José Wellingthon,

Devo assumir que você declarou um modelo de efeitos aleatórios (lme4, nlme)?

Se sim, não conheço implementação de Scott Knott para essa classe de modelos no R.

Apesar de muito popular, no meu entendimento a aplicação do teste de Scott Knott é muitas vezes mal interpretada. Não é um teste de comparações múltiplas mas, devido ao hábito dos usuŕios é interpretado como se fosse. De qualquer forma, não é o cerne da sua questão.

O pacote ScottKnott (que foi desenvolvido por membros dessa lista: Enio Jelihovschi, José Cláudio Faria e Ivan Bezerra Allaman) tem a função SK.nest() para ser usada em modelos de classe `aovList`, que representa modelos de mais de um estrato quando se usa o termo Error() na fórmula da aov(). Se usa muito para delineamentos em parcela subdivida e serve para análise conjunta de experimentos também. Mas o requisito é balanceamento. Aqui você tem exemplos que podem ser adaptados: http://leg.ufpr.br/~walmes/mpaer/analise-conjunta-de-experimentos.html.

Se você declarar o modelo de efeitos mistos com a lme4 ou nlme, aí pode usar a combinação de pacotes `lsmeans` e `multcomp` para sair com comparações múltiplas, sejam por contrastes planejados, todas duas a duas, todos contra testemunha, etc. O uso desses pacotes com modelos de efeitos mistos você encontra exemplos aqui: http://leg.ufpr.br/~walmes/mpaer/delineamento-em-latice.html.

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On Fri, Oct 25, 2019 at 7:37 AM Jose Wellingthon Dos Santos <jose-wellingthon.santos@embrapa.br> wrote:

Prezado prof Walmes, bom dia.
Em uma análise conjunta que fiz, a interação Cultivar x Local foi significativa. Precisa desdobrá-la e aplicar o teste Skott-Knott nas medias de cultivar dentro de cada Local. Como fazê-lo?
Att

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José Wellingthon dos Santos
Pesquisador - Métodos Quantitativos
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