ops, esse ja ta obsoleto sudo apt-get install libtiff5-dev:i386 libtiff5-dev o apt fala que esses dois substituem o anterior que tinha falado. Em 30 de maio de 2015 09:36, Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> escreveu:
sudo apt-get install libtiff4-dev
Em 30 de maio de 2015 09:32, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
Continua reclamando da tiff, alguma sugestão?
..........................................................
tentando a URL ' http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz ' Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB) ================================================== downloaded 3.9 MB
* installing *source* package ‘tiff’ ... ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c common.c -o common.o In file included from common.c:1:0: common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <tiff.h> ^ compilation terminated. make: ** [common.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘tiff’ * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’ ERROR: dependency ‘tiff’ is not available for package ‘EBImage’ * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
André Oliveira Souza.
Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Sábado, 30 de Maio de 2015 9:18, Augusto Ribas <ribas.aca@gmail.com> escreveu:
Opa, ele está reclamando que não tem todas as livrarias que precisa para compitar.
Ta faltando do ffw3h.h
Ta usando linux certo?
No ubuntu, abra um terminal e instale os pacotes necessários com apt-get
sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config
depois tenta instalar denovo que vai funcionar.
Em 30 de maio de 2015 07:48, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
Pois é o erro que ocorre ..mas consegui identificar com clareza os motivos!
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), ?biocLite for help biocLite("EBImage") BioC_mirror: http://bioconductor.org Using Bioconductor version 3.1 (BiocInstaller 1.18.2), R version 3.2.0. Installing package(s) ‘EBImage’ also installing the dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’
tentando a URL 'http://cran.rstudio.com/src/contrib/tiff_0.1-5.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 28925 bytes (28 KB) ================================================== downloaded 28 KB
tentando a URL ' http://cran.rstudio.com/src/contrib/fftwtools_0.9-7.tar.gz' Content type 'application/x-gzip' length 145998 bytes (142 KB) ================================================== downloaded 142 KB
tentando a URL ' http://bioconductor.org/packages/3.1/bioc/src/contrib/EBImage_4.10.0.tar.gz ' Content type 'application/x-gzip' length 4114806 bytes (3.9 MB) ================================================== downloaded 3.9 MB
* installing *source* package ‘tiff’ ... ** package ‘tiff’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c common.c -o common.o In file included from common.c:1:0: common.h:5:18: fatal error: tiff.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include <tiff.h> ^ compilation terminated. make: ** [common.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘tiff’ * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/tiff’ * installing *source* package ‘fftwtools’ ... ** package ‘fftwtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked ** libs gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fstack-protector --param=ssp-buffer-size=4 -Wformat -Werror=format-security -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c fftwtools.c -o fftwtools.o fftwtools.c:28:18: fatal error: fftw3.h: Arquivo ou diretório não encontrado #include<fftw3.h> ^ compilation terminated. make: ** [fftwtools.o] Erro 1 ERROR: compilation failed for package ‘fftwtools’ * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/fftwtools’ ERROR: dependencies ‘tiff’, ‘fftwtools’ are not available for package ‘EBImage’ * removing ‘/home/andre/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.2/EBImage’
The downloaded source packages are in ‘/tmp/RtmpDc7Umf/downloaded_packages’ Old packages: 'car', 'tcltk2', 'MASS', 'spatial' Update all/some/none? [a/s/n]:
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Graduação em Matemática, mestrado em estatística aplicada.Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Espirito Santo. IFES
Em Sexta-feira, 29 de Maio de 2015 21:03, Augusto Ribas < ribas.aca@gmail.com> escreveu:
O pacote é do biocondutor, você tentou instalar pela função biocLite?
#################################################### source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("EBImage")
Em 29 de maio de 2015 18:54, Andre Oliveira <andreolsouza@yahoo.com.br> escreveu:
Boa noite, existe alguma forma de fazer o cálculo da área da folha de uma árvore no R? Tentei esta dica abaixo, mas não achei o pacote referido!
https://ridiculas.wordpress.com/page/2/
André Oliveira Souza.
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