Benilton, obrigado. Vou ler sobre o pacote Rclusterpp. <br><br>Elias, não sei o que é &quot;CMR&quot;, desculpe me. Caso seja algum exemplo que se possa reproduzir, o que estou fazendo é a continuação de outra mensagem que escrevi e que você me deu uma ótima dica.<br>
<br>dis&lt;-vegdist(dados,&quot;bray&quot;)<br>clu&lt;-hclust(dis,&quot;ward&quot;)<br><br>A matriz de dados que estou utilizando 20 mil linhas e 31 colunas. Para fazer a linha do hclust estou gastando mais que três horas. Tenho matrizes maiores que não rodaram por falta de memória, mas isto já é outro tópico, certo?<br>
<br>Abraços,<br><br>Antônio<br><br><br><br><br><br><br><div class="gmail_quote">Em 7 de março de 2012 09:43, Elias T. Krainski <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:eliaskrainski@yahoo.com.br">eliaskrainski@yahoo.com.br</a>&gt;</span> escreveu:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div><div style="font-size:12pt;font-family:times new roman,new york,times,serif"><div><span>com um CMR seria mais facil postar uma dica :)</span></div>
<div> </div><div>Elias T. Krainski<br><blockquote style="border-left:2px solid rgb(16,16,255);margin-left:5px;margin-top:5px;padding-left:5px">  <div style="font-size:12pt;font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif">
 <div style="font-size:12pt;font-family:&#39;times new roman&#39;,&#39;new york&#39;,times,serif"> <div dir="ltr"> <font face="Arial"> <hr size="1">  <b><span style="font-weight:bold">De:</span></b> Antonio Silva &lt;<a href="mailto:aolinto.lst@gmail.com" target="_blank">aolinto.lst@gmail.com</a>&gt;<br>
 <b><span style="font-weight:bold">Para:</span></b> R-br &lt;<a href="mailto:r-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">r-br@listas.c3sl.ufpr.br</a>&gt; <br> <b><span style="font-weight:bold">Enviadas:</span></b> Quarta-feira, 7 de Março de 2012 9:20<br>
 <b><span style="font-weight:bold">Assunto:</span></b> [R-br] sobre a
 utilização de processamento em vários núcleos<br> </font> </div><div><div class="h5"> <br><div>Olá,<br><br>Rodo o R 64-bit no Ubuntu 10.04 em uma máquina com processador Core i7 e 8 Gb de RAM.<br><br>Nesta semana começei a fazer uma análise de cluster, utilizando basicamente o pacote vegan, sobre uma matriz grande.<br>

<br>O cálculo das ligações (hclust) levou três hora e meia para ser efetuado (!!!). Vi que apenas um núcleo do processador estava sendo utilizado.<br><br>Começei então a procurar alternativas que permitissem o aceleramento dos cálculos e a utilização dos outros núcleos, que estão sub-utilizados.<br>

<br>Li sobre o pacote multicore e outros, inclusive em mensagens nesta lista. Muitas coisas não ficaram claras para mim e, no final, não compreendi como proceder sua utilização no meu caso (ou mesmo se é possível).<br><br>

É possivel rodar uma análise de cluster fazendo utilização dos diversos núcleos?<br><br>Agradeço qualquer orientação e/ou indicação de documentação.<br><br>Abraços,<br><br>Antônio<br clear="all"><br>-- <br>Antônio Olinto Ávila da Silva<div>

Biólogo / Oceanógrafo</div><div>Instituto de Pesca<br></div><div>São Paulo, Brasil</div><br>
</div><br></div></div><div class="im">_______________________________________________<br>R-br mailing list<br><a href="mailto:R-br@listas.c3sl.ufpr.br" target="_blank">R-br@listas.c3sl.ufpr.br</a><br><a href="https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br" target="_blank">https://listas.inf.ufpr.br/cgi-bin/mailman/listinfo/r-br</a><br>
Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br><br> </div></div> </div> </blockquote></div>   </div></div>
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R-br mailing list<br>
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Leia o guia de postagem (<a href="http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia" target="_blank">http://www.leg.ufpr.br/r-br-guia</a>) e forneça código mínimo reproduzível.<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br>Antônio Olinto Ávila da Silva<div>
Biólogo / Oceanógrafo</div><div>Instituto de Pesca (Fisheries Institute)</div><div>São Paulo, Brasil</div><br>