Edson,

A TukeyHSD() não desdobra interação. Ela compara os efeitos principais e comparar todos os efeitos de interação entre si. Isso não é o desdobramento usual que fazemos em estatística experimental. Na situação de desbalanceamento e presença de interação, os contrastes da TukeyHSD() são viesados. Desdobrar essa interação na presença de desbalanceamento requer muita algebra e código R. Até onde eu conheço não tem função que retorne isso pronto. Coloquei um procedimento exemplo de como eu tenho feito isso nas Rídiculas do LEG, http://www.leg.ufpr.br/doku.php/ridiculas.

À disposição.
Walmes.

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Walmes Marques Zeviani
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