Eu tenho alguns documentos com análises feitas que podem servir de inspiração (links abaixo), mas como você disse que é iniciante, recomendo que use o pacote ExpDes.

http://leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/ciaeear/ciaeear_08fat.html

http://leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/geneticaEsalq/script11.html

http://leg.ufpr.br/~walmes/cursoR/geneticaEsalq/script12.html

https://ridiculas.wordpress.com/tag/expdes/

À disposição.

Walmes.