Falha minha, como desinstalei a versão 2.13, tive de reinstalar os pacotes, inclusive o geoR...

Hélio

Em 2 de dezembro de 2012 17:26, Hélio Gallo Rocha <heliogallorocha@gmail.com> escreveu:
Prezados,
Como geoestatística me interessa tentei rodar o script do Elias, mas está ocorrendo o seguinte:
require(Rcitrus) ## pediu a versão 2.14 do R,

Após a instalação da versão 2.14.2 (como a 2.15.2), não carrega o geoR, dá a seguinte msg:

> require(geoR)
Carregando pacotes exigidos: geoR
Mensagens de aviso perdidas:
In library(package, lib.loc = lib.loc, character.only = TRUE, logical.return = TRUE,  :
  there is no package called ‘geoR’


Alguma idéia?

Hélio

Em 1 de dezembro de 2012 17:22, Natalia Martins <nsmbarreto@gmail.com> escreveu:

Tentei seguir sua sugestão, a qual por sinal foi muito interessante,
no entanto eu gostaria de selecionar apenas as linhas, pois na pratica o problemaa seria:
um trator passa nas ruas(linhas) do talhao (tenho a coordenada de cada linha) e quero verificar se o trator pode pular ruas(linhas) - ou seja- se a linha 1 é = a linha 2, e assim sucessivamente a ssim ver o maximo de linhas q o trator poderia pular.

Em 1 de dezembro de 2012 15:02, Elias T. Krainski <eliaskrainski@yahoo.com.br> escreveu:

Veja

sample.geodata() do pacote 'geoR' para facilitar amostragem de objetos 'geodata'
qcsamples() do pacote 'Rcitrus' (ver http://leg.ufpr.br/Rcitrus ) para fazer amostragem em lattice regular de forma aleatoria ou sistematica

Mais sobre o que qcsamples() pode auxiliar a fazer:
Suponha um talhao com R linhas e C colunas. 
comece com n pequeno
 1 - Selecione aleatóriamente n quadrats (ou pontos) desse talhão e calcule uma estatística.
 2 - Repita o procedimento anterior B vezes
 3 - guarde as B estatísticas, faça n = n+1 e volte ao passo 1. pare quando n atingir um valor razoavel
Esse procedimento termina quando é atingido o N.max ou quando a estatística "estabiliza". A "estabilização" da estatística é verificada por critério utilizado em Controle Estatístico de Qualidade.

O processo descrito acima é de seleção com reposição, que pode ser feito utilizando a função qcsamples(). Esta função implementa duas formas de seleção de quadrats (ou pontos num grid regular) com reposição.

### exemplo de uso da funcao qcsamples() com dados simulados
nr <- 30;
nc <- 20;
n <- nc*nr
dim(dados <- matrix(rnorm(n), nr, nc))

require(Rcitrus)
### amostras com quadrats 1x1
### sem reposicao e quadrats sem interseccao
### para selecao de pontos (nao de quadrats) usar dx=1 e dy=1
amr <- qcsamples(dados, dx=1, dy=1, n=20, meth='random')
ams <- qcsamples(dados, dx=1, dy=1, nr=5, nc=4, meth='sistematic')

pr <- sum(amr[,3])/sum(amr[,4])
ps <- sum(ams[,3])/sum(ams[,4])

### incidencias estimadas
pr
ps
### verdadeira
mean(dados)

### visualizacao simples
image(list(x=1:nr, y=1:nc, z=dados), asp=1)
points(amr[,1:2], col=4, pch=19)
points(ams[,1:2], col=5, pch=19)
legend("topleft", c("random", "sistematic"), pch=19, col=4:5, ncol=2, bty='n')

### outra visualizacao (adequada p situacao de quadrats)
par(mfrow=c(1,2), mar=c(3,3,1,1), mgp=c(1.5,.5,0))
### vizualizando (aleatorio)
image(list(x=1:nr, y=1:nc, z=dados))
apply(amr, 1, function(x) {
  mx <- cbind(c(x[1] + c(-.5,0.5,0.5,-.5,-.5)),
              c(x[2] + c(-.5,-.5,0.5,0.5,-.5)))
  polygon(mx)
})

### vizualizando (sistematico)
image(list(x=1:nr, y=1:nc, z=dados))
apply(ams, 1, function(x) {
  mx <- cbind(c(x[1] + c(-.5,.5,.5,-.5,-.5)),
              c(x[2] + c(-.5,-.5,.5,.5,-.5)))
  polygon(mx)
})

Att.
Elias T. Krainski

De: Natalia Martins <nsmbarreto@gmail.com>
Para: Lista R <R-br@listas.c3sl.ufpr.br>
Enviadas: Sábado, 1 de Dezembro de 2012 9:57
Assunto: [R-br] geoestatistica

Prezados bom dia,
estou cursando uma disciplina de amostragem e tenho como tema de seminario a aplicação de amostragem em geoestatistica.
Para este estudo tenho as "linhas" que um trator passa em um talhao e o objetivo é verificar a cada quantas linhas o trator pode passar sem que haja prejuízo nas analises de solo.
Acredito ser uma amostragem sistematica na qual devo ir variando os K's e verificando até qual K os resultados sejam iguais quando considero todas as linhas.
No entanto no momento de fazer a análise geoestatistica na linha não estou conseguindo.
Gostaria de ajuda.

Estrutura dos dados

LONG LAT                    NDRE              NDVI       linha 
-48.0149775 -21.3646713 0.171400000 0.435000000 1
.
.
.

-48.0149775 -21.3646713 0.171400000 0.435000000 63 

Abraços 

Natália da Silva Martins
Bacharel em Estatística - Universidade Estadual de Maringá/ UEM
Mestranda em Estatística e Experimentação Agronômica - ESALQ/ USP
Contato: (19) 8306-4743
 


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