando da {sp} mudou. Poderia ser uma instrução de uma versão antiga da geoR. Mas não deve causar maiores problemas.
Até mais,
Éder Comunello <comunello.eder@gmail.com>
Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]