Ok... Comentários específicos  para suas perguntas:

1) experimente armazenar a saída do read.csv.sql numa variável... Ex

X = read.csv.sql(todos os seus argumentos)

Vc verá os warnings, são apenas mensagens de aviso, não erros.

Alternativamente, use o sqlite na linha de comando mesmo... E vc pode importar o seu csv diretamente daqui, sem necessitar do sqldf.

para regressões, use biglm

2) evite mexer com swap. Use isso apenas como ultimo recurso

3 para auxiliar no garbage collection, ao trabalhar com grandes volumes de dados, remova os objetos desnecessários e, em seguida, use gc(). O R não é mau o suficiente para manter em memória objetos que vc já removeu. Esse recurso é algo do seu sistema operacional, que mantém em cache objetos que vc usou recentemente, para que não precise carregar novamente qdo vc tentar trabalhar naqueles dados de  novo. O gc() vai avisar ao sistema operacional que pode limpar a cache, etc etc etc.

4) na real, paralelismo não tem muito como te ajudar nessa tarefa.

b

On Wednesday, 17 October 2012, Roney Fraga wrote:
Muito obrigado a todos pelas contribuições, já tenho material para estudar algumas semanas.

Benilton, é 64 bit.
> .Machine$sizeof.pointer 
[1] 8

Abraço
Roney