Você pode 1) trocar a representação de decimal nas saídas do R. Para isso defina no primeiro chunk do seu arquivo options(OutDec=",") Assim você declarou que virgula será usado para representar os decimais (dec) nas saídas (output). As saídas incluem os gráficos que vão sair com vírgula também 2) Você também pode fazer isso pelo Latex. Chame o pacote siunitx (si: sistema internacional, unit=unidades, x=?) e declare a opção de usar virgula como decimal. No preâmbulo ficaria assim \usepackage{siunitx} \sisetup{decimalsymbol=comma} Para isso os número tem que estar dentro de ambientes do pacote, como o \num{} e \SI{}. Mesmo que você escreva estes com ponto no pdf estarão com vírgula. O siunitx traz uma infinidade de recursos que vão desde alterar os padrão das unidades de medida, número, ângulos até permitir alinhamento de valores pelo decimal em tabelas, que é algo que dá uma estética e legibilidade superior principalmente em tabelas longas. É possível inclusive alinhar os valores pelo sinal de mais ou menos que separa média de desvio padrão. Tem ambientes para escrever números em notação cientifica e muito mais. Dá até mesmo para declarar global ou localmente, qual o número de casas decimais a usar. Vale a pena consultar a documentação. Eu fiquei surpreso com os recursos. Assumindo que ele esteja instalado, no terminal do linux se consulta com $ texdoc siunitx Verifique a versão disponível no seu sistema. O nome dos argumentos no \sisetup{} muda com a versão. À disposição. Walmes.