Oi Marcos,
Concordo com o que vc falou sobre o Ward, mas continuo sem
entender o que o R faz.
Veja bem meu raciocínio:
Segundo Mingoti (2005) o método de Ward faz o seguinte:
1 - Calcula a soma de quadrados dentro de cada conglomerado;
2 - Calcula a soma de quadrados entre dois conglomerados;
3 - Os dois conglomerados que minimizam a distância calculada
no item 2 são combinados.
Então, ao meu ver, não precisaria de uma matriz de distância
como o R pede já que o próprio método de Ward já utiliza a soma
de quadrados para agrupar os indivíduos mais homogêneos.
Vou ler o material sugerido,
abraço
Em 27 de janeiro de 2013 19:04, Marcos
Vital
<marcosvital@gmail.com>
escreveu:
Bruno, na verdade o método de Ward precisa sim da
matriz de distância como os outros métodos de clsuter;
o que muda é a forma como ele cria o dendograma.
Ele calcula a soma dos quadrados das distâncias entre os
objetos, dividida pelo número de objetos, buscando
minimizá-la. Então é necessária uma matriz de distância
como nos outros casos, e o que muda na função hclust é o
argumento method="ward".
Se tiver acesso, veja o excelente
Numerical Ecology
with R (Bocard, Gillet & Legendre, 2011), que é
uma excelente fonte para estudar métodos multivariados no
R (o foco é em Ecologia, mas com certeza pode ser útil em
outros casos).
Abraços
Marcos
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R-br@listas.c3sl.ufpr.br
https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br
Leia o guia de postagem (http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia)
e forneça código mínimo reproduzível.
--
Bruno C. Vidigal
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