Bom que o problema se resolveu com os exemplos acima dos colegas da lista. Checagem de erro no R fora da biblioteca padrão é um caos mesmo. Poderia muito bem retornar algo diferente de string (NA por exemplo) e você ia checar e substituir como foi sugerido acima. Abraços Em 10 de maio de 2013 15:34, Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> escreveu:
# sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error = function(...)"verificar")) #
Isso era o que eu queria :), funcionou perfeitamente.
David, o taxisize retorna uma mensagem de erro que é uma String. Por exemplo eu guardava os resultados numa matriz de characters, onde uma coluna é o nome que usei para fazer a busca, a resposta quando da certo são o nome sugerido, um score que é referente a se o nome não esta desatualiado, se tem erro de digitação, se não mudou que são as coisas que eu guardo.
Ai usando o try() tava ficando uma mensagem enorme nas células, ai no r so imprimia 1 coluna por vez, ai eu queria que ele deixa-se uma palavra menor so para facilitar a visualização, ja que se não deu certo eu quero verificar caso a caso mesmo, ou posso tentar denovo so com o que falhou, porque existem muitos erros de nome de especie muito antigas, que mudou, essas coisas que não é para dar certo mesmo Mas acho que usando esse tryCatch ai dar certo agora. Eu imaginei que seria melhor deixar um exemplo mais simples, que produzia o mesmo efeito aqui, o efeito é mais ou menos o mesmo.
Mas muito obrigado pelas resposta. me ajudaram muito.
Abraços Augusto Ribas
Em 10 de maio de 2013 14:54, Henrique Dallazuanna <wwwhsd@gmail.com>escreveu:
Tente assim:
sapply(teste, function(x)tryCatch(log(x), error = function(...)"verificar"))
2013/5/9 Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com>
Ola, eu gostaria de saber, se tem como eu mudar de forma simples a mensagem de erro que o R envia ao tentar usar uma função e receber um erro.
Por exemplo:
#Imagine que eu tenho a seguinte lista, e precise aplicar uma função
#Exemplo de lista de dados teste<-list(2, "a", 1 , 10 , "b") teste
#Preparando um lugar para guardar os resultados saida<-list()
#Se eu tentar fazer um loop com for, ele vai parar #quando chegar a letra, porque nao da para fazer o log de caracter for( i in 1:length(teste)) { saida[i] <-log(teste[i]) }
#nesse caso o loop para e eu nao tenho a saida que desejo saida
#Mas então eu tentei usar a função try #minha ideia era que se der para calcular, calcule #senão de uma msg de erro e siga em frente pro proximo
for( i in 1:length(teste)) { saida[[i]] <-try( log(teste[[i]][1]) ) }
#agora eu tenho minha saida, com erro onde não deu para calcular, isso que eu queria saida
#o que eu queria saber se é possivel fazer o seguinte #se der certo, execute a função, senão imprima o erro que eu falar #nesse caso eu gostaria de uma saida desse tipo:
saida.exemplo<-list(0.6931472,"Verificar",0,2.302585,"Verificar") saida.exemplo
#############################################################
Esse exemplo eu peguei na função try.
Mas na verdade eu estou usando o pacote taxize (http://ropensci.github.io/taxize_/) para conferir nomes de especies, e para conferir listas grandes, as vezes para quando a conexão com a internet falha, ou o nome da especie não é encontrado, resumindo eu queria saber se existe uma forma de falar pro R, fazer isso (minha função), se der erro retorne isso (minha mensagem).
Agradeço desde ja a atenção.
-- Grato Augusto C. A. Ribas
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