Rodrigo,

Seria equivalente sim. O uso do "%in%" tem sido abandonado, usa-se o "/" no lugar. Na formula "y~fator1/fator2", quer dizer que os níveis de fator2 estão aninhados dentro do fator1. Mas não há necessiddade de ter fatores com níveis aninhados para usar essa fórmula, pode-se usá-la com fatores completamente cruzados. Isso é o que fazemos quando queremos desdobrar a interação. O que ela faz é montar uma nova matriz de incidência para os efeitos, e portanto muda sua interpretação. Para ver isso é só pedir model.matrix() do modelo sob duas diferentes fórmulas e observar os nomes das colunas e valores que incidem em cada linha. As diferentes opções para contraste (contr.treatment, contr.helmert, contr.sum, contr.poly, ...) também modificam as interpretação dos coeficientes pois uma restrição diferente é imposta.

da <- expand.grid(f1=gl(2,2), f2=gl(2,1))
da$y <- rnorm(nrow(da))

m0 <- lm(y~f1*f2, da) # níveis completamente cruzados
model.matrix(m0)

m1 <- lm(y~f1/f2, da) # níveis aninhados
model.matrix(m1)

m2 <- lm(y~f1*f2, da,                 # níveis completamente cruzados
         contrast=list(f1=contr.sum)) # contraste soma efeitos = zero
model.matrix(m2)

À disposição.
Walmes.

==========================================================================
Walmes Marques Zeviani
LEG (Laboratório de Estatística e Geoinformação, 25.450418 S, 49.231759 W)
Departamento de Estatística - Universidade Federal do Paraná
fone: (+55) 41 3361 3573
VoIP: (3361 3600) 1053 1173
e-mail: walmes@ufpr.br
twitter: @walmeszeviani
homepage: http://www.leg.ufpr.br/~walmes
linux user number: 531218
==========================================================================