Olá Marie

A exigência de valores únicos para row.names é inerente a formação do data.frame.
veja em:
?row.names
?data.frame

Provavelmente há algum nome duplicado.
Aplique e o script abaixo para ter uma ideia

## arquivo no formato CSV
## read.csv2 vem como default sep=";" e dec=","
## carregue os ddos sem indicar row.names
dados = read.csv2("C:\\endereço\\nomeArquivo.csv")

## verifica duplicatas
dados[duplicated(dados),]

## modifica os nomes para valores únicos
(rn = make.names(dados$X, unique = TRUE))

## visualiza row.names - linhas numeradas
rownames(dados)
dados

## nova row.names
rownames(dados) = rn
dados

## remove a coluna X
dados = dados[-1]
dados

## verifique
?duplicated
?make.names

saudações

Em 16/02/2016 10:43, Marie-Christine . escreveu:
Olá Salah,


Muitíssimo obrigada pela ajuda. Dessa vez deu certo e as análises rodaram tranquilamente ;).

Saberias, contudo, me dizer o motivo pelo qual o R só consegue interpretar a planilha da maneira desejada quando adicionamos
uma numeração junto aos nomes das estações? Porque no caso do meu exemplo, eu não tinha nome de estação duplicada...

Att.,

Marie


To: r-br@listas.c3sl.ufpr.br
From: salah3.1416@gmail.com
Date: Mon, 15 Feb 2016 20:20:02 -0200
Subject: Re: [R-br] Importação de planilha de contingência

Olá Marie

O erro: " double 'row.names' are not allowed" , significa que não é permitido duplicatas no row.names.
Sugiro você editar o nomes das estações amostrais numerando ou adicionando a data de coleta
No seu exemplo de tabela adicionei AS-B-D e o read.csv2 me deu o mesmo erro, quando acrescentei os números( AS-B-D6, AS-B-D7) carregou novamente.
Observe o row.names em aravo$spe , AR01, AR02,...,AR59



 Abu sp Abu vai Aca bi
AS-A-C1 0 0 0
AS-A-D2 1 0 0
AS-B-A3 1 0 1
AS-B-B4 0 0 0
AS-B-C5 0 0 0
AS-B-D6 0 0 0
AS-B-D7 0 0 0


O erro para read.xls: perl executable not found
ele não encontrou o executável perl, supondo que você esteja usando windows

## arquivo no formato XLSX
dados = read.xls("C://endereço//nomeArquivo.xlsx", sheet = 1, row.names = 1, perl = "C://endereço//perl.exe")


saudações

Em 15/02/2016 19:14, Marie-Christine . escreveu:
 double 'row.names' are not allowed


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