Toni, Há duas formas de dependências a ser atendidas se você deseja instalar um pacote no R. A que vc cita seria aquela a ser respeitada quando uma instalação do R foi toda atualizada e seus pacotes sempre instalados "por dentro" do R via install.packages(), a outra é a que o sistema de empacotamento do Debian da sua distro reconhece como as dependências que os empacotadores decidiram fazer. Assim, no caso do r-cran-factoextra, num Ubuntu Focal Fossa tem-se: $ apt show r-cran-factoextra Package: r-cran-factoextra Version: 1.0.7-1cran1.2004.0 Priority: optional Section: gnu-r Source: factoextra Maintainer: cran2deb4ubuntu <cran2deb4ubuntu@gmail.com> Installed-Size: 470 kB Depends: r-base-core, r-cran-ggplot2, r-cran-abind, r-cran-cluster, r-cran-dendextend, r-cran-factominer, r-cran-ggpubr, r-cran-reshape2, r-cran-ggrepel, r-cran-tidyr . . . $ O busílis é que essas dez dependências multiplicam-se e no caso da instalação nesta máquina chegam a 37. A dica está na continuação, além das dependências há também as "importações" e por óbvio se a funcionalidade dessas importações inexistirem, o pacote não carrega a contento... Da página do link <https://cran.r-project.org/web/packages/factoextra/index.html> apontado por vc tem-se: Imports: abind, cluster, dendextend, FactoMineR, ggpubr(>= 0.1.5), grid, stats, reshape2, ggrepel, tidyr e Suggests: ade4, ca, igraph, MASS, knitr, mclust A versão do meu R é também a "Bird Hippie" por isso, suspeito que a reinstalação vai deixar tudo OK. HTH -- Cesar Rabak On Tue, Mar 8, 2022 at 4:50 PM Toni por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Olá Pessoal!!! Obrigado pelas respostas, vou tentar compilar tudo em um e-mail só:
Daniel / César : Sim, ele instala mas quando é pacote ".deb" ele não busca no repositório a menos que eu force, normalmente, eu faço a dpkg e em caso de dependência, faço a instalação de tudo que faltou depois com <apt -f install> que aí ele instala sem problemas mas precisa ter um repositório com os pacotes.
Rodolfo: Esse erro é resultado da compilação do pacote através do Rstudio, ao tentar rodar o <install.packages>, depois que ele terminar de compilar tudo é essa a mensagem que aparece no final.
Fernando: Essa possibilidade ainda não fiz, acredito que pode ser um problema de versão sim, vou tentar e posto aqui o resultado mas queria saber se alguém conseguiu rodar esse pacote e, se sim, qual a versão do R utilizada. Acredito que essA grande quantidade de dependências tem alguma coisa haver com isso, por isso, seria bom ver se alguém tem esse pacote instalado e qual a versão do R utilizada porque eu já ia na versão certa.
A questão é que pelo site: https://cran.r-project.org/web/packages/factoextra/index.html Os requisitos são: Depends: R (≥ 3.1.2), ggplot2 (≥ 2.2.0)
E o que eu tenho aqui é:
packageVersion("ggplot2") [1] ‘3.3.5’ R version 4.1.2
Mas vou tentar reinstalar tudo aqui novamente para ver. Vlw Pessoal!!!
Toni
On Tue, Mar 8, 2022 at 4:01 PM Cesar Rabak por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Aditamento:
Na minha instalação: GNU/Linux 20.04.1-Ubuntu SMP 5.13.0-30-generic x86_64
Uma tentativa de instalar o factoextra via o gerenciador de pacotes synaptic mostra-me 37 dependências.
On Tue, Mar 8, 2022 at 3:54 PM Cesar Rabak <cesar.rabak@gmail.com> wrote:
Como a questão roda em volta de uma tentativa de instalação numa distro que usa o gerenciador de pacotes Debian, sugiro que se coloque na linha de comando da instalação (via o gerenciador de pacotes) as chaves que façam a instalação automática das dependências.
Caso alguma entre em *deadlock* (atualmente mais raro, mas ainda não afastado como impossível) será necessário examinar qual conflito existe com algo externo ao R em si, pode ser bibliotecas de runtime do gcc, etc.
HTH
On Tue, Mar 8, 2022 at 2:09 PM Daniel Guimarães Tiezzi por (R-br) < r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Problemas com dependências impedem a configuração de r-cran-factoextra: r-cran-factoextra depende de r-cran-ggplot2 (>= 2.2.0); porém: Pacote r-cran-ggplot2 não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-abind; porém: Pacote r-cran-abind não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-dendextend; porém: Pacote r-cran-dendextend não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-factominer; porém: Pacote r-cran-factominer não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-ggpubr (>= 0.1.5); porém: Pacote r-cran-ggpubr não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-reshape2; porém: Pacote r-cran-reshape2 não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-ggrepel; porém: Pacote r-cran-ggrepel não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-tidyr; porém: Pacote r-cran-tidyr não está instalado.
Segundo estas informações é necessário a instalação prévia desses pacotes. Geralmente ele instala automaticamente. No entanto, pode haver alguma biblioteca do GNU/Linux que seja necessária para instalar um ou mais pacotes. Geralmente, este erro aparece no console. Como o colega Rodolfo disse, é necessário verificar todo o log de erro da instalação.
daniel
On Mar 8, 2022, at 10:42 AM, Toni por (R-br) <r-br@listas.c3sl.ufpr.br> wrote:
Problemas com dependências impedem a configuração de r-cran-factoextra: r-cran-factoextra depende de r-cran-ggplot2 (>= 2.2.0); porém: Pacote r-cran-ggplot2 não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-abind; porém: Pacote r-cran-abind não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-dendextend; porém: Pacote r-cran-dendextend não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-factominer; porém: Pacote r-cran-factominer não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-ggpubr (>= 0.1.5); porém: Pacote r-cran-ggpubr não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-reshape2; porém: Pacote r-cran-reshape2 não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-ggrepel; porém: Pacote r-cran-ggrepel não está instalado. r-cran-factoextra depende de r-cran-tidyr; porém: Pacote r-cran-tidyr não está instalado.
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