Para umidade do solo eu geralmente a função de paleta de cores tim.colors() do pacote fields. require(fields) # para paleta tim.colors() library(repmis) # reads text data directly from dropbox - no need to download any file # read data url <- 'https://dl.dropboxusercontent.com/u/27700634/precip.txt' tmp <- repmis::source_data(url, sep = '', header = TRUE) # convert julian day to date date <- as.Date(tmp$julian, origin='2011-12-31') data <- cbind(date, tmp) head(data) # define vector with depth of soil layers depths <- c(0.05,0.10,0.20,0.30, 0.40,0.60,0.80,1.00, 1.50,2.00,2.50) ## colunas de interesse na ordem adequada para plot do perfil cols <- ncol(data):4 # Plot soil moisture profile # como são profundidades (abaixo da superfície) use a convenção de z negativo # acrescentei a chuva, precisa ajustar ylabels, mtext() resolve x11() nl <- 32 op <- par(mar = c(3,4,12,3)) plot <- filled.contour(date, sort(-depths), as.matrix(data[, cols]), ylab = expression(theta(m^3~~m^-3)), col = rev(tim.colors(nl)) ) par(new=T,mar=c(23,4,1,8)) with(data, plot(date, precip, type = "h", xaxt = "n", xpd = T, xaxs="i", ylab = "Precip (mm)", xlab = "")) par(op) 2014-09-18 11:46 GMT-03:00 Wenceslau Teixeira <wgt007@gmail.com>:
Caros colegas do R,
muito bacana o script disponibilizado para traçar os perfis de umidade do solo. Será útil para nós. Só gostaria de trocar as cores, com valores mais alto (umido) para azul e valores mais baixos (solo seco) para vermelho, assim o gráfico fica mais cognitivo. Alguém sabe como mudar as cores ?
Cordialmente,
Wenceslau Teixeira Embrapa Solos
library(repmis) # reads text data directly from dropbox - no need to download any file # read data url <- 'https://dl.dropboxusercontent.com/u/27700634/precip.txt' tmp <- repmis::source_data(url, sep = '', header = TRUE)
# convert julian day to date date <- as.Date(tmp$julian, origin='2011-12-31') data <- cbind(date, tmp) head(data) # define vector with depth of soil layers depths <- c(0.05,0.10,0.20,0.30, 0.40,0.60,0.80,1.00, 1.50,2.00,2.50)
# teste com lattice cols <- ncol(data):4 levelplot(as.matrix(data[, cols]), aspect = "fill", xlab = "date", ylab = "soil Moist.", scales = list(x = list(at = which(date %in% pretty(date)), labels = pretty(date)), y = list(at = length(cols):1, labels = depths)), contour = T)
# Plot soil moisture profile
# como são profundidades (abaixo da superfície) use a convenção de z negativo # acrescentei a chuva, precisa ajustar ylabels, mtext() resolve
x11() op <- par(mar = c(3,4,12,3)) plot <- filled.contour(date, sort(-depths), as.matrix(data[, cols]), ylab = expression(theta(m^3~~m^-3))) par(new=T,mar=c(23,4,1,8)) with(data, plot(date, precip, type = "h", xaxt = "n", xpd = T, xaxs="i", ylab = "Precip (mm)", xlab = "")) par(op)
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