Bom dia amigos, minha dúvida é específica do RMarkdown hoje. Seguinte, irei automar relatórios que serão formatados no Mark, sendo salvos em html. Como reproduzível, coloco abaixo esse exemplo, que é executado em arquivo *.Rmd.
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title: "Relatório"
author: "Diogo"
output:
html_document
---
```{r informações do participante, echo = FALSE, include = FALSE}
library(tidyr)
library(dplyr)
library(rmarkdown)
library(kableExtra)
cli<-rep(1,10);x<-round(rnorm(10,10,1),2);e<-round(rnorm(10,0,1),2);y<-x+e;dados_ini<-data.frame(cbind(cli,x,y))
dados<-dados_ini %>% filter(cli==1)
```
```{r tabela, echo = FALSE}
tabela<-data.frame(dados[,c(2,3)])
tabela %>% kbl()
```
```{r gráfico, echo = FALSE}
plot(x,y)
```
Aplicando o famoso botão "knitr", ele me retorna o relatório em html
COM o gráfico.
Acontece que para a automação, terei de usar o comando render dentro de uma function, para poder formatar o relatório. Ao aplicar o mesmo comando nessa estrutura, eu gero tabela e gráfico dentro de um arquivo R, e depois chamo o comando render. Da seguinte forma:
library(tidyr)
library(dplyr)
library(rmarkdown)
library(kableExtra)
cli<-rep(1,10);x<-round(rnorm(10,10,1),2);e<-round(rnorm(10,0,1),2);y<-x+e;dados_ini<-data.frame(cbind(cli,x,y))
dados<-dados_ini %>% filter(cli==1)
tabela<-data.frame(dados[,c(2,3)])
graf<-plot(x,y)
render(input="c:/users/diogo/desktop/rmarkdown_via render_listaR.Rmd",
output_format = "html_document",
output_file = "relatório.html",
output_dir = "c:/users/diogo/desktop/")
Sendo que o arquivo Rmarkdown "rmarkdown_via render_listaR.Rmd" tem essa estrutura dentro:
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title: "Relatório"
author: "Diogo"
output:
html_document
---
```{r tabela, echo = FALSE}
tabela %>% kbl()
```
```{r gráfico, echo = FALSE}
print(graf)
```
O meu problema é que em ambos os casos, eu até obtenho as mesmas tabelas, mas nesse segundo modo (que é o que viabiliza a function, para formatar vários relatórios), ele me retorna o relatório em html dessa vez SEM o gráfico.
Enfim a dúvida: alguém sabe se tem algum subcomando dentro do render, ou opção, para forçar o gráfico a aparecer na segunda forma (usando o comando render)? Ou se estou aplicando alguma funcionalidade erradamente?
Obrigado e bom dia aos amigos!!!
Diogo Jerônimo
Bacharel em Ciências Estatísticas - ENCE/IBGE
Mestre em Metrologia - PUC-Rio/PósMQI
http://lattes.cnpq.br/8996149312896520