A mensagem de erro é clara. O arquivo não existe ou o diretório não pode ser encontrado.

Use o mesmo caminho que estava usando, apagando 

sep=";", dec=",",header=TRUE

e colocando o que o Benilton sugeriu, ou seja, faça:

GBS <- read.csv("C:/GS_tutorial/DatasetS2_29SAWSN_gbs.csv", 
                         header=TRUE, 
                         stringsAsFactors=FALSE)

e prossiga do mesmo jeito que vai dar certo.

(s,f,p)
Allaman