Aqui funcionou:

> ano <-c(2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011)
> cultivar <-c("c1","c1","c1","c1","c2","c2","c2","c2","c3","c3","c3","c3","c4","c4","c4","c4")
> produtividade <- c(3000,4023,5432,3212,4567,6543,5467,2345,3245,99,5467,7654,3214,1234,5456,-99)
> exemplo <- data.frame(ano,cultivar, produtividade)
> aggregate(produtividade ~ cultivar, mean, data = exemplo)

  cultivar produtividade
1       c1       3916.75
2       c2       4730.50
3       c3       4116.25
4       c4       2451.25


2015-11-25 15:55 GMT-02:00 joão Rodrigo Castro <joaorodrigo2005@gmail.com>:
Não roda :/

Error in as.data.frame.default(x) :
cannot coerce class "formula" into a data.frame

Em 25 de novembro de 2015 15:36, Rodrigo Coster <rcoster@gmail.com> escreveu:
Isso?

aggregate(produtividade ~ cultivar, mean, data = exemplo)

2015-11-25 15:32 GMT-02:00 joão Rodrigo Castro <joaorodrigo2005@gmail.com>:
Prezados,

Estou com uma dificuldade de atribuir uma função à parte de um vetor.
Suponhamos o seguinte data.frame:
ano <-c(2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011,2008,2009,2010,2011)
cultivar <-c("c1","c1","c1","c1","c2","c2","c2","c2","c3","c3","c3","c3","c4","c4","c4","c4") produtividade <- c(3000,4023,5432,3212,4567,6543,5467,2345,3245,99,5467,7654,3214,1234,5456,-99)
exemplo <- data.frame(ano,cultivar, produtividade)


Gostaria de calcular separadamente as médias das produtividades de cada uma das cultivares, para o intervalo de anos agrícolas (2008-2011).

Desde já agradeço a colaboração,


--
João Rodrigo de Castro
Programa de Pós-Graduação em Meteorologia - Universidade Federal de Pelotas
Bolsista Laboratório de Agrometeorologia - Embrapa Clima Temperado

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