Walmes, Obrigado pela prontidão! Pois bem, rodei o seu código... eis que: sua implementação confere com os resultados esperados relativos ao ajuste das médias com recuperação da informação interbloco (popmeans, do doBy quando o modelos é ajustado pelo lme()). No primeiro ajuste,, o do aov, o popmeans retorna as próprias médias aritméticas dos tratamentos, sem qualquer ajuste! O teste correto da soma de quadrados de tratamentos ajustados confere com Cochran & Cox! Infelizmente ainda não consegui recuperar as médias ajustadas intrabloco, mas com certeza o que é posto por você ajuda e muito! Obrigado... abraço, FH 2012/11/15 Walmes Zeviani <walmeszeviani@gmail.com>
Fernando,
Já rodei os exemplos do Pimentel e do Ramalho et al. Implementação de ambos estão disponíveis nos scripts que levei para o Curso mais recente que dei na Embrapa Arroz e Feijão (que terminei ontem). O link para arquivos do curso é esse
http://www.leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/cnpaf2/
Pegue o script lati.R. Eu nunca olhei a implementação do C&Cox e fiquei curioso e imaginando será que os livros divergem? Meus códigos reproduzem o Pimentel. Bem, com os seus dados a análise que atualmente faço é essa
rm(list=ls(all=TRUE)); ls() download <- read.table('http://dl.dropbox.com/u/38195533/dados_CC.txt', header = TRUE, # com cabecalho sep = '\t', # separador de celulas <TAB> dec = ',', # separador de decimal <, (virgula)> na.string = '.') # indicador de omissao str(download)
## lendo e transformando variaveis em fator dados <- transform(download, trat = factor(trat), # transforma em fator rep = factor(rep), # idem bloco = factor(bloco)) # ...
all(complete.cases(dados)) # completo xtabs(~rep+trat, dados) xtabs(~rep+bloco, dados) xtabs(~bloco+trat+rep, dados)
str(dados) # estrutura da planilha
m0 <- lm(terms(resp~rep/bloco+trat, keep.order=TRUE), data=dados) anova(m0)
require(doBy) popMeans(m0, effect="trat")
require(nlme) dados$blocoin <- with(dados, interaction(rep, bloco, drop=TRUE)) mm0 <- lme(resp~rep+trat, random=~1|blocoin, dados) anova(mm0)
popMeans(mm0, effect="trat")
À disposição. Walmes.
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