Recomendo proceder da seguinte forma para testar o efeito de sistema sobre a curva ajustada, ou seja, se as curvas são iguais independente dos níveis do fator sistema. O teste usado abaixo é o de razão de verossimilhanças. Eu desconheço a teoria que sustenta o teste de Vuong que você mencinou, mas não me parece correto porque você está usando dados diferentes e ajustando o mesmo modelo. Eu creio que ele seja recomendado para avaliar a igualdade de dois modelos aplicados ao mesmo conjunto dados. Segue CMR.
library(nlme)
n0 <- gnls(diversidade ~ a * parA^b,
data = dados.ajuste,
params = a + b ~ 1,
start = list(50, -1))
summary(n0)
n1 <- gnls(diversidade ~ a * parA^b,
data = dados.ajuste,
params = a + b ~ sistema,
start = list(50, 0, -1, 0))
summary(n1)
# LRT.
anova(n0, n1)
anova(n1, test = "marginal")
À disposição.
Walmes.