Exatamente Éder,

você chegou exatamente onde eu gostaria, mas continuando seu código ao  plotar  plot(as.dendrogram(hc),main = "")  cria os grupos  e separa os ACs, os  Als e os AMs no dendograma e eu gostaria de apenas um Estado no agrupamento! Pensei o seguinte! 

V1=tapply(df$V1,df$UF, sum)  # Ou trocar pelo mean

V2=tapply(df$V2,df$UF, sum)  # Ou trocar pelo mean

dadostotal=cbind(V1,V2)

hc<-hclust(dist(dadostotal),method='ward.D')

plot(as.dendrogram(hc),main = "Cluster Dendrograma")

rect.hclust(hc, k = 2, border = "red")

require(bpca) 

summary(bpca(dadostotal, scale=TRUE))

plot(bpca(dadostotal, scale = T,d=1:2))

resultado=prcomp(dadostotal, scale=T)

summary(resultado)

biplot(resultado)

Ando estudando um pouco de multivariada sozinho aqui e me veio desde o primeiro poster a pergunta: Se eu teria e suporte técnico para argumentar o que fiz?   Já que não consigo analisar com banco de dados repetidos (Com estas duas propostas e que não são as melhores!).  Gostaria aqui de ouvir dos que conhecem do assunto, pois sempre tem dados da biologia com esta estrutura e muitas vezes o cara diz tal programa eu faço e eu no R não consigo andar. 

obrigado a todos! 

 

André Oliveira Souza.
Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo.  IFES

Em Terça-feira, 14 de Abril de 2015 23:10, Éder Comunello <comunello.eder@gmail.com> escreveu:

Andre, boa noite!

Uma ideia que talvez possa ajudar...

### <code r>

### dados fictícios!

df <- data.frame(UF=rep(c("AC","AL","AM"), each=4), ano=rep(2003:2006, 3), V1=rnorm(12), V2=rnorm(12))

df

### criando rownames únicos a partir dos dados...

rownames(df) <- paste0(df$UF, df$ano)

df

PCA <- prcomp(df[3:4],scale=T) ### informar as variáveis númericas

hc  <- hclust(dist(df[3:4]), method='ward.D')

### </code>

Éder Comunello <comunello.eder@gmail.com>
Dourados, MS - [22 16.5'S, 54 49'W]

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