Não tenho experiência com o Shiny, mas já tive a oportunidade de dar uma olhada no tutorial disponibilizado pela equipe do RStudio <http://rstudio.github.io/shiny/tutorial/#welcome> e acredito que possa ser bastante útil pra começar.

Tem um tópico para a construção das apps, abordando a estrutura 'cliente-servidor'.

<http://rstudio.github.io/shiny/tutorial/#ui-and-server>.

O showcase do Shiny também é bem interessante <http://www.rstudio.com/shiny/showcase/>.

Atte.,