Obrigado Éder, Na verdade não tinha atentado a isso, mas agora deu outro erro, sendo: Error in apply(results, 1, function(x) { : dim(X) must have a positive length
str(tableFE99) Error in head(tableFE99) : objeto 'tableFE99' não encontrado
O CRM que estou usando é: ### <code r> require(RCurl); require(XML) ## Função de leitura da tabela readFE<- function (x, URL = ""){ url0 <- URL url1 <- gsub("(^.*)(/s/.*)(\\?.*$)", "https://dl.dropboxusercontent.com\\2", url0); url1 page <- getURL(url1) classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor") tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]] x<-NULL results <- x results <- x results<-results[!apply(results,1,function(x){any(x=="(NULL)")}),] results<-subset(results, !(latitude == "0.00000000" | longitude == "0.00000000")) results } #--# ## Tentativa de leitura da tabela tableFE99<-readFE(URL="https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1") str(tableFE99) ### </code> -- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone: (+55) 65 8132-8112 (TIM) (+55) 65 9686-6970 (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br Lattes: http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 OrcID: orcid.org/0000-0001-8232-6722 Researchgate: https://www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10 LinkedIn: https://br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635 ====================================================================== Em 30/01/2016 14:43, Éder Comunello escreveu:
Senhores, boa tarde!
Na forma que sugeri é necessário alterar o link "default" do dropbox pra acessar diretamente o arquivo.
### <code r> require(RCurl); require(XML) url0 <- "https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1" url1 <- gsub("(^.*)(/s/.*)(\\?.*$)", "https://dl.dropboxusercontent.com\\2", url0); url1
page <- getURL(url1) # page <- getURL(url1, ssl.verifypeer = FALSE) classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor") tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]] str(tableFE) ### </code>
================================================ Éder Comunello PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]
Em 30 de janeiro de 2016 12:17, Paulo Nogueira Starzynski <paulons@gmail.com <mailto:paulons@gmail.com>> escreveu:
Alexandre, no teste que fiz aqui, o problema é na leitura da tabela. A função getURL não está retornando conteúdo que a função readHTMLTable possa extrair.
>URL="https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1" > page <- RCurl::getURL(URL) > page [1] "<html>\r\n <head><title>Found</title></head>\r\n <body>\r\n <h1>Found</h1>\r\n <p>The resource was found at <a href=\"https://dl.dropboxusercontent.com/content_link/tkauy9obP7pgxKYpb9j5ZR2LCSUTe2iJpaULTWEN4RzdfR6AtirbNWGtt8q9Ncex/file?dl=1\ <https://dl.dropboxusercontent.com/content_link/tkauy9obP7pgxKYpb9j5ZR2LCSUTe2iJpaULTWEN4RzdfR6AtirbNWGtt8q9Ncex/file?dl=1%5C>">https://dl.dropboxusercontent.com/content_link/tkauy9obP7pgxKYpb9j5ZR2LCSUTe2iJpaULTWEN4RzdfR6AtirbNWGtt8q9Ncex/file?dl=1</a>;\r\nyou should be redirected automatically.\r\n\r\n<!-- --></p>\r\n <hr noshade>\r\n <div align=\"right\">WSGI Server</div>\r\n </body>\r\n</html>\r\n"
Abraços, Paulo
Em 30 de janeiro de 2016 12:16, ASANTOS <alexandresantosbr@yahoo.com.br <mailto:alexandresantosbr@yahoo.com.br>> escreveu:
Bom dia Éder,
Tentei criar uma função com os comandos de leitura da tabela em HTML e também não funfou, posso pedir novamente sua ajuda, Obrigado,
## Função de leitura da tabela readFE<- function (x, URL = ""){
page <- getURL(URL) classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor") tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]] x<-NULL results <- x results <- x results<-results[!apply(results,1,function(x){any(x=="(NULL)")}),] results<-subset(results, !(latitude == "0.00000000" | longitude == "0.00000000")) results } #--#
## Tentativa de leitura da tabela tableFE<-readFE(URL="https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1" <https://www.dropbox.com/s/foeh9oqbiqlawvg/TALHOES_AGENTE2.htm?dl=1>) head(tableFE) #---------------
-- ====================================================================== Alexandre dos Santos Proteção Florestal IFMT - Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso Campus Cáceres Caixa Postal 244 Avenida dos Ramires, s/n Bairro: Distrito Industrial Cáceres - MT CEP: 78.200-000 Fone:(+55) 65 8132-8112 <tel:%28%2B55%29%2065%208132-8112> (TIM)(+55) 65 9686-6970 <tel:%28%2B55%29%2065%209686-6970> (VIVO) e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br <mailto:e-mails:alexandresantosbr@yahoo.com.br> alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br <mailto:alexandre.santos@cas.ifmt.edu.br> Lattes:http://lattes.cnpq.br/1360403201088680 OrcID:orcid.org/0000-0001-8232-6722 <http://orcid.org/0000-0001-8232-6722> Researchgate:https://www.researchgate.net/profile/Alexandre_Santos10 LinkedIn:https://br.linkedin.com/in/alexandre-dos-santos-87961635 ======================================================================
Em 29/01/2016 08:41, Éder Comunello escreveu:
Alexandre, bom dia!
Não havia atentado para o problema na importação das tabelas, sendo necessário definir as classes. Além disso, na função você deve se referir a "db" antes que "tableFE" e "x" é definido internamente por lapply().
### <code r> require(RCurl); require(XML) url0 <- "https://www.dropbox.com/s/znmr0lwda2y6fc5/BD_teste2.html?dl=1" url1 <- gsub("(^.*)(/s/.*)(\\?.*$)", "https://dl.dropboxusercontent.com\\2", url0); url1 # [1] "https://dl.dropboxusercontent.com/s/znmr0lwda2y6fc5/BD_teste2.html"
page <- getURL(url1) tableFE <- readHTMLTable(page, head=T)[[1]] str(tableFE) ### todas variáveis estão como fatores - corrigir!
classes <- c(rep("factor", 6), rep("numeric", 4), "factor") tableFE <- readHTMLTable(page, head=T, colClasses=classes)[[1]] str(tableFE) ### OK! head(tableFE)
##Agregando os resultados aggPestFE <- function(db=tableFE, key="descricao"){ lista <- split(db, db[key]) result <- lapply(lista, function(x) aggregate(x[,7:8], by=list(x[,3],x[,2],x[,5]), mean)) return(result) }
### Devido aos "defaults", obtém mesmos resultados nas três formas que seguem: aggPestFE()[5] aggPestFE(tableFE)[5] aggPestFE(tableFE, "descricao")[5] # $`Lagartas Desfolhadoras` # Group.1 Group.2 Group.3 formiga_area qtd_destruido # 1 GN Chale 26 0 62.5 # 2 RD Corrego da Coruja 26 0 50.0 # 3 GN Aeroporto II 28 0 75.0
### </code>
================================================ Éder Comunello PhD Student in Agricultural Systems Engineering (USP/Esalq) Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) Dourados, MS, Brazil [22 16.5'S, 54 49.0'W]
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